Ревизия рода Paramecium O. F. Műller, 1773 : Сравнительно-биологический анализ, систематика и филогенетические связи

• Автор: Фокин, Сергей Иванович
• Шифр специальности: 03.00.33
• Научная степень: Докторская
• Год защиты: 2002
• Место защиты: Санкт-Петербург
• Количество страниц: 356 с. : ил

Введение

Глава I. Материал и методы

1.1. Места сбора живого материала.

1.2. Сбор материала и его культивирование в лаборатории

1.3. Прижизненный анализ материала и экспериментальные методы.

1.4. Анализ фиксированного материала.

1.4.1. Светооптические методы

1.4.2. Электронная микроскопия.

1.4.3. Молекулярнобиологические методы

1.4.4. Математическая обработка

1.5. Список полученных сиквенсов гена рРНК.

1.6. Места выполнения работы.
Глава II. Сравнительное изучение некоторых морфологических признаков клетки инфузорий рода i.
II. 1. Морфология сократительных вакуолей
И. 1.1. . i
И. 1.2. . i
И.1.3. . i
II. 1.4. . i
II.1.5. . ii
II. 1.6. . ii.
II. 1.7. . .
II. 1.8. . .
И. 1.9. . i комплекс
II. 1 . ii.
II.1 . ii
II. 1 . ii
.1 . ii
. 1 Обсуждение.
.2. Морфологические типы микронуклеусов
.2.1. Р. Ьигзапа.
.2.2. Р. рШгтит
.2.3. Р. 1иЬосс1Ш
.2.4. Р. мюосги1.
.2.5. Р. перкпсИаШт
.2.6. Р. сак1т1.
Н.2.7. Р. ро1усагуит.
Н.2.8. Р. сагиНаШт.
Н.2.9. Р. аигеПа комплекс
.2 Р. тиМткгопиЫеаШт.
.2 .ii.
Н.2 Р. яскешакоА
.2 Р. ЬгавШапит
И.З. Математический анализ сходства типов сократительных вакуолей и микронуклеусов у разных парамеций
II. 4. Обсуждение
.5. Организация переходной зоны ресничек.
.5.1. Переходная зона ресничек РешсиПа.
.5.2. Обсуждение
.6. Кортикальная конституция парамеций по данным морфометрии.
II .6.1. Р. Ьипапа.
П.6.2. Р. риЪтит
.6.3. Р.
Н.6.4. Р. vi
Н.6.5.Р. перИг1сИаШт.
.6.6. Р. са1Ыт1
.6.7. Р. ро1усагуит
.6.8. . ii.
.6.9. . i
.6 . i
.6 . ii
.6 . ii
.6 . .
.6 . ii
.6 . ii
II.7. Математический анализ сходства кортикальной конституции
у разных парамеций.
И.8. Обсуждение
Глава III. Сравнительное изучение некоторых биологических особенностей видов рода i.
III. 1. Вращение при плавании
III. 1.1. Результаты экспериментов.
III. 1.2. Обсуждение.
1.2. Устойчивость к изменению солености
III.2.1 .Результаты экспериментов
1П.2.2. Обсуждение.
1.3. Естественные бактериальные эндоцитобионты.
П1.3.1.Р. i.
1.3.2. . i.
1.3.3. . i
1.3.4. . ii.
1.3.5. . ii.
1.3.6. Комплекс .i
1.3.7. . .
1.3.8. . ii.
III.4. Экспериментальный анализ хозяинной специфичности бактерий
рода Ноотрога
Ш.4.1. Р. Ьипапа
III.4.2. Р. риМпит
1 Р. сЫЬоьсцш
II 1.4.4. Р. перЫсИаШт
1.4.5. Р. саШт.
1.4.6. Рлооспф.
1. 4.7. Р. ро 1усагуит
1.4.8. Комплекс Р. ашеНа
