Уровень молочной продуктивности коров голштинской породы черно-пестрой масти разных генотипов по локусам BoLA DRB 3 и каппа-казеина

• Автор: Мачульская, Елена Витальевна
• Шифр специальности: 06.02.01
• Научная степень: Кандидатская
• Год защиты: 2009
• Место защиты: Краснодар
• Количество страниц: 114 с. : ил.

СОДЕРЖАНИЕ

Введение

1. Обзор литературы

1.1. Генетические маркеры

1.2. Структура и полиморфизм гена ВоЬА главного комплекса

гистосовместимости.

1.3. Структура и полиморфизм гена каппа-казеина

1.4. Метод ПЦР

1.5. Молекулярно-генетические методы выявления

полиморфизма различных локусов.
2. Материал и методы исследования
2.1. Методика выделения ДНК из крови
2.2. Проведение полимеразной цепной реакции (ПЦР)
2.3. Анализ полиморфизма длин фрагментов рестрикции (ПДРФ)
2.4. Электрофорез
3. Собственные исследования
3.1. Отработка методических подходов к выделению ДНК из
спермы.
3.2. Оптимизация подходов для проведения массового 49 тестирования животных.
3.3. Частоты встречаемости аллелей и генотипов по гену ВоЬА
П1Ш 3 в исследуемом стаде.
3.4. Частоты встречаемости аллелей и генотипов по гену ВоЬА
БИВ 3 в группе выбывших по состоянию здоровья животных.
3.5. Качественные и количественные показатели молочной
продуктивности голштинских коров черно-пестрой масти и
их взаимосвязь с генотипом по гену ВоЬА БИВ 3.
3.6. Взаимосвязь генотипа по гену каппа-казеина и показателями
молочной продуктивности у голштинских коров чернопестрой масти.
3.7. Повышение частоты встречаемости оптимального в
хозяйственном отношении генотипа.
3.8. Экономическое обоснование исследований
4. Обсуждение результатов

Выводы
Предложения производству
Список литературы

ВВЕДЕНИЕ

Актуальность исследований
Мясная и молочная продуктивность, ростовые и репродуктивные качества, степень выраженности иммунного ответа контролируются у животных большим количеством различных генов. В настоящее время в мире активно ведется поиск участков генома, имеющих наибольшее влияние на хозяйственно-полезные признаки и иммунитет животных.
Зарубежными исследователями был выявлен ген BoLA DRB 3 (Bovine Leukocyte Antigens), который является одним из ключевых генов, определяющих первичный иммунный ответ организма на вирусные и бактериальные инфекции. Так, например, разные аллели этого гена играют не одинаковую роль в формировании устойчивости крупного рогатого скота к персистентному лимфоцитозу, вызываемому вирусом лейкоза (ВЛКРС) [Xu, Van Eijk, Park, 1993; Mirsky, Lewin, 1998; Mota et al., 2002; Nassiry, Shahroodi, Mosafer, 2005].
Показано, что животные, несущие аллели BoLA DRB 3*11, *23, *28 - У (устойчивые) не склонны к переходу лейкоза в стадию персистентного лимфоцитоза (в гематологическую стадию), а животные, несущие в своем генотипе аллели BoLA DRB 3*22, *24, *16, *8 Ч (чувствительные) -напротив, чаще других оказываются в выборке гематологических больных. Н (нейтральные) - аллели не ассоциируются ни с устойчивостью, ни с чувствительностью к персистентному лимфоцитозу.
В нашей стране Сулимова и др. [1995, 2000] провели исследования, профинансированные Фондом фундаментальных исследований Российской академии наук (проект 93-04-06136) и установили на большой выборке животных (п = 500) различных пород (черно-пестрой, айрширской и горбатовской) достоверную взаимосвязь между генотипом по гену BoLA DRB 3 и устойчивостью к лейкозу.

расшифрована. Следовательно, то количество информации о генах индивидуального организма, которое можно заложить в биочип, ограничено. Вся информация о генах и целых геномах различных организмов, известная на сегодняшний день, систематизируется и хранится в так называемых базах данных. Наиболее мощные биомедицинские базы данных созданы Национальным Центром Биотехнологической Информации, Европейским Институтом Биоинформатики (EMBL), Японским Национальным Институтом Генетики и Центром Биологической Информации (DDBJ). GenBank Национального Центра Биотехнологической Информации содержит информацию о 4 865 ООО нуклеотидных последовательностях. Эти базы данных являются составными частями Международного Нуклеотидного Банка Данных. Существуют и специализированные базы данных - IMAGE (Integrated Analysis of Genomes and their Expression), CGAP (Cancer Genome Anatomy Project), где депонируется не только информация о всех последовательностях генов человека, но и есть клоны, содержащие эти гены. EST (expressed sequence tag) последовательности человека находятся в базе данных dbEST
последовательности автоматически сравниваются системой UniGene и группируются в кластеры по признакам. Некоторые ETS последовательности соответствуют уже известным генам, но большая их часть представляют собой частично секвенированные новые гены. Большое количество EST
последовательностей идентифицировано институтом геномных исследований, Institute for Genomic Research). Американская коллекция тканевых культур располагает индивидуальными человеческими и мышиными TIGR клонами, включая клоны с открытыми рамками считывания нуклеотидной последовательности. Genome Systems (Сент Луис, США,) и Research Genetics (США, Хантсвил,) используют IMAGE клоны в производстве своих чипов. При этом учитываются следующие факторы, а именно рестрицированы ли клоны, то есть изолирована ли единичная клетка и секвенированы ли повторно клоны (потвержденные или непотвержденные клоны). Таким образом,
биогенетические базы данных, содержащие всю информацию