Экспрессия ParaHox-генов в онтогенезе полихеты Nereis virens (Annelida, Polychaeta)

• Автор: Кулакова, Милана Анатольевна
• Шифр специальности: 03.00.30
• Научная степень: Кандидатская
• Год защиты: 2008
• Место защиты: Санкт-Петербург
• Количество страниц: 151 с. : ил.

СОДЕРЖАНИЕ
Введение.

Обзор литературы

1. История вопроса

2. Гены, содержащие гомеобокс и их структурная эволюция

2.1. Структура гомеобокса и гомеодомена

2.2. Классификация суперссмейства гомеобоксных генов.

2.3. Кластерные гены ЛМТРкласса.

2.3.1. ЯЛГкластер.

2.3.2. Яохкластер.

2.3.3. РагаНохкластер.

2.3.4. xкластер
2.4. Взгляды на молекулярную филогению кластеров класса .
3. Функциональная значимость кластерных генов класса
для эволюции ii
3.1. Гены ЛХкластера и их функции
3.2. Гены Яохкластера и их функции
3.2.1. 7охгены вторичноротых i.
3.2.2. Нохгены первичноротых i
3.2.2.1. Яохгены
3.2.2.2. Яохгены .
3.3. Гены РагаНохкластера и их функции
3.3.1. РагаНохгены вторичноротых i
3.3.1.1. Иглокожие.
3.3.1.2. Хордовые
3.3.2. РагаНохгены первичноротых i
3.3.2.1. РагаНохгены
3.3.2.2. РагаНохгены .
3.3.2.2.1. Моллюски
3.3.2.2.2. Кольчатые черви.
4. Основные эгапы онтогенеза нереидных полихет.
4.1. Дробление.
4.2. Гасгруляция.
4.3. Органогенез.
4.4. Постларвальный рост.
Материалы н методы.
1. Поиск и клонирование фрагментов РагаНохгеноъ.
2. Характеристики рекомбинантной плазмиды Т V
3. Анализ экспрессии vix.
3.1. Принцип метода гибридизации i i с применением РПКзоида.,
3.2. Подготовка матрицы для синтеза РНКзонда
3.3. Синтез Iмеченого РНКзонда.
3.4. Сбор личинок и ювенильных червей
3.5. Фиксация материала
3.6. Гибрндизация i i на тотальных препаратах I
4. Гистологическая окраска для анализа морфологии объекта
5. Рабочие растворы и реагенты.
Результаты.
1. Характерис гики некоторых этапов онтогенеза i vi
1.1. Гаструляция
1.2. Органогенез
1.3. Постларвальный рост
2. Экспрессия vixнов
2.1. Осевая экспрессия vixiнов.
2.1.1. Экспрессия vixгенов в формирующихся ганглиях
вентрального нервного ствола
2.1.2. Экспрессия vixгенов в пищеварительном тракте
2.2. Экспрессия viоНохгснов, не связанная с аксиальной спецификацией
2.2.1. Экспрессия vi.
2.2.1.1. Экспрессия в простомиуме.
2.2.1.2. Экспрессия в дефинитивной кишке
2.2.2. Экспрессия viXx
2.2.3. Экспрессия vi.
2.2.3.1. Ранняя фаза ларвальной экспрессии
2.2.3.2. Промежуточная фаза ларвальной экспрессии.
2.2.3.3. Поздняя фаза ларвальной экспрессии.
2.2.3.4. Постларвальная экспрессия
Обсуждение результатов
1. Осевая экспрессия vixгенов
1.1. Аспекты временной экспрессии vixгенов.
1.2. Пространственная колинсарность экспрессии vixгенов
1.2.1. Экспрессия vixгенов в нейроэктодерме
1.2.2. Экспрессия vix в пищеварительном тракте.
2. Экспрессия vixгенов, не связанная с осевой спецификацией
2.1. Экспрессия x в головном мозге
2.2. Эмбриональная фаза экспрессии vi.
2.3. Экспрессия vi в зоне роста.
3. Различия в ларвальной и постларвальной экспрессии viРага Нох ген о в
Заключение
Приложение 1.
Приложение 2.
Литература


4ii, которые, в свою очередь, подразделяются на брахиоподы, немертины, аннелиды, моллюски, плоские черви и др. артроподы, онихофоры, нематоды, приапулиды и др. . Сами термины и , не нашли пока синонимов в русском языке. Термин происходит от греческого слова i линька, поскольку все представители ветви животные линяющие, покрытые жсткой кутикулой. Их рост сопровождается периодическими линьками, когда старые покровы сбрасываются, и животное быстро растт, или, скорее, расправляется пока новые покровы не отвердели. Рис. Новая молекулярная филогения ii. В ii i Р i . В красной рамке полный набор комплемент Нохггенов . i vi из . Термин произошл от двух других зоологических терминов и . группа животных, которая неожиданным образом вошла в состав i, а раньше рассматривалась как самостоятельная группа, у которой был недавний общий предок с вторичноротыми животными. ресничная сферическая личинка, характерная для большинства . Эта новая молекулярная филогения, совпала с выстроенной ранее, но не принятой всерьез филогенией по рДНК i . ДНК . Сравнительный анализ последовательностей Нохгенов свидетельствовал, что общий предок билатеральных животных, находящийся в основании этих трех эволюционных ветвей, уже обладал, по меньшей мерс, семью vгенами . РагаНохгеиши iii . Как выглядел этот общий предок, какие процессы вели к его возникновению и чем вызвана беспрецедентная радиация его потомков вопросы, составляющие парадигму современной науки об эволюции . За последние пять лет, механизмы, лежащие в основе морфологической эволюции, стали в значительной степени понятны. Появились замечательные экспериментальные подходы, позволяющие тонко настраивать работу интересующего гена, выключать его в нужный момент развития или стимулировать его эктопическую экспрессию. Появились новые модельные объекты такие, как представители эволюционной ветви моллюски, полихеты, плоские черви, которые, в отличие от традиционных дрозофила, нематода, мышь менее специализированы, а потому более ценны для понимания анцестральных функций ключевых генов развития. Вероятно, благодаря молекулярногенетическим исследованиям этой группы животных, в ближайшее десятилетие основополагающие этапы морфологической эволюции ii, будут доступны для теоретической реконструкции на молекулярном, то есть базовом, уровне. Гомеобокссодержащие гены кодируют белковые регуляторные факторы, осуществляющие контроль над экспрессией генов мишеней, за счет связывания с iрегуляторными сайтами последних. Общая структурная черта всех представителей суперсемейства гомеобоксных генов наличие гомеобокса, который представляет собой 0ти нуклеотидную последовательность, кодирующую белковый ДНКсвязывающий домен гомеодомен. Сконце им перпендикулярна рис. Распознающая спираль третья. ДНК. Минимальный сайт для посадки гомеодоменного белка представляет собой короткую последовательность ТААТ. Тонкая специфика в распознании регуляторной зоны реализуется за счет соседних областей гомеодоменного белка. Как большинство других транскрипционных факторов, эти белки работают с кофакторами. Классические примеры таких взаимодействий описаны для Яодггенов дрозофилы. Известно, что xi x гомеодоменный фактор из класса см. Показано, что взаимодействие с x обеспечивает верную спецификационную функцию x в первом абдоминальном А1 сегменте мухи. В отсутствии x, сегмент специфицировался по типу 3 , i, . , приводит к появлению различий между лабиальным и первым торакальным сегментом ,. . У позвоночных, гомолог x x, кофактор Нохбслков из 1 паралогичных групп см. Рис. Схема гомеодомена. Цилиндрами обозначены аспирали iресурс.