Выживаемость патогенных бактерий в почвах : на примере Coxiella burnetii и амебо-резистентных бактерий

• Автор: Евстигнеева, Анна Сергеевна
• Шифр специальности: 03.00.27, 03.00.07
• Научная степень: Кандидатская
• Год защиты: 2007
• Место защиты: Москва
• Количество страниц: 102 с. : ил.

ОГЛАВЛЕНИЕ
ВВЕДЕНИЕ 5

ГЛАВА 1. ПОЧВА КАК БИОТОП ДЛЯ ВЫЖИВАНИЯ

ПАТОГЕННЫХ БАКТЕРИЙ

1.1. Роль почвы в возникновении эпидемий

1.2. Патогенные бактерии, обнаруживаемые в почвах

1.3. Факторы, определяющие выживаемость патогенных микроорганизмов в почвах

1.4. xi ii и лихорадка

1.5. Свободноживущие амебы и потенциально патогенные микроорганизмы

ГЛАВА 2. ОБЪЕКТЫ И МЕТОДЫ ИССЛЕДОВАНИЯ

2.1. Структура исследования модель экспериментов

2.1.1. Определение выживаемости xi ii в почвах
2.1.2. Обнаружение амеборезистентных бактерий АРБ в почвах
2.2. Объекты исследования
2.2.1. Почвы, используемые для определения выживаемости xi ii
2.2.2. Почвы, используемые для обнаружения АРБ
2.3. Методы исследования
2.3.1. Методика почвенных исследований
2.3.2. Иммунофлуоресцентный анализ
2.3.3. Сокультура амеб
2.3.3.1. Подготовка образцов. Российская и французская методики
2.3.3.2. Инокуляция образцов в культуру амеб
23. Наблюдение за сокультурой
2.3.3.4. Выделение и морфологическая идентификация
штаммов
.3.5. Цитопатогенный эффект
2.3.3.6. Клонирование
2.3.3.7. Молекулярная идентификация изолятов
ГЛАВА 3. ВЫЖИВАЕМОСТЬ XI II
В ПОЧВАХ
3.1. Выживаемость С. ii в почвах различных типов
3.2. Влияние свойств почв на выживаемость С. ii
ГЛАВА 4. ИСПОЛЬЗОВАНИЕ АМЕБ ДЛЯ
ОБНАРУЖЕНИЯ ПОТЕНЦИАЛЬНО ПАТОГЕННЫХ БАКТЕРИЙ В ПОЧВАХ
4.1. Разнообразие амеборезистентных бактерий АРБ в почвах
4.2. Лизис амеб и цитопатогенные свойства изолятов
4.3. Идентификация изолятов
4.4. Выделение нового вида
4.5. Удельная поверхность почвы и адгезия бактерий сравнение методик
ГЛАВА 5. ОСОБЕННОСТИ ВЫЖИВАНИЯ
ПАТОГЕННЫХ БАКТЕРИЙ В ПОЧВАХ ОБСУЖДЕНИЕ РЕЗУЛЬТАТОВ
ЗАКЛЮЧЕНИЕ
ВЫВОДЫ
СПИСОК ЛИТЕРАТУРЫ


ГЛАВА 1. ГЛАВА 2. Подготовка образцов. ГЛАВА 3. Выживаемость С. Влияние свойств почв на выживаемость С. ГЛАВА 4. ГЛАВА 5. Теоретическая предпосылка настоящей работы проблема сохранения в разных почвах патогенных микроорганизмов. Естественные почвы обычно обладают самоочищающей способностью Мишустин и др. Она определяется комплексом почвенных свойств, препятствующих сохранению в почвах большинства возбудителей болезней. Однако современное техногенное воздействие на почву приводит к быстрому расширению спектра патогенных агентов человека, выживающих в объектах окружающей среды. Создание таких условий заложено в самом техническОхМ прогрессе, когда появляются многочисленные разнообразные новые местообитания и экологические ниши, весьма благоприятные для потенциально патогенных микроорганизмов на фоне неуклонного снижения иммунных барьеров человека Литвин и др. Для оценки патогенной опасности почвенных объектов важно, чтобы используемый метод позволял провести быстрый и точный скрининг почвы на наличие потенциально патогенных микроорганизмов. Когда речь идет об уменьшении риска заболевания человека, именно быстрота обнаружения и точность определения патогена выходят на первый план. Определить выживаемость патогенных бактерий в почвах различных типов на примере xi ii и амеборезистентных бактерий и изучить влияние свойств почв на выживаемость патогенных микроорганизмов. Определить выживаемость С. Оценить динамику количества С. Выделить амсборезистентные бактерии АРБ из почвенных и песчаных объектов, расположенных в местах частого и массового пребывания людей. Дать характеристику выделенным АРБ методом построения филогенетического дерева. Выявить почвенные свойства, влияющие на выживаемость патогенных бактерий в почве. Провести оценку применимости метода амебного сокультивирования для скрининга почв на наличие амеборезистентных бактерий. Патогенные бактерии С. АРБ выживают сохраняют жизнеспособность в почвенной среде, в почвах разных типов в течение длительного времени. Выживаемость патогенных бактерий С. АРБ в почвах связана обратной зависимостью с активностью органоминеральной матрицы при уменьшении содержания органического вещества черноземы, С и удельной поверхности почв городские почвы выживаемость увеличивается. Метод амебного сокультивирования позволяет выявлять наличие в почвах потенциально патогенных бактерий и обнаруживать новые виды. Проведенное исследование позволило выделить из почвенных и песчаных объектов, расположенных в местах частого и массового пребывания людей, вида потенциально патогенных бактерий, многие из которых ранее не выделяли из почвенной среды. Обнаружены 4 потенциальных представителя новых видовродов типирование по гену , сходство , а также новый вид рода ii секвенирование всего гена гроВ, сходство . . Впервые определена выживаемость патогенной упротеобактсрии С. Установлено, что из всех почвенных свойств наибольшее ингибирующее влияние на выживаемость С. С. ii в черноземе при С уменьшается при увеличении содержания органического углерода. Показано, что у коксиеллы существует широкий диапазон экологической толерантности по отношению к температуре почвы от до С, при этом количество сохранившихся в почве коксиелл увеличивается с уменьшением температуры независимо от типа почвы, а при температуре исследуемых почв С имеет место консервация С. Впервые для скрининга почв на наличие потенциально патогенных бактерий использован метод амебного сокультивирования, который, как показало данное исследование, также позволяет каталогизировать почвенные микроорганизмы и выявлять новые видыроды бактерий в почвенной среде.