Распространение и разнообразие спорообразующих бактерий рода Bacillus в водных экосистемах

• Автор: Суслова, Мария Юрьевна
• Шифр специальности: 03.00.16, 03.00.07
• Научная степень: Кандидатская
• Год защиты: 2007
• Место защиты: Иркутск
• Количество страниц: 163 с. : ил.

ОГЛАВЛЕНИЕ
ВВЕДЕНИЕ.

ГЛАВА 1. Обзорный анализ литературы

1.1. Таксономия бактерий рода i.

1.2. Физиологобиохимическая характеристика бактерий рода i.

1.3. Феномен устойчивости спор к различным факторам

окружающей среды

ГЛАВА 2. Объекты и методы исследования.

2.1. Физикогеографическая характеристика озера Байкал и термальных источников Котельниковский, Хакусы, Змеиный

2.2. Физикогеографическая характеристика озера Хубсугул.

2.3. Методы исследований.

ГЛАВА 3. Распространение, биоразнообразие и физиологобиохимическая характеристика представителей рода i в воде, донных осадках озера Байкал и термальных источниках Прибайкалья
3.1. Пространственное распределение представителей рода i в воде и донных осадках озера Байкал
3.2. Биоразнообразие бактерий рода i, изолированных
из воды и донных осадков оз. Байкал
3.3. Ферментативная активность штаммов рода i, выделенных из оз. Байкал.
3.4. Ферментативная активность культивируемых бактерий рода i в термальных источниках Прибайкалья Змеиный, Хакусы и Котельниковский
ГЛАВА 4. Бактерии рода i в донных осадках оз. Хубсугул
4.1. Распределение и численность бактерий рода i в донных отложениях озера Хубсугул.
4.2. Морфологические и физиологобиохимические признаки
бактерий рода i.
ГЛАВА 5. Роль микроорганизмов рода i в биодеградации сложных органических соединений и растворении соединений кремния.
5.1. Деградация углеводородов бактериями рода i
5.2. Деградация бис2этилгексилфталата бактериями рода
i
5.3 Роль представителей рода i в растворении соединений кремния
ЗАКЛЮЧЕНИЕ
ВЫВОДЫ
СПИСОК ЛИТЕРАТУРЫ


Кроме того, отдельно в категорию Инсектицидные виды выделены более 0 видов рода i, которые недостаточно описаны или потерянны их исходные штаммы. Эти виды могут быть восстановлены и внесены в определитель Берги после их ревизии и более детального изучения. Штаммы данной категории были выделены из мертвых или больных насекомых. Типичные представители это В. В. i, В. В. ii . Следует отметить, что, несмотря на применение таких современных методов исследования как молекулярная идентификация микроорганизмов, многие штаммы рода i окончательно не определены до вида и авторы описывают их физиологобиохимические характеристики. Например, i . 1 марганецокисляющий и восстанавливающий организм i, , , i . С и i . 6 оба алкалофильные организмы с необычными биоэнергетическими свойствами, i . X новый щелочно и температурностабильный, протеазоположительный штамм, i . 3 термофильный метанолутилизирующий вид, мутанты которого способны продуцировать большие количества лизина. Недавно был собран и представлен для идентификации отдельных видов обширный список фенотипических признаков представителей рода i. ГЦ состав ДНК так же, как и эксперименты по ДНКДНК гибридизации показали гетерогенность рода i. Существуют не только изменения от вида к виду, но имеются различия в ГЦ составе для отдельных штаммов одного вида, идентифицированных по другим признакам. Например, ГЦ состав штаммов В. Ф. Приест дополнительно к изучению ДНК провл обширный численный анализ набора характеристик. Он отнес организмов к пяти, основным кластерам В. В. i, В. В. i и В. Один из методов, применяемых для характеристики, быстрой идентификации и определения видоспецифичности, это липидный анализ. Оценка липидного состава показала, что род i не разделн внутри разрозненных групп , i, . Используя I систему I, быстрая идентификационная система, где многие биохимические оценки можно сделать на тестовых полосках и некоторые дополнительные классификационные признаки, . . Логан и Р. Ц. Берклей показали, что система I тестов является наиболее результативной для тестирования бактерий рода i по , i, . Самым эффективным таксономическим определением бактерий рода i является секвенирование гена рРНК. Этот подход содержит наибольший потенциал для уточнения микробной таксономии и установления филогенетических взаимоотношений микроорганизмов, выделенных из природных экосистем. Однако традиционных систематиков приводит в смятение такой факт бактерии рода i показывают родство с неспорообразующими видами. i, и i. Кроме того, современной молекулярной таксономией было показано, что В. В. , В. В. i, формируют общий кластер, в то время как штаммы, образующие круглые споры, такие как В. В. i и В. Кроме того, было показано, что именно эти бактерии филогенетически близки к неспорообразующим организмам. Например, В. В. ii ii, В. i , В. i. В обзоре, сделанном Р. Дж. Юртшуком с соавторами, основанном на молекулярногенетическом анализе гена рРНК, были определены три основные таксономические группы рода i. Авторами были определены полные и частичные последовательности фрагментов гена рРНК характерных штаммов рода i. Филогенетический анализ проводили, используя три различных метода, которые выявили три главных группы i . I, II и III таблица 1. Прямым сравнением с морфологическими группами было показано таблица 1, что за исключением II морфологической группы и неинициализированной подгруппы Е 2 все проанализированные штаммы принадлежали к I группе В. Штаммы II морфологической группы принадлежали ко всем трем филогенетическим группам, выявленным по результатам анализа рибосомальных генов, а В. Е 2, не похож на другие психрофильные штаммы и принадлежал к II группе В.