Моделирование больших биомолекул и биомолекулярных систем с использованием графического процессора

Моделирование больших биомолекул и биомолекулярных систем с использованием графического процессора

Автор: Жмуров, Артём Андреевич

Количество страниц: 123 с. ил.

Артикул: 5103604

Автор: Жмуров, Артём Андреевич

Шифр специальности: 05.13.18

Научная степень: Кандидатская

Год защиты: 2011

Место защиты: Москва

Стоимость: 250 руб.

Моделирование больших биомолекул и биомолекулярных систем с использованием графического процессора  Моделирование больших биомолекул и биомолекулярных систем с использованием графического процессора 

Молекулярное моделирование
Моделирование в полноатомном разрешении
Упрощнные модели биомолекул
Модель самоорганизующегося полимера
Графические процессоры ГП
Вычисления общего характера при помощи графических процессоров .
Программная модель А
Подходы к оптимизации
Моделирование по принципам динамики Ланжевена на ГП
Реализация расчта сил
Распараллеливание по частицам
Распараллеливание по парам взаимодействующих частиц
Интегрирование уравнений движения
Подход много запусков на ГП
Тестирование программы
Точность численного интегрирования
Измерение производительности
Генераторы случайных чисел
Генераторы псевдослучайных чисел
Обзор
Линейный конгруэнтный генератор
Алгоритм 2
Алгоритм гибридный Таус
Алгоритм Фибоначчи с запаздыванием
Реализация , 2, гибридного Тауса и алгоритма Фибоначчи с
запаздыванием на ГП
Основные идеи
Подход одинГСЧнапоток
Подход одинГСЧнавсепотоки
Тест на случайность процесс Орнстейна Уленбека
Силовая денатурация белка фибриноген и его фрагментов
Результаты экспериментов Атомной Силовой Микроскопии .
Молекулярное моделирование
Структурные модели
Параметризация модели
Результаты молекулярного моделирования
Выводы
Силовая индентация капсиды вируса НК
Молекулярное моделирование
Результаты моделирования
Выводы
Заключение
Список литературы


Вычисления общего характера при помощи графических процессоров . Результаты экспериментов Атомной Силовой Микроскопии . СИАГШМ , , ИАМБ , и Сгошас. I ix . Ланжевена. С и . ГП. ГП. ОКМД Одиночный ноток Команд, Множественный поток Данных англ. ГП, такие как , , и др. Полимера англ. ГП. НК. Атомная Силовая Микроскопия, для реализации была выбрана модель . НК. ГП. НК. ЯМР. ДЛ.

Рекомендуемые диссертации данного раздела

04.07.2017

Лето - пора делать собственную диссертацию!

Здравствуйте! Дорогие коллеги, предлагаем Вам объединить отдых и научные исследования. К примеру Вы можете приобрести на нашем сайте 15 ...

28.06.2016

+ 100 бесплатных диссертаций

Дорогие друзья, в раздел "Бесплатные диссертации" добавлено 100 новых диссертаций. Желаем новых научных ...


Все новости

Время генерации: 0.239, запросов: 242