Формализованное описание типов наследования признаков с использованием величин пенетрантностей аллелотипов генов

• Автор: Корчагин, Николай Владимирович
• Шифр специальности: 03.00.15
• Научная степень: Кандидатская
• Год защиты: 1985
• Место защиты: Москва
• Количество страниц: 206 c. : ил

1.1. О терминологии

1.2. Предварительная формулировка цели и задач исследования

1.3. Величины пенетрантностей аллелотипов. Объествные сложности при определении этих величин

1.4. Об исследованиях сегрегационных частот

1.5. О некоторых особенностях сложных систем уравнений и их решений. Негативные моменты решения таких систем численными методами

1.6. Дисперсионный подход к решению задачи о величинах пенетрантностей аллелотипов

1.7. Негативные стороны дисперсионного подхода

1.8. Причины малосостоятельности используемых в литературе подходов к решению задачи о величинах пенетрантностей

1.9. Основные выводы из литературного обзора. Постановка задачи исследования

ШВА 2. ПОСТРОЕНИЕ АЛГОРИТМА ВЫЧИСЛЕНИЯ ВЕЛИЧИН ПЕНЕТРАНТНОСТЕЙ АЛЛЕЛОТИПОВ ГЛАВНОГО АУТ0С0МН0Г0 ГЕНА И ЧАСТОТ ЕГО АЛЛЕЛЕЙ

2.1. Группы родственников и единицы обследования

2.2. Рабочая модель. Матрица соответствия фенов аллелотипам главного гена
2.3. Частоты альтернативных фенов
З
2.4. Необходимость неизменности величин пенетрантностей аллелотипов и частот аллелей в чередующихся поколениях. Модельная предельно ХардиВайнберговская популяция
2.5. Частоты фенов детей от разных фенобраков
2.5.1. Сравнение выражений частот фенов детей от разных фенобраков в тотально обследованной популяции
с выражениями сегрегационных частот в случае поодиночной регистрации семей
2.6. Частоты фенов детей от неполных фенобраков
2.7. О решениях неопределенных систем уравнений
2.8. Система уравнений ЯфА
2.9. Анализ решений системы Генетически осмысленные и генетически бессмысленные ее решения
2Единицы обследования типаТ и решения системы 3ал . Предварительные заключения
2Система и случай
2.Т Основной и альтернативный фены
2Система 6.Л . Случай 0
2. Пять разных груш монолокусных типов наследования, для которых система ЙЛ шеет единственное решение. Определяющие фенетические характеристики этих типов наследования
. О существовании типов наследования О I
и 0, 0
2 Решения системы Зб2 и оценка вкладов фено и генокопирования в проявление признака
2 Система уравнений и система дисперсионных уравнений Здаси И
2 Невозможность получения оценки вклада
фено и генокопирования в формирование фенов с изначально неизвестным типом наследования с помощью системы 0Хчл 1 с помощью системы дисперсионных уравнений. Конкретные примеры
2 Заключение о применимости системы уравнений йсгхл 0 групп родственников типа для определения величин пенетрантностей аллелотипов и частот аллелей в случаях, когда тип наследования фенов не известен
2 Система уравнений 7А 0 об1Иее Ре шение основной задачи четвертое независимое уравнение
2 Система уравнений чл 0 общее решение основной задачи еще одно четвертое независимое уравнение
2 Сопоставление систем уравнений Й
К5 6 7ЭЛ 0 2б 0 их решений
2 Тотальное обследование только пораженных популяции
2 К определению величин генетических параметров наследования признаков и заболеваний с поздним возрастом проявления
2 Форшлизованное описание типов наследования признаков с помощью матриц соответствия фенов аллелотипам
ГЛАВА 3. ОБСУЖДЕНИЕ И ЗАКЛЮЧЕНИЕ
СПИСОК ЛИТЕРАТУРЫ
ВВЕДЕНИЕ
Актуальность


