Молекулярные механизмы пептидной регуляции функций поджелудочной железы при старении

• Автор: Тарновская, Светлана Игоревна
• Шифр специальности: 14.01.30, 03.03.04
• Научная степень: Кандидатская
• Год защиты: 2014
• Место защиты: Санкт-Петербург
• Количество страниц: 161 с. : ил.

ОГЛАВЛЕНИЕ
СПИСОК СОКРАЩЕНИЙ
ВВЕДЕНИЕ
ГЛАВА 1. ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ
1.1. Функциональная морфология поджелудочной железы при старении
1.2. Молекулярно-генетические механизмы дифференцировки клеток поджелудочной железы
1.2.1. Факторы дифференцировки клеток поджелудочной железы
1.3. Роль факторов пролиферации и апоптоза в функционировании клеток поджелудочной железы
1.4. Применение пептидных лекарственных препаратов в лечении сахарного диабета
1.5. Влияние аминокислот на клетки поджелудочной железы
1.6. Геропротекторное действие коротких пептидов
1.6.1. Влияние коротких пептидов на функции поджелудочной железы при старении
1.7. Предполагаемый механизм действия коротких пептидов
1.8 Виды взаимодействий лекарственных препаратов и белков с молекулой дезоксирибонуклеиновой кислоты
1.8.1. Взаимодействие лекарственных препаратов с дезоксирибонуклеиновой кислотой
1.8.2. Взаимодействие белков с дезоксирибонуклеиновой кислотой
Глава 2. МАТЕРИАЛЫ И МЕТОДЫ ИССЛЕДОВАНИЯ

2.1. Экспериментальные методы исследования
2.1.1. Пептидные биорегуляторы
2.1.2. Приготовление раствора пептидов для введения в культуры клеток поджелудочной железы
2.1.3. Методика органотипического культивирования клеток
2.1.4. Методика диссоциированного культивирования клеток
2.1.5. Иммуноцитохимическое исследование
2.1.6. Морфометрические исследования и компьютерный анализ микроскопических изображений
2.1.7. Метод количественного ПЦР-анализа
2.2. Физические методы исследования взаимодействия пептида КЕО^/ с молекулой дезоксирибонуклеиновой кислоты
2.2.1. Приготовление растворов дезоксирибонуклеиновой кислоты и пептида

2.2.2. Спектральные методы исследования
2.2.3. Вискозиметрия
2.3. Теоретические методы исследования комплексов дезоксирибонуклеиновой кислоты с пептидом
2.3.1. Моделирование оптимальной конформации пептидов
2.3.2. Расчет индекса гидрофобности пептидов
2.3.3. Анализ последовательностей генов и гистонов
2.3.4. Моделирование молекул дезоксирибонуклеиновых кислот и гистонов.
2.3.5. Докинг
2.4. Статистическая обработка результатов исследования
Глава 3. РЕЗУЛЬТАТЫ ЭКСПЕРИМЕНТАЛЬНЫХ ИССЛЕДОВАНИЙ ДЕЙСТВИЯ ПЕПТИДА КЕБУ НА ЭКСПРЕССИЮ СИГНАЛЬНЫХ МОЛЕКУЛ ПОДЖЕЛУДОЧНОЙ ЖЕЛЕЗЫ
3.1. Влияние пептида КЕИУ на ткань поджелудочной железы у молодых и старых крыс
3.2. Исследование действия пептида КЕИХУ на экспрессию факторов дифференцировки клеток поджелудочной железы при старении
3.2.1 Исследование действия пептида КЕЭШ на экспрессию Рйх
3.2.2 Исследование действия пептида КЕЮ¥ на экспрессию РгПа
3.2.3 Исследование действия пептида КЕБУ на экспрессию Рахб
3.2.4 Исследование действия пептида КЕЮШ на экспрессию Еоха
3.2.5 Исследование действия пептида КЕЮ¥ на экспрессию Ыкх2.
3.2.6 Исследование действия пептида КЕИХУ на экспрессию Рах
3.2.7 Исследование действия пептида КЕЭ¥ на экспрессию НохаЗ
3.2.8 Исследование действия пептида КЕЭ’'У на экспрессию Схс
3.2.9 Исследование действия пептида КЕЭШ на экспрессию генов факторов дифференцировки клеток поджелудочной железы
3.3. Экспрессия факторов пролиферации и апоптоза в клетках поджелудочной железы
3.3.1 Исследование действия пептида КЕЭ¥ на экспрессию проапоптозного

взаимодействия образуются вандерваальсовые связями между системой 71-электронов красящей молекулы и гетероциклического кольца оснований, и ионными силами положительно заряженных атомов азотов акридинового красителя и кислорода фосфатной группы ДНК [Lerman L.S., 1963]. Спустя некоторое время другие исследователи подтвердили эту модель с помощью метода рентгеноструктурного анализа на комплексах акридинового красителя с динуклеотид-монофосфатами [Neville D.M., 1966]. Такой же механизм действия был установлен для аналога акридинового красителя, профлавина, который обладает дезинфицирующим действием и убивает многие грамположительные бактерии [Westhof Е. et al., 1980]. Профлавин интеркалирует в ДНК между азотистыми основаниями С-G или G-С пар нуклеотидов. После встраивания профлавина расстояние между азотистыми основаниями увеличивается, что приводит к делеции или инсерции пар оснований во время репликации ДНК. К интеркалирующим веществам также относятся адриамицин, аклацитомицип и актиномицин [Patel D.J. 1974; Takahashi S. et al., 1986].
t.8.1.2. Лекарственные препараты взаимодействующие с бороздкой дезоксирибонуклеиновой кислоты
Двухспиральная структура ДНК образует большую и малую бороздки, которые имеют разную ширину и длину (2,1 □ и 1,2 □). Природные антибиотики, к которым относятся нетропсин и дистамицин, связываются с малой бороздкой ДНК в AT-богатой области своими положительно заряженными боковыми группами [Coll М. et al., 1987; Bailly С., Chaires J.B., 1998]. Такое взаимодействие стабилизируется водородными связями, электростатическими и вандерваальсовыми взаимодействиями. Эти вещества не могут связываться с GC последовательностями, так