Ш.4.9. Р.енши.
Ш.4 Р. саис1аШт.
Ш.4 Р. тиРШсгопиЫеаШт.
Ш.4 Р. 8сНемшко.
III .4 Р. ЬгазШапит.
Ш.5. Математический анализ сходства парамеций но изученным морфобиологическим признакам.
Ш.6. Коинфекция как путь расширения разнообразия бактериальных
эндоцитобионтов парамеций.
Ш.6.1. Результаты экспериментов.
Ш.6.2. Обсуждение.
1.1. Стратегии выживания эндобионтов в жизненном цикле
разных парамеций
Щ.7.1. Путь выведения из клетки парамеций некоторых холоспор во
внешнюю среду.
Ш.7.2. Стратегии макронуклеарных бактерий при половом процессе
парамецийхозяев.
Ш.7.2.1. Р. саисЬШт.
Ш.7.2.2. Р. ЫаигеНа.
Ш.7.2.3. Р. сЬлЬоясдш
III.7.3. Обсуждение.
Глава IV. Вегетативные функции микронуклеуса у различных парамеций и взаимодействие элементов их ядерного аппарата
IV. 1. . i
IV.2. . .
IV.3. . i.
IV.4. Обсуждение.
Глава V. Особенности ядерной реорганизации у i в ходе полового процесса и его возможная эволюция
V Экспериментальные данные и анализ литературы
V. 1.1. . i
V.1.2. . i.
V.1.3. . i
V. 1.4. . i.
V5. . ii.I
V.1.6. . i .
V. 1.7. . .
V.1.8.Комплекс . i
V Л.9.Р. ii.
V. 1 . ii
V .1 . ii
V.1. .
V. 1. ii.
V.1 .ii
V.2. Математический анализ сходства процесса ядерной реорганизации у разных парамеций.В
V.3. Обсуждение.
Глава VI. Филогенетические связи в подклассе ii по результатам сравнения последовательности нуклеотидов гена рРНК и видовой паттерн ДНК некоторых представителей i.
VI. 1. Анализ видовых паттернов ДНК некоторых парамеций
VIЛ .1. . i
VI.1.2. . ii.
VI. 1.3. . ii
VI. 1 ii.
VI.2. Сравнительный анализ последовательности нуклеотидов гена малой субъединицы рРНК
VI.2.1. Сравнительный анализ первичной структуры гена рРНК. Общая топология подкласса ii.
VI.2.2. Сравнительный анализ первичной структуры гена рРНК. Филогения i
VI.2.3. Сравнение структуры зоны ix СМ гена рРНК у пеникулин и других i
VI.2.4. Филогенетическая позиция . i и . ii
VI.3. Обсуждение
Глава VII. Критический анализ видового состава рода i
VII. 1. i О. . , .
VII. 1.1. i i , ,
VII. 1.2. ii , .
VII. 1.3. i i , .
VII. 1.4. i ii ,
VII. 1.5. i i i,
V.1.6. i ii i, .
VII. .7. i ,
VII. 1.8. i i . . , комплекс видов,
, .
VII. 1.9. i , .
VII. 1 i ii i, .
VII. i ii i ,
VII.2. Эндемичные виды парамеций.
VII.2.1. . i , .
VII.2.2. i ii , .
VI1.2.3. i ii ,
VI1.2.4. i , .
VII.2.5. i ii , .
VII.2.6. i ii v. .
VII.2.7. i ii v.
VII.3. Виды с сомнительной валидностью.
VII.3.1. . ii ,
VII.3.2. . ii ,
VI1.3.3. . i ,
VII.3.4. .i ,
VI1.3.5. . i ,
VII.3.6. . i, .
VII.3.7. . ii ,
VII.3.8. . i i, .
VII.3.9. i i iv,
VII.4. Обсуждение
Заключение.
Выводы.
Список литературы


