Молекулярно-генетическое изучение устойчивости к киле Brassica rapa L.

• Автор: Нгуен Минь Ли
• Шифр специальности: 06.01.05
• Научная степень: Кандидатская
• Год защиты: 2015
• Место защиты: Москва
• Количество страниц: 152 с. : ил.

ОГЛАВЛЕНИЕ

СПИСОК СОКРАЩЕНИЙ

ВВЕДЕНИЕ

ГЛАВА 1. ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ

1.1. Народнохозяйственное значение капусты пекинской

1.2. Кила капустных культур (возбудитель - Plasmodiophora brassicae Wor.)

1.2.1. Историческая справка

1.2.2. Систематика и биологическая характеристика Plasmodiophora brassicae Wor..

1.2.3. Симптомы килы

1.2.4. Жизненный цикл патогена

1.2.5. Методы борьбы с килой
1.2.6. Система дифференциации рас Р. brassicae
1.3. Селекция на устойчивость к киле у капустных культур
1.3.1. Селекция на устойчивость к киле вида В. гара
1.3.2. Селекция на устойчивость к киле В. oleracea
1.3.3. Селекция на устойчивость к киле В. napus
1.3.4. Селекция на устойчивость к киле Raphamis sativus
1.4. Маркер-опосредованный отбор в селекции на устойчивость к киле капустных культур
1.4.1. Молекулярные маркеры
1.4.2. Применение маркер - опосредованного отбора в селекционном процессе
1.4.3. Локусы устойчивости к киле видов Brassica и Raphanus
1.4.4. Клонирование локусов устойчивости к киле
1.5. Определение плоидности растений капустных культур подсчетом числа хлоропластов замыкающих клеток устьиц
ГЛАВА 2. ГЕНЕТИЧЕСКИЙ АНАЛИЗ УСТОЙЧИВОСТИ К КИЛЕ
2.1. Введение
2.2. Материал исследования
2.3. Методы исследования
2.4. Результаты и обсуждение
2.4.1. Изучение устойчивости линий капусты пекинской
2.4.2. Изучение генетики устойчивости инбредных линий европейского турнепса ЕСД04-05 и ЕСД
2.4.3. Изучение генетики устойчивости линий капусты пекинской 20-2сс 1-132 и Xa642DH, Кн70-1
2.5. Выводы
ГЛАВА 3. МАРКИРОВАНИЕ ГЕНОВ УСТОЙЧИВОСТИ К КИЛЕ
3.1. Введение
3.2. Материал исследования
3.3. Методы исследования
3.4. Результаты и их обсуждения
3.4.1. Оценка эффективности известных маркеров локусов устойчивости к киле на селекционных популяциях
3.4.2. Поиск RAPD маркера, тесно сцепленного с геном устойчивости к киле
3.4.3. Секвенирование и анализ последовательности RAPD маркера
3.4.4. Конвертирование RAPD маркера в SCAR маркер
3.4.5. Картирование гена устойчивости
3.4.6. Оценка эффективности маркера Tau_cBrCR
3.4.7. Использование маркера Таи cBrCR404 в селекции капусты белокочанной на устойчивость к киле
3.4.8. Скрининг маркеров известных локусов устойчивости к киле в селекционной коллекции
3.5. Выводы
ГЛАВА 4. ОПРЕДЕЛЕНИЕ ПЛОИДНОСТИ РАСТЕНИЙ КАПУСТНЫХ КУЛЬТУР МЕТОДОМ ПОДСЧЕТА ЧИСЛА ХЛОРОПЛАСТОВ В ЗАМЫКАЮЩИХ КЛЕТКАХ УСТЬИЦ
4.1. Введение
4.2. Материал исследования
4.3. Методы исследования
4.4. Результаты и обсуждение
4.4.1. Число хлоропластов в замыкающих клетках устьиц капусты пекинской (В. гара)
4.4.2. Число хлоропластов в замыкающих клетках устьиц рапса (В. парт)..
4.4.3. Число хлоропластов в замыкающих клетках устьиц капусты белокочанной (В. oleracea)
4.4.4. Число хлоропластов в замыкающих клетках устьиц отдаленных гибридов (В. rapa*B. napus)yB. oleracea)
4.4.5. Влияние температуры, стадии развития и срока созревания растений на число хлоропластов в замыкающих клетках устьиц
4.5. Выводы
ВЫВОДЫ
РЕКОМЕНДАЦИИ
СПИСОК ЛИТЕРАТУРЫ
ПРИЛОЖЕНИЯ

