Таксономическое разнообразие микробного сообщества водной толщи озера Байкал

• Автор: Белькова, Наталья Леонидовна
• Шифр специальности: 03.00.16, 03.00.07
• Научная степень: Кандидатская
• Год защиты: 2004
• Место защиты: Иркутск
• Количество страниц: 109 с. : ил.

ОГЛАВЛЕНИЕ
ВВЕДЕНИЕ

ГЛАВА 1. ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ

1.1. Лимнологические характеристики озера Байкал, обусловливающие особенности функционирования водной экосистемы

1.2. Развитие микробиологических исследований озера Байкал

1.3. Молекулярнобиологические методы в изучении состава и структуры микробных сообществ

ГЛАВА 2. МАТЕРИАЛЫ И МЕТОДЫ ИССЛЕДОВАНИЙ

2.1. Методы

2.2. Состав буферов и сред, использованных в работе

ГЛАВА 3. РЕЗУЛЬТАТЫ И ОБСУЖДЕНИЕ

3.1. Количественный анализ таксономического состава водного микробного сообщества озера Байкал
3.2. Изучение филогенетического разнообразия некультивируемых глубоководных микроорганизмов озера Байкал
3.3. Сопоставление результатов идентификации культивируемых гетеротрофных бактерий по морфобиохимическим тестам и секвенированию гена Б рРНК
ЗАКЛЮЧЕНИЕ
ВЫВОДЫ
СПИСОК ЛИТЕРАТУРЫ


Впервые с использованием молекулярных методов доказано, что адаптационной особенностью водного микробного сообщества озера Байкал является наличие большого количества некультивируемых форм бактерий. На основании филогенетической идентификации этих последовательностей показано, что некультивируемые формы бактерий представляют не только покоящиеся стадии известных культивируемых бактерий, но и большое разнообразие не идентифицированных бактерий, которые являются характерными для экосистемы озера. Практическая значимость. Широко распространенный метод молекулярнобиологических исследований адаптирован для изучения микробного сообщества водной толщи озера Байкал с учетом его экологических особенностей. Отработанный метод может быть применен для экологического мониторинга экосистемы озера, для быстрой диагностики состояния микробных сообществ. Полнота информации о составе микробных популяций имеет огромное практическое значение для выявления и выделения микроорганизмов, обладающих различными ферментативными активностями. Применение молекулярнобиологических методов для изучения филогенетического разнообразия байкальских микроорганизмов, соотнесение этих результатов с данными микробиологических исследований позволяет сформировать более полную картину разнообразия природного сообщества и функционирования экосистемы в целом, потому что позволяют учитывать не только культивируемые микроорганизмы. Создан банк данных последовательностей фрагментов гена Б рРНК культивируемых и некультивируемых бактерий, из них зарегистрированы в международном ЕМВЬбанке данных и им присвоены следующие номера Х3Х9, А2А5, А9А8, А6А. А6А1. Апробация работы и публикации. Результаты работы были представлены на международных конференциях Второй и Третьей Верещагинских Байкальских конференциях, проходивших в Иркутске в октябре г. VIII международном экологическом конгрессе I, проходившем в Сеуле, Корея август, , на I микробиологическом конгрессе европейского микробиологического общества , проходившем в Любляне, Словения июньиюль, и на международном Байкальском симпозиуме по микробиологии Микроорганизмы в экосистемах озер, рек и водохранилищ, проходившем в Иркутске сентябрь, . По материалам диссертации опубликована работа 7 из них в рецензируемых журналах. СТРУКТУРА И ОБЪЕМ РАБОТЫ. Предлагаемая диссертационная работа состоит из введения, обзора литературы, 3х глав собственных исследований, заключения, выводов, списка использованной литературы 8 источников, из них зарубежных и приложения. Объем работы составляет 9 страниц машинописного текста, включающего 6 таблиц, рисунков и 1 приложение. ГЛАВА 1. Озеро Байкал является самым древним млн. Главнейшей особенностью химизма вод озера Байкал является их крайне низкая минерализация. Суммарная концентрация растворенных солей в ней составляет около 0 мгл. Байкальские воды также бедны соединениями биогенных элементов и органических веществ. Вода в Байкале относится к слабоминерализованным мягким водам гидрокарбонатного класса, группы кальция первого типа. В среднем на долю гидрокарбонатов кальция и магния приходится , хлоридов и сульфатов 7 и щелочных металлов 9 эквивалент ионов. Основной запас вод около , отличающихся высоким качеством и большим содержанием кислорода, сосредоточен в глубинной зоне ниже 0 м. Деструкция органического вещества и реминерализация органических форм биогенных элементов протекает в основном в верхней зоне выше 0 м, а глубже замедляется изза опускания лишь трудно разлагаемых форм органического вещества Вотинцев и др. Впадина озера Байкал в морфологическом отношении представляет три самостоятельные котловины южную с наибольшей отметкой глубины м, среднюю м и северную 0 м. Средний химический состав вод в разных частях байкальской котловины различается незначительно. Время, в течение которого происходит полное замещение вод Байкала, составляет 0 лет Афанасьев, . Вода на глубинах 00 м от поверхности дна имеет самый старый возраст и обновляется через лет Грачев, .