Кариотипическая эволюция Arvicolinae

• Автор: Лемская, Наталья Анатольевна
• Шифр специальности: 03.00.15
• Научная степень: Кандидатская
• Год защиты: 2008
• Место защиты: Новосибирск
• Количество страниц: 156 с. : ил.

ОГЛАВЛЕНИЕ

Список СОКРАЩЕНИЙ

Введение.

Глава 1. Обзор литературы

1.1 Методы сравнительной цитогенетики.

1.1.1 Сравнительный аналшдяффереггииальдаокршиеннькхромосом.

1. Сраштешюс кодирование

1. Хромосомньйгойтпитггвсравнигельной ни гога клике

1.1.4 Кладисшческий анализ в сравнительной цитогенетике

1.2 Характеристика подсемейства vii.

.1 Систематика подоемейства vii

2 Карислипическое разнообразие подоемейелва vii
3 Скорость эволкх гии в подсемействе vii
1.3 Хромосомный пэйнтинг в исследовании кариотипических отношений видов подсемейства vii
Глава 2. Материалы и методы
2.1 Материалы.
2.1.1 Растворы и реактивы.
2.1.2 Суспензии фиксированных метафазных клеток
2.2 Методы
2. Получение и культивирование первичных фибробласгов
2.2. . Методы получения культур
2.2.1.2 Культивирование и криокоисервация.
2. Получение суспензии фиксированных клеток
2.2.2. Фиксация клеток костного мозга.
2.2.2.2 Получение фиксированных клеток из культур первичных фибробластов
2.2.2.3 Хранение фиксированных клеток.
3Дифференциальное окрашивание хромооом.
.4 Хромосомный пойшинг
2.2.4.1 Характеристика наборов сортированных хромосом.
2.2.4.2 Выделение ДНК М. iiii.
2.2.4.3 Реамплификация библиотек в ПЦР
2.2.4.4 Мечение зондов в ПЦР.
2.2.4.5 Флуоресцентная i i гибридизация
5Получение и обработка изображения
Глава 3. Результаты и обсуждение
3.1 Локализация хромосомных проб пашенной полевки i i на
хромосомы шестнадцати видов подсемейства vii
3.1.1 ii . .
3. РЬд .
3.1.3 Рбд i., i , vi, i, i
3.2 Рециирокный пэйнтиш между хромосомами копытного лемминга ix
и пашенной полевки i i
3.3 Локализация пэйнтингпроб половых хромосом М. i на хромосомы
исследуемых видов подсемейства vii
3.4 Сопоставление окрашенных хромосом М. i с хромосомами М. i,
Е. i, Е. i.
3.5 Реконструкция предковых кариотипов
3.6 Возможный ход эволюции подсемейства полсвковых. Скорость кариотиничсских
преобразований
Заключение
Список литературы


Работа состоит из следующих разделов введение, обзор литературы, материалы и методы, результаты и обсуждение, заключение, выводы, список цитируемой литературы 0 ссылок и двух приложений. Диссертация изложена на 6 страницах машинописного текста, иллюстрирована рисунками и содержит 9 таблиц. Глава 1. Основу сравнительной цитогенетики заложил анализ кариотипов с помощью сопоставления рутинно окрашенных хромосом. При этом учитывались такие характеристики, как общее число и размеры хромосом, морфология хромосом и число хромосомных плеч, соотношение числа аутосом с размой морфологией, относительные размеры и морфология половых хромосом. Дополнительные возможности сравнения кариотипов различных видов появились с развитием методов дифференциального окрашивания хромосом , , и Сбэндинг. На основании сходства рисунка дифференциально окрашенных хромосом стало возможным не только идентифицировать все хромосомы кариотипа, но и выявлять гомеологию хромосомных районов или целых хромосом в кариотипах разных видов. Развитие молекулярногенетических методов хромосомного анализа продемонстрировало, что районы такой гомеологии не всегда являются истинно гомологичными, поскольку генетическое содержание часто отличается в районах хромосом со сходным рисунком , или исчерченности. Тем не менее, методы классической цитогенетики позволили достичь колоссальных успехов на пути изучения и сравнения кариотипов представителей различных видов, родов, семейств и отрядов млекопитающих. В ряде случаев при сопоставлении дифференциальной исчерчснности хромосом идентифицированы протяженные участки видимой гомологии ,0i . Именно дифференциальное окрашивание хромосом, дополненное данными сравнительног о картирования, позволило представить общую картину кариотипической эволюции в основных таксонах млекопитающих, реконструировать гипотетический предковый кариотип как для отдельных отрядов, так и для млекопитающих в целом, выявить возможные эволюционные перестройки хромосом и составить представление о темпах кариотипической эволюции млекопитающих Vii i , i ix, i . Целью картирования является создание максимально насыщенной упорядоченной карты хромосом, содержащей последовательности различных генов и других генетических маркеров в количестве, соответствующем их встречаемости в геноме. Долгое время сравнительное картирование хромосом млекопитающих базировалось на использовании гибридов соматических клеток, в том числе и радиационных гибридов. В основании этого методического подхода лежит получение наборов панелей клеточных линий, содержащих различные комбинации хромосом и хромосомных фрагментов исследуемого генома на фоне хромосом другого вида. В большинстве случаев картирование с помощью гибридов соматических клеток дает информацию только о синтении, но не о порядке генов. Широко применяется метод хромосомной локализации с помощью I фрагментов ДНК, клонированных в искусственных бактериях ВАС, Р1фагах РАС, дрожжевых хромосомах , . Картирование можно проводить с помощью межвидовых гибридных бэккроссов или отдаленных внутривидовых скрещиваний так называемое рекомбинационное или мейотическое картирование. Метод позволяет создавать насыщенные мейотические карты сцепления . При помощи наборов геноспецифичных пар праймеров появилась возможность идентификации уникальных последовательностей в геномах большинства млекопитающих. Праймеры были сконструированы на основе сравнительного анализа данных картирования геномов человека и мыши, путем выявления наиболее консервативных пар генов . Выделяют три типа маркеров, на локализации которых основано построение генетических карт многих видов млекопитающих. К первой группе относят кодирующие гены, которые являются низковариабельными консервативными и имеют высокую степень гомологии у видов, относящихся не только к разным родам и семействам, но и к разным отрядам. На их базе можно проводить сравнение хромосом у видов с самой разной степенью филогенетической удаленности.