Структура и филогеография генофонда коренного населения Сибири по маркерам Y-хромосомы

• Автор: Харьков, Владимир Николаевич
• Шифр специальности: 03.02.07
• Научная степень: Докторская
• Год защиты: 2012
• Место защиты: Томск
• Количество страниц: 397 с. : 43 ил.

ОГЛАВЛЕНИЕ
ВВЕДЕНИЕ

ГЛАВА 1. ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ

1.1. Генетическое разнообразие современных популяций человека.

Проблемы геногеографии и этногенетики

1.2. Системы генетических маркеров в популяционной генетике человека

1.3. У-хромосома и ее применение в популяционной генетике

1.3.1. Строение и функции У-хромосомы

1.3.2. Свойства У-хромосомы, как инструмента для эволюционных и популяционных исследований

1.3.3. Классификация гаплогрупп У-хромосомы

1.3.4. Краткое описание основных клад У-хромосомы

1.4. Краткая история этногенетических исследований населения Сибири
1.5. Заселение человеком территории Сибири
1.6. Антропологическая и лингвистическая характеристика сибирских этносов
1.7. Генетико-демографическая характеристика коренного населения Сибири
1.8. Краткая этноисторическая справка о коренных сибирских этносах
1.8.1. Этногенез алтайцев
1.8.2. Этногенез телеутов
1.8.3. Этногенез хакасов
1.8.4. Этногенез тувинцев
1.8.5. Этногенез бурятов
1.8.6. Этногенез алтайских казахов
1.8.7. Этногенез эвенков
1.8.8. Этногенез якутов
1.8.9. Этногенез хантов
1.8.10. Этногенез кетов

1.8.11. Этногенез чукчей
1.8.12. Этногенез коряков
1.8.13. Этногенез нивхов
1.8.14. Этногенез удэгейцев
1.9. Резюме
ГЛАВА 2. МАТЕРИАЛЫ И МЕТОДЫ
2.1. Материал исследования
2.2. Методы исследования
2.2.1. Выделение ДНК
2.2.2. Маркеры, использованные для характеристики генетического разнообразия
2.2.3. Генотипирование диаллельных маркеров
2.2.4. Генотипирование микросателлитных маркеров
2.3. Статистический анализ данных
ГЛАВА 3. СТРУКТУРА И РАЗНООБРАЗИЕ ОБОБЩЕННОГО ГЕНОФОНДА НАСЕЛЕНИЯ СИБИРИ
3.1. Состав гаплогрупп Y-хромосомы в сибирском генофонде
3.2. Генетическое разнообразие этносов
3.3 Генетическая дифференциация этносов
3.4 Генетические взаимоотношения между этносами
3.5 Г енетические взаимоотношения между гаплогруппами
3.6. Корреляция генетической структуры с географическими, антропологическими и лингвистическими характеристиками
ГЛАВА 4. ФИЛОГЕНИЯ И ФИЛОГЕОГРАФИЯ ГАПЛОГРУПП Y-ХРОМОСОМЫ
4.1. Филогения и филогеография гаплогруппы Rlala У-хромосомы
4.2. Филогения и филогеография гаплогруппы Nlcl У-хромосомы
4.3. Филогения и филогеография гаплогруппы Nib У-хромосомы
4.4 Филогения и филогеография гаплогруппы СЗ* У-хромосомы
4.5 Филогения и филогеография гаплогруппы СЗс У-хромосомы

4.6 Филогения и филогеография гаплогруппы С3с1 У-хромосомы
4.7 Филогения и филогеография гаплогруппы С)1аЗ У-хромосомы
4.8 Филогения и филогеография гаплогруппы С>1а* У-хромосомы
4.9 Филогения и филогеография гаплогруппы СДаЗа 1 У-хромосомы
ГЛАВА 5. СТРУКТУРА ГЕНОФОНДОВ КОРЕННЫХ ЭТНОСОВ СИБИРИ ПО МАРКЕРАМ У-ХРОМОСОМЫ
5.1 Структура генофонда алтайцев
5.2 Структура генофонда телеутов
5.3 Структура генофонда тувинцев
5.4 Структура генофонда хакасов
5.5 Структура генофонда бурятов
5.6 Структура генофонда якутов
5.7 Структура генофонда кетов
5.8 Структура генофонда хантов
5.9 Структура генофонда чукчей
5.10 Структура генофонда коряков
5.11 Структура генофонда удэгейцев
5.12 Структура генофонда нивхов
ЗАКЛЮЧЕНИЕ
ВЫВОДЫ
СПИСОК ЛИТЕРАТУРЫ
ПРИЛОЖЕНИЕ

рекомбинации и линейной передаче в ряду поколений), униродительски наследуемые части генома занимают особое место среди маркерных генетических систем. Принципиальная важность ДНК-маркеров
специфических участков генома человека в том, что они позволяют исследовать раздельно материнскую и отцовскую линии, поскольку мтДНК передается потомкам только от матери, а Y-хромосома наследуется только по отцовской линии.
Уникальные качества позволяют использовать мтДНК в качестве одного из основных инструментов в решении вопросов эволюционной, популяционной и медицинской генетики (Сапп et al., 1987; Wallace et al., 1999). Начиная с работ Денаро (Denaro et al., 1981), были описаны основные расовые и популяционно-специфические типы мтДНК и определены мутации, которые легли в основу определения гаплогрупп (Wallace et al.,
1999). В настоящее время номенклатура линий мтДНК основывается на синтезе данных о полиморфизме контрольного (гипервариабельные сегменты I и II) и кодирующего регионов мтДНК (Torroni et al., 1993, 1998; Macaulay et al., 1999; Richards et al., 1998; 2000; 2002 и др.). Стандартное описание полиморфизма митохондриальной ДНК в популяциях заключается в секвенировании гипервариабельных сегментов главного некодирующего участка мтДНК (D-петли) с дополнительным определением рестрикционных сайтов в кодирующей части митохондриального генома, что позволяет локализовать индивидуальный митохондриальный гаплотип.
Анализ генетического полиморфизма Y-хромосомы вошел в арсенал методов эволюционной генетики примерно на десятилетие позже, чем мтДНК, после того как был найден ряд выскоинформативных полиморфных локусов в ее нерекомбинантной части (Jobling, Tyler-Smith, 1995; 2000). Как и в случае с функциональными генами, представления о генетической бедности Y-хромосомы постепенно изменились. Сейчас в распоряжении исследователей значительное число маркеров различной природы. К настоящему времени на нерекомбинирующей части Y-хромосомы