Пенетрантность аллеля главного гена изучаемого фена есть вероятность проявления действия этого аллеля вероятность формирования фена, определяемого действием этого аллеля в зависимости от совокупного действия на него на этот аллель аллелей остальных генов генотипа и средовых факторов в том числе от действия на него другого аллеля главного гена, слагающего вместе с ним аллелотип главного гена. И потому пенетрантность аллеля в общем случае различна не только в зависимости от того, в каком генотипе он находится, но и в зависимости от того, в каком он пребывает аллелотипе в гомозиготном или в гетерозиготном. Кроме того в общем случае существует некоторая вероятность того, что изучаемый фен будет сформирован даже в случае отсутствия его основного аллеля в генотипе индивида особи это так называемые спорадические случаи генокопии и фенокопии. Эти случаи не охватываются термином пенетрантность потому что в генотипе особи, сформировавшей фен за счет фено или генокопирования соответствующего основного аллеля, ответственного за формирование этого фена просто нет. В свете этого может быть стоит чаще использовать термин пенетрантность аллелотипа главного гена в отношении изучаемого фена признака вместо термина пенетрантность аллеля. Термину пенетрантность аллелотипа соответствует встречающийся в литературе термин пенетрантность генотипа. Если с этим согласиться, то одним и тем же термином мы сможем описывать все возможные случаи формирования фена его основным
аллелем в гомозиготе, этим же аллелем в гетерозиготе, и, наконец, генамиаллелями генотипа, не содержащего вообще основного аллеля изучаемого фена. Алгоритм должен быть таким, чтобы был пригоден для использования при изучении признаков фенов и заболеваний с самыми разными произвольными наследованиями. ВЕЛИЧИНЫ ПЕНЕТРАНТНОСТЕЙ аллелотипов. Определить величину пенетрантности аллелотипа главного гена сравнительно просто, когда есть возможность отобрать особей, аллелотип которых достоверно известен, и рассматривать их детей. В самом деле, расщепление сегрегация аллелотипов детей от брака особей индивидов с известными аллелотипами строго определено соотношениями Менделя. И потому, имея совокупность аллелотипически однородных браков, мы знаем величину теоретически ожидаемого соотношения аллелотипов детей от этих браков. Отобрать индивидов с известными аллелотипами иной раз удается без особых сложностей. Это, например, моано сделать, если изучаемый признак сравнительно редок и в плане наследования не слишком сильно отличается от классических менделевских признаков. См. А.С. Сергеева, , изучавшего нейрофиброматоз редкое заболевание, определяемое доминантным аллелем с почти полной пенетрантностью в гетерозиготе. В таких случаях можно с достаточной уверенностью считать, что практически все носители признака суть гетерозиготы, а абсолютно большая часть здоровых лиц гомозиготы по рецессивному аллелю. Аа х аа аллелотипически однородные браки, характеризующиеся вполне определенным менделевским расщеплением детей по аллелотипам 0,5 Аа 0,5 аа. Неполнота пенетрантности аллеля А приведет к дефициту пораженных детей. В самом деле пусть величина неполной пенетрантности аллеля А в гетерозиготе, т. М Ас 0,5 Мча 0,ь М ЛаШ0,5 М 4 а Щф,5 М сд V. А детей у откупа И 2 И . Аналогичным способом можно составить уравнения и для иных аллелотипически однородных браков. Следует отметить, что построенное здесь выражение величины пенетрантности гетерозиготы справедливо лишь в предположении, что пенетрантность гомозиготного аллелотипа аа у здоровых лиц в этом примере равна единице. Это предположение, наверное справедливо во многих случаях, но, очевидно, всетаки не всегда. Поэтому, если бы мы строили формулы именно для такого, более общего случая даже если бы мы, как в этом рассмотренном выше примере, рассматривали бы только один фенотипический брак АЫлТГ, а не все четыре разных возможныхТАМлО, v и мы, в этом рассмотренном выше случае, должны были бы учитывать пенетрантность не только гетерозиготы Аа, но и гомозиготы аа аллелотипически однородный брак типа Аа х аа неполная пенетрантность аллелотипа Аа и неполная пенетрантность аллелотипа аа. Расщепление по аллелотипам детей в этом аллелобраке 0,5 М Аа 0,5Маа. ГГЙМ. Легко видеть, что в этом случае мы можем найти лишь сумму величин и , но не каждую из этих величин в отдельности.