Разнообразие микроорганизмов в различных по экологическим условиям осадках оз. Байкал

• Автор: Черницына, Светлана Михайловна
• Шифр специальности: 03.00.16
• Научная степень: Кандидатская
• Год защиты: 2007
• Место защиты: Иркутск
• Количество страниц: 146 с. : ил.

ОГЛАВЛЕНИЕ
ВВЕДЕНИЕ

Глава 1. ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ

1.1. Характеристика озера Байкал

1.2. Экологические факторы, определяющие развитие

микроорганизмов в определенных районах озера

1.3. Физикохимическая характеристика донных осадков озера

Байкал и поровых вод

1.4. Органическое вещество донных осадков озера Байкал

1.5. История микробиологических исследований донных осадков

озера Байкал

1.6. Численность микроорганизмов донных осадков озера Байкал
1.7. Разнообразие микроорганизмов донных осадков озера Байкал
1.8. Исследование структуры микробных сообществ методами
молекулярной биологии
1.9. Биоразнообразие бесцветных серных бактерий
Глава 2. ОБЪЕКТЫ И МЕТОДЫ ИССЛЕДОВАНИЙ
2.1. Объекты исследования и методы отбора проб
2.2. Методы выделения суммарной бактериальной ДНК
2.3. Методы молекулярной микробиологии
Глава 3. РЕЗУЛЬТАТЫ ИССЛЕДОВАНИЯ И ИХ ОБСУЖДЕНИЕ
3.1. Сравнение стратегий методов выделения суммарной бактериальной ДНК из донных осадков озера Байкал
3.2. Анализ таксономического состава поверхностных и
глубинных слоев донных осадков Посольской банки
3.2.1. Филогенетическое разнообразие микроорганизмов
поверхностного слоя осадков станции Посольская банка
3.2.2. Филогенетическое разнообразие микроорганизмов глубинного слоя осадков станции Посольская банка
3.3. Исследование микробного сообщества бесцветных серных
бактерий
3.3.1. Распространение и морфология бесцветных серобактерий
3.3.2. Филогенетическое положение байкальской бактерии рода Шороса
3.3.3. Сопутствующее микробное сообщество бактерии рода ТЫор1оса
3.3.4. Филогенетическое положение серной бактерии рода ТкШИгос ЗАКЛЮЧЕНИЕ
СПИСОК ЛИТЕРАТУРЫ


Активность, связанная с продукцией углекислого газа, метаногенезом, денитрификацией, сульфат и железоредукцией и продукцией жирных кислот зарегистрирована в морских осадках в слое 3 м от поверхности дна , . Неповрежденные бактериальные клетки обнаружены в слое морских осадков 0 м от поверхности, датируемом 4 миллионами лет назад . Физиологическая цельность клеток из осадков с глубины 0 м от поверхности дна была подтверждена филогенетическим анализом гена рРНК . В дальнейшем, выделение образцов неразрушенной РНК из образцов осадков с глубин 37 м показало . Присутствие жизнеспособного бактериального сообщества в глубинных осадках широко исследовано v, . Также мало известно о микроорганизмах глубинных осадков пресноводных систем . ИоЛйкб а В глубинных осадках 7 м от поверхности дна возраст тыс. Жизнеспособные бактерии, принадлежащие определенным метаболическим группам, найдены только до глубины см. Ниже этой глубины жизнеспособные гетеротрофы присутствуют только в виде спор, минимальное количество приходится на глубины 46 м КоЛАюб е1 а1. Для пресноводного озера Виндермейер Англия такой минимум приходится на глубину 8 м, что соответствует возрасту в тыс. М1зкт е Состав микрофлоры и характер микробиологических процессов в водоемах тесно связаны с экологической обстановкой окружающей среды, ее физическими и химическими особенностями. Донные отложения водоемов представляют собой особую экологическую зону. В них аккумулируется большое количество веществ автохтонного синтезированного в озере и аллохтонного поступающего с суши происхождения, которое в дальнейшем трансформируется благодаря деятельности микроорганизмов. Каждый слой иловых отложений образуется за счет осаждения из водной массы взвешенных частиц и ежегодно покрывается новыми отложениями. Один из важнейших процессов, происходящих в водоеме при непосредственном участии микроорганизмов круговорот органического вещества. Этот процесс связан с деятельностью бактерий различных физиологических групп, тесно связанных между собой трофическими и иными взаимоотношениями Заварзин, . Продукты метаболических реакций одних групп бактерий служат субстратом для других, что позволяет им эффективно использовать разнообразные органические вещества Кузнецов, . Рост бактерий в естественных условиях почти всегда лимитирован количеством доступного органического вещества. Поступление пищевых субстратов происходит неравномерно во времени и пространстве. Поток органического углерода в олиготрофных озерах не превышает 0,1 мгл Вотинцев, . Озеро Байкал относится к типичным олиготрофным водоемам. Его можно разделить на две части прибрежную до глубины 0 м, занимающую площадь около 0 тыс. Прибрежная область, особенно ее литоральная и сублиторальная зоны, находятся под большим воздействием материкового стока. Грунты содержат относительно большое количество легко гидролизующегося органического вещества. В образовании автохтонной органики значительную роль играют планктонные и бентосные водоросли, бактерии и водные растения. Водоросли, цианобактерии, фототрофные эубактерии и растения используют энергию солнца для синтеза органического вещества из углекислого газа. Планктонные водоросли и цианобактерии развиваются в основном в верхнем трофогенном слое воды. Главное отличие прибрежной области от глубоководной многообразие микробиотопов, созданных неровным рельефом дна, пятнистым распределением грунтов и органических отложений, резкими перепадами глубин. В воде Байкала преобладает водный гумус и относительное количество легкоокисляющихся органических соединений . На больших глубинах содержание лабильных органических веществ минимально Кожов, . Особенностью химического режима вод является крайне слабая минерализация, исключительная бедность Са мгл. Сульфаты, хлориды, гидрокарбонаты, калий распределяются во всех слоях равномерно, сезонные изменения их количеств практически отсутствуют.