Молекулярно-генетическое изучение наследственных моторно-сенсорных нейропатий I типа в Республике Башкортостан

• Автор: Багаутдинова, Эльвира Газинуровна
• Шифр специальности: 03.00.15
• Научная степень: Кандидатская
• Год защиты: 2007
• Место защиты: Уфа
• Количество страниц: 116 с. : ил.

ОГЛАВЛЕНИЕ
ВВЕДЕНИЕ.

Глава ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ.

1.1. Клиническая характеристика и эпидемиология наследственных моторносенсорных нейропатий.

1.2. Молекулярногенетические основы НМСН

1.2.1. Наследственные моторносенсорные нейропатии первого

типа миелинопатии.

1.2.2. Наследственные моторносенсорные нейропатии второго

типа аксонопатии

Глава И. МАТЕРИАЛЫ И МЕТОДЫ

И. 1. Материал для исследования.

.2. Методы исследования.
.2.1. Выделение геномной ДНК.
.2.2. Идентификация дупликации гена РМР
.2.3. Исследование генов РМР, 1 Сх и 2 .
.2.4. Анализ полиморфных ДНКлокусов, сцепленных с геном
Сх
.2.5. анализ.
П.2.6. Определение нуклеотидной последовательности
И.З. Рестрикционный анализ.
II.4. Статистическая обработка результатов
Глава III. РЕЗУЛЬТАТЫ ИССЛЕДОВАНИЯ И ОБСУЖДЕНИЕ
III. 1. Определение частоты дупликацииделении гена РМР в
выборке больных НМСН из Башкортостана.
III. 1.2. Анализ полиморфизма ДНКлокусов 4А, 9А и 9В,
сцепленных с геном РМР, в некоторых этнических группах Башкортостана
Ш.2. Поиск мутаций и полиморфизмов в генах РМР, ЯВ Сх
МРг и ЕвЯ2
Ш.2.1. Анализ гена РМР
Ш.2.2. Анализ гена вЗВ Сх
Ш.2.3. Анализ генов МРХ и ЕСЯ2
Ш.З. Анализ ассоциаций мутаций в гене вЗВI Сх с гаплотипами
по полиморфным локусам.
Ш.4. Алгоритм ДНКдиагностики НМСНI типа
ЗАКЛЮЧЕНИЕ
ВЫВОДЫ
СПИСОК ЛИТЕРАТУРЫ


Считается, что этот ген экспрессируется в раннем эмбриогенезе и является транскрипционным фактором для, так называемых, поздних миелиновых генов, таких как и МБР i i i. В настоящее время в гене 2 описано только 9 мутаций и один полиморфизм. Следует отметить, что мутации в выше указанных генах могут приводить к различным формам НМСН, относящимся не только к НМСН I типа, но также к НМСН II и промежуточного типов. Поэтому, при проведении молекулярногенетического изучения данной группы заболеваний в определенном регионе, как правило, в первую очередь исследуются именно эти гены. В Республике Башкортостан РБ эпидемиологическое и молекулярногенетическое исследование НМСН начато в последние годы установлена территориальная и этническая неравномерность распространения заболевания, преобладание по частоте НМСН I типа. Однако, молекулярногенетический анализ включал только определение дупликацииделеции гена РМР, показавшее несколько более низкий уровень частоты данной мутации в РБ среди НМСН I Крупина Н. Б. с соавт. России. В связи с этим, актуальным является продолжение исследования роли ряда известных генов в развитии НМСН у больных из РБ, являющееся основой для разработки наиболее оптимального для региона алгоритма ДНКдиагностики данной группы заболеваний. В настоящее время банк ДНК больных НМСН из РБ расширен, что требует и продолжения определения дупликацииделеции гена РМР. Кроме того, следует отметить, что при проведении идентификации данной мутации методом регистрации дозы гена с помощью двух микросателлитных маркеров, в ряде случаев возникала необходимость анализа полиморфизма дополнительных ДНКлокусов. РМР, удобных для ПЦРанализа и характеризующихся высокой степенью гетерозиготности среди населения исследуемого региона. Целью исследования явился анализ структурных особенностей генов РМР, Сху СЯ2 у больных с наследственными моторносенсорными нейропатиями из Башкортостана и разработка оптимального для региона алгоритма ДНК диагностики данной группы заболеваний. Провести поиск мутаций и полиморфных вариантов генов РМР, Сх, и ЕСЯ2 у больных с НМСН из РБ и в контрольной выборке. У больных с выявленными мутациями определить гаплотипы по полиморфным локусам, маркирующие мутантные хромосомы. Охарактеризовать клинические особенности НМСН у больных с выявленными мутациями в исследованных генах. С целью оптимизации метода выявления дупликацииделеции гена РМР провести анализ полиморфизма трех сцепленных с геном минисателлитных ДНК локусов в популяциях русских, башкир и татар жителей Башкортостана. Разработать на основе полученных данных оптимальный для населения Республики Башкортостан алгоритм ДНКдиагностики НМСН. В результате проведенного исследования впервые в Республике Башкортостан изучены спектр и частота мутаций в генах РМР, СЛ Сх, МР1 и Я2 при НМСН I типа. Выявлено 4 различных мутации в гене СЛ, одна из которых РгоА1а является частой в РБ , среди НМСН 1 типа, сцепленной с общим гаплотипом мутация ТЬгПе, выявленная с частотой 1, среди НМСН I типа, ранее не описана. С целью оптимизации метода идентификации дупликацииделеции гена РМР проведен анализ полиморфизма трех сцепленных с геном микросателлитных локусов среди жителей РБ, показавший высокие показатели гетерозиготности и возможности их использования для диагностики данной мутации. Полученные данные позволяют расширить представление о молекулярногенетических причинах развития НМСН в Башкортостане. На основе данных по спектру и частоте генетических вариантов НМСН разработан оптимальный для нашего региона алгоритм поиска мутаций у больных с НМСН I типа. Полученные результаты могут быть использованы для уточнения диагноза, а также позволяют проводить пренатальную ДНКдиагностику НМСН в семьях с идентифицированными мутациями. Результаты исследования могут быть использованы при чтении курсов медицинской генетики на биологических факультетах университетов, в медицинских ВУЗах и на курсах повышения квалификации медицинских работников.