Множественные субформы мРНК гена фактора транскрипции Oct-1

• Автор: Деев, Игорь Евгеньевич
• Шифр специальности: 03.00.02
• Научная степень: Кандидатская
• Год защиты: 2003
• Место защиты: Москва
• Количество страниц: 103 с. : ил

Содержание

Список обозначений и сокращений

Введение

Литературный обзор

1. Инициация транскрипции

1.1 Инициация транскрипции 7 эукариотическими РНКполимсразами 1 и III

1.2 Инициация транскрипции эукариотической РНКполимеразой II

2. Альтернативный сплайсинг

2.1 Тканеспецифический сплайсинг генов эукариот

2.2 Альтернативный сплайсинг генов факторов транскрипции эукариот,

приводящий к потерям в функциональности

2.3 Альтернативный сплайсинг генов эукариот, приводящий к образованию нетранслируемых областей
3. белки
Экспериментальная часть
1. Материалы
2. Стандартные Методы
3. Получение субформ мРНК
4. Клонирование 5нетранслируемых областей перед 1 и 1 экзонами гена
5. Получение и очистка белков в ii i
Результаты исследования
1. Тканеспецифические изоформы гена 1
2. Промоториая активность областей, расположенных перед экзонами Ши 1 человека
3. Субформа мРНК гена 1 имеющая делению в домене
4. Определение уровня экспрессии субформ мРНК 1
5. Субформы мРНК гена 1 имеющие нетранслируемые экзоны
6. Анализ локуса 1 мыши и человека
Обсуждение результатов
Выводы
Список литературы


Например, факторы транскрипции, которые регулируют гены, вовлеченные в регуляцию клеточного цикла, контролируются сигналами, свойственными для определенного момента клеточного цикла, в то время как факторы, модулирующие экспрессию метаболических ферментов, часто сами регулируются прямо метаболитами I. Существует множество ДПКсвязывающих регуляторных белков, которые осуществляют тонкую регуляцию экспрессии генов. Однако, известно из анализа геномов высших эукариот ссылка, что только небольшая часть генетического . РНК. Другим способом иосттранскрилциоиного контроля является сплайсинг молекул премРНК, что может привести к большому разнообразию экспрессии белков с одного гена. Также иногда последовательность мРНК видоизменяется при помощи процесса, называемого редактировании мРНК. В результате такого редактирования кодирующая последовательность мРНК отличается от соответствующей последовательности в геноме. В диссертационной работе представлены результаты исследования продуктов экспрессии гена осЫ и его сплайсинга в разных тканях и видах клеток. Целью данной работы было выяснение спектра субформ, которые экспрессируются с гена ОС11, и их анализа. Полученные данные говорят о сложной картине регуляции экспрессии гена ос11 в организме, что видимо связано с разнообразными функциями гена ос1. ЛИТЕРАТУРНЫЙ ОБЗОР. Первым этапом транскрипции генов является инициация транскрипции. Остановимся на этом процессе более подробно, так как вес дальнейшие процессы, будут зависеть от того, произошла инициация транскрипции или нет. Эукариотические РНКполимеразы I и III транскрибируют ограниченный ряд генов. РНКполимераза I участвует в синтезе рибосомных РНК рРНК, а РНКполимераза III транскрибирует 5 рРНК, тРНК участвующие в синтезе белков, 7 РНК участвующую в внутриклеточном транспорте, 6 мяРНК участвующую в постгранскршшиошюм процессинге и некоторые другие малые стабильные РНК 7 РНК. РНК, которые участвуют в процсссише РНК 2. При помощи РНКполимераз I и III в растущих клетках образуется около тотальной 3 Хотя РНКполимеразы 1 и III отличаются друг от друга, но механизм, используемый этими двумя факторами, имеет фундаментальные сходства, поэтому рассмотрим их в одном разделе. Одной из удивительных особенностей сигналов инициации транскрипции в генах, кодирующих рРНК, является их видоспсцифичность. Так, в клеточных экстрактах человека может осуществляться транскрипция клонированных генов рРНК человека, но не рРНК мыши, крысы, дрожжей. И наоборот клеточные экстракты мыши не пригодны для транскрипции рРНК человека 2,3. Гены рРНК практически всех эукариот построены в виде длинных повторов типа голова к хвосту Рис. А. Промотор расположен в межгенном спейсере МС между транскрибируемыми единицами. Участок, состоящий примерно из пн выше сайта инициации 1, коровый промотор, который необходим и достаточен для инициации транскрипции Рис. В. Фактор I1 4, связывающийся с кором, состоит из ТВР см. ТВРсвязанныс факторы полимеразы I i , . Эти факторы связываются с РНКполимеразой, таким образом, связывая ее с промотором. Рис. Геномная организация единицы транскрипции РНКполимеразы I А рРНК кодирующие единицы разделены межгенным спейсером МС, В МС содержат ряд терминаторов терм, энхасеров, проксимальный терминатор РТ, промежуточные промоторы , левый регуляторный элемент РЕ и коровый промотор. У большинства видов дополнительные элементы и факторы помогают сборке и стабилизации комплекса, формируемого на коровом промоторе. Одним из важнейших элементов является РЕ левый регуляторный элемент, который расположен выше старта инициации транскрипции 1 на 00 пн. в значительной степени стимулирует инициацию транскрипции с корового промотора, но в большинстве случаев не является абсолютно необходимым. связывающийся фактор и I1 облегчают связывание IIполимеразы с промотором. Последовательность ДНК, расположенная между коровым промотором и , не играет роли. Большое значение имеет лишь длина этой последовательности.