СПИСОК СОКРАЩЕНИЙ
ЕСД: европейская система дифференциаторов ЗКУ: замыкающая клетка устьиц ПЦР: полимеразная цепная реакция п. н,- пара нуклеотидов У Г: удвоенный гаплоид
AFLP: полиморфизм длин амплифицированных фрагментов, англ.
Amplified fragment length polymorphism
BSA: массовый сегрегационный анализ, англ. Bulked segregant analysis FAO: организация по продуктам питания и сельскому хозяйству при ООН, англ. Food and Agriculture Organization
ID: индекс болезни, англ. Disease index InDel: инсерция/делеция, англ. Insertions/Deletion
MAB: маркер-опосредованное беккросирование, англ. Marker-assisted
backcrossing
MAS: маркер-опосредованный отбор, англ. Marker assisted selection QTL: локус количественного признака, англ. Quantitative Trait Locus RAPD: случайно амплифицированная полиморфная ДНК, англ. Randomly

Amplified Polymorphic DNA
RELP: полиморфизм длин рестрикционных фрагментов, англ. Restriction Fragment Length Polymorphism
SCAR: Амплифицированный фрагмент известной последовательности, англ. Sequence Characterized Amplified Region
SNP: Однонуклеотидный полиморфизм, англ. Single nucleotide
polymorphism
SSR: простые повторяющиеся последовательности, англ. Simple sequence
repeat
STS: Меченный сайт последовательности, англ. Sequence-Tagged Site USDA: Сельскохозяйственное Торговое Представительство США, англ. United States Department of Agriculture.

Wakayama-01 в сочетании с Crrl (Hatakeyama К. et al., 2013). Таким образом, Crrl может играть важную роль в общей реакции устойчивости, а Сгг2 является лишь локусом-модификатором устойчивости к киле, контролируемой Crrl (Suwabe К. et al., 2006).
В 2007 г. С.Г. Монахос конвертировал RA12-75A(6so), сцепленный с локусом Crrl в SCAR маркер SCARp91F-SCARp636p с использованием потомства от скрещивания восприимчивой капусты пекинской с сортом европейского турнепса, однако при анализе потомств от скрещивания европейской (ECD04-1) и азиатской (JRT1-1) репы маркер не проявляет эффективность (Монахос С.Г., Игнатов А.Н. 2007).
При картировании локусов устойчивости выявлен еще один QTL локус Сгг4 в группе сцепления 06, который имеет слабое действие в контроле устойчивости (Suwabe К. et al., 2006).
С использованием сорта европейского турнепса Milan White в качестве донора устойчивости М. Hirai и др. в 2004 г. идентифицировал новый локус устойчивости с названием СггЗ, наследуемый доминантно и независимо от локусов Ctrl и Сгг2, а также создал два STS маркера OPC11-1S и OPC11-2S,
сцепленных с СггЗ (Hirai М. et al., 2004).
При использовании ECD02 в качестве источника устойчивости созданы RAPD маркер Е49«о и SCAR маркер HC352b-SCAR, сцепленные с геном устойчивости CRa. Этот локус картирован в группу сцепления R03 (Matsumoto Е.
et al., 2005; Hayashida N. et al., 2008; Piao Z. et al., 2009).
Z. Piao и другие авторы идентифицировали доминантный ген устойчивости CRb из сорта Gelria, контролирующий устойчивость к трем расам P. brassicae: 2, 4 и 8. На основе SCAR маркеров TCR09, TCR05, TCR01, TCR10, TCR08, TCR03 была создана генетическая карта размером 6,75 сМ (Piao Z. et al., 2004). Определено, что локус CRb локализован около одного конца хромосомы R03, где находится CRa, поэтому можно предположить, что эти локусы аллельны или тесно связаны между собой (Diederichsen Е. et al., 2009).
В 2008 г. в популяциях капусты пекинской были выявлены два локуса