Углеродный метаболизм бактерий рода Sulfobacillus

• Автор: Егорова, Мария Анатольевна
• Шифр специальности: 03.00.07
• Научная степень: Кандидатская
• Год защиты: 2004
• Место защиты: Москва
• Количество страниц: 178 с.

СОДЕРЖАНИЕ

Список сокращений.

ВВЕДЕНИЕ.

ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ.

ГЛАВА 1. Особенности местообитания у видовой состав группы умереннотермофильных

ацидофилов.

ГЛАВА 2. Характеристика бактерий роал8и1оЬасИ1ш.

2.1 Видовое разнообразие представителей рода БЫоЬасШич

2.2 Филогенетическое положение рода 8и1оЬасШш

2.3 Морфологическая характеристика сульфобацилл.

2.4. Образование эндоспор.

2.5 Физиологические свойства
2.6 Метаболизм
2.6.1. Приспособление к низким значениям среды.
2.6.2. Окислениевосстановление железа
2.6.3.Метаболизм углерода.
2.6.3.1. Пути автотрофной фиксации С
2.6.3.2 Миксотрофия и ее распространение
2.6.3.3. Метаболизм глюкозы.
2.6.3.4. Цикл трикарбоновых кислот и анаплеротические реакции.
2.6.4. Окисление серы.
ГЛАВА 3. Нахождение в природе и практическое применение сульфобацилл
ЭКСПЕРИМЕНТАЛЬНАЯ ЧАСТЬ.
ГЛАВА 4. Материалы и методы исследования
4.1. Объекты исследования и условия их культивирования
4.2. Методы анализов
4.2.1. Определение железа.
4.2.2. Определение глюкозы
4.2.3. Летучие жирные кислоты и этанол
4.3. Ассимиляция клетками штамма К1 меченной углекислоты
4.4. Определение активности ферментов
4.4.1. Определение карбоксилирующих ферментов
4.4.2. Определение активности ферментов цикла трикарбоновых кислот и глиоксилатного шунта
4.4.3. Определение активности ферментов углеводного метаболизма
4.4.4. Ферменты серного метаболизма
4.4.5. Определение белка .
4.4.6. Математическая обработка результатов
ГЛАВА 5. Результаты
5.1. Рост сульфобацилл в разных условиях.
5.1.1. . ixi, штамм .
5.1.2. .iii 1т.
5.1.3. .ixi штамм
5.2. Морфология сульфобацилл.
5.3. Фиксация ,4Сбикарбоната суспензиями клеток .ixi штамм
5.4. Активность ферментов углеродного метаболизма.
5.4.1. .ixi штамм
5.4.2. .iii штамм 1
5.4.3. .ixi штамм
5.5. Активность ферментов, участвующих в метаболизме серы у .ixi
. .
ОБСУЖДЕНИЕ.
ВЫВОДЫ.
СПИСОК ЛИТЕРАТУРЫ


рРНК, имеющей общие характерные особенности v . Турова, . Кроме того, в клетках бактерий рода ii обнаружены липиды юалицикличсских жирных кислот, признанные отличительной чертой представителей рода ii i . v . Турова, . Однако, изучение сульфобацилл штаммов , К1 и показало, что образование данных соединений зависит от условий выращивания Цаплина и др. Циклогексановые кислоты преобладают в гетеротрофгых условиях выращивания в клетках всех перечисленных культур, в автотрофных условиях роста типовой штамм их не синтезирует, в миксотрофных условиях культивирования данные жирные кислоты обнаруживаются в клетках штамма К1, окисляющих пирит, и в клетках аспорогенной культуры штамма , окисляющей 2. Филогенетическое положение штаммов ТНЗ, ВС и V, фенотипически сходных с родом i, было определено немного позднее i . Они отнесены к грамположительной ветви бактерий, при этом штаммы ВС и V оказались более близкими к ветви с низким содержанием ГЦпар, а штамм ТНЗ к ветви с высоким содержанием ГЦпар . При этом они не составляли единой филогенетической группы с видами родов i и ii v . ДНК для штамма ВС и . i . Дальнейшие исследования показали, что, вероятно, род i не входит в одну группу с видами рода ii , . Для решения возникшего противоречия было проведено повторное изучение последовательностей гена рРНК разных штаммов вида xix. .ixi , , ВС1, СМТ1 и . V, составляют единый кластер. Виды рода ii объединены в другой кластер, к которому, видимо, относится штамм К1 и вид . Каравайко и др. К настоящему времени описано несколько новых представителей рода ii . . . . . рРНК выше с другими алициклобациллами, не содержала в мембранах характерных оалициклических жирных кислот. В состав липидов мембран ЛЬ. Сходный состав мембранных липидов характерен для умеренно термофильной факультативно хемолитотрофной бациллы i i , , , которая как и . рРНК с термофильными гетеротрофными бациллами и при построении дендрограммы располагается на периферии кластера ii i . .iixi попадает в группу ал и циклобацилл независимо от метода построения филогенетического дерева, при этом уровень сходства рРНК между данным организмом и другими штаммами кластера выше, чем , т. i . . В эту же группу попадают литотрофные организмы . и ii iv штамм . По данным анализа фрагментов рестрикции хромосомной ДНК, разделенных методом пульсэлектрофореза, коэффициенты сходства для штаммов и К1, а также и К1, равны 0, и 0,, соответственно. Учитывая, что для данного метода значение коэффициента сходства, при котором культуры могут быть отнесены к одному виду, равно 0,4, можно предположить, что штамм К1 может быть выделен в самостоятельный вид Кондратьева и др. Таким образом, таксономическое положение штаммов, составляющих род , окончательно не определено, и дальнейшие исследования физиологобиохимических особенностей позволят объяснить существующую на данный момент филогенетическую гетерогенность этого рода. Морфологическая характеристика сульфобацилл. Представители рода i являются грамположительными эубактериями. Морфология изученных видов представлена в табл. Таблица 2 рода БиоЬасш. . i 2. Ыа1еги Хс,онл7аеШ5 Ж 1Ыгтоаиф1оохикт. Ьзр. 0 0 Палочки, 0,91,0 х 3,06,0 мкм, одиночные, в парах или коротких цепочках. Палочки, 0. 2 , пирит Ре, Б0, пирит Ре2 Б0, пирит Ре2 Б0, сульфидные минералы. Дрожжевой экстракт 0 0 Дрожжевой экстракт, глюкоза, крахмал, мочевина. Глюкоза, г луга мат, днтиобисбеизотиазол, восстановленный и окисленный глугатион, цистеин, цистин. 0 1. 0 . i . . Меламуд и др. i .