Выводной проток короткий, часто усеченноконусовидной формы, открывающийся порой на поверхности пелликулы между кинетами. Комплекс СВ этой парамеции не исследовался с момента ее описания ii, , . Исследовано 0 5 клеток трех клонов Табл. Комплекс СВ у этой парамеции типичен для подгруппы i и включает в себя приводящих каналов наиболее часто 7. СВ всегда две. ПСВ одиночные, но нередко встречаются СВ с двумя порами до . Выводной проток короткий, часто усеченноконусовидной формы, открывающийся на поверхности пелликулы между кинетами. К настоящему времени известна лишь одна популяция этого вида Шанхай, Китай, поэтому говорить о стабильности признаков, связанных с СВ у этой парамеции, на наш взгляд, преждевременно. Исследовано 7 СВ клеток трех клонов Табл. СВ обычно две, ПСВ одиночные. Выводной проток короткий, часто усеченноконусовидной формы, открывающийся на поверхности пелликулы между кинетами. К настоящему времени известна лишь одна популяция этого вида Порт Алегри, Бразилия, поэтому говорить о стабильности признаков, связанных с СВ у этой парамеции, на наш взгляд, преждевременно. Обсуждение. Полученные нами результаты и анализ литературных источников позволяют использовать морфологию СВ как важный признак для определения ряда парамеций. В некоторых случаях признаки, связанные с СВ, позволяют дискриминировать виды парамеций, даже не прибегая к дополнительным кариологическим исследованиям. Сходная организация комплекса СВ у представителей подгруппы i не позволяет основываться при определении только на морфологии СВ. Однако 6 видов, использованных в нашем исследовании, среди них все эвригалинные подгруппа , могут быть уверенно определены с учетом лишь строения их СВ. Сравнительный анализ органелл осморегуляции у морфовидов рода позволил выделить 3 основных типа организации СВ у парамеций разнообразие, не встречающееся ни в одной другой группе инфузорий такого ранга. Три вида рода, расположенные в основании филогенетического древа, построенного по данным анализа рРНК см. VI . Рис. Так, у . Для этого типа характерно наличие системы приводящих каналов с постоянной топографией число каналов в ряде случаен видоспецифично и центральной ампулы, соединяющейся с поверхностью кортекса одним или несколькими для . СВ . Выделительный канал, соединяющий основную ампулу с поверхностью кортекса, необычайно длинный до мкм и извитой. У Р. СВ представляет собой промежуточный тип организации этой органеллы приводящие каналы отсутствуют и их функцию выполняет значительное число мелких пульсирующих вакуолей, содержимое которых вливается в центральную ампулу. Последняя, однако, располагается, как и у большинства кроме . ПСВ микротубуляр ын лет, при имающин, очевид о, участие в сокраще ии этой составляющей СВ. Таким обратом, предложе ая Я ковским подгруппа i Р. Р. i а ос ова ии орга изации СВ е может быть выделе а. Р. i, ос овываясь а з ачитель ом различии морфологии орга слл осморегуляции, очевид о, е может быть включеа в состав подгруппы i, . Отсутствие приводящий ка алов в СВ Р. Р. i сближает эти виды, нотя расположе ие СВ и соответстве о дли а вывод ого протока у ин различ ы. В то же время подгруппа i представляет собой от оситель о типа СВ пол остью гомоге ое обратова ие. А ализ собстве ын материалов по орга изации СВ у представителей другого рода пе икули i и литератур ын да ын по родам i, i и i , vi, i, . Правда, раз ообразие этой орга еллы в другин родан пс икули помимо i е столь з ачитель о. И терес о, что среди i есть виды, СВ которын апоми ают тип этин орга елл у Р. Р. i. В то же время, СВ Р. Столь существе ые различия в орга изации СВ у Р. Р. i и Р. VI подтверждают длитель ый процесс диверге ции этин видов и, следователь о, говорят в пользу ин от оситель ой древ ости. Определе ое снолство в строе ии оргаелл осморегуляции у Р. Р. i позволяет предположить ин более близкое родство, чем этин двун видов с Р. Морфология ге ератив ын ядер у парамеций издав а служила адеж ым нризаком для ии идетификации , vvi, i, и др Морфологическому раз ообразию Ми и ин классификации у парамеций, од ако, исследователи долгое время е уделяли достаточ ого в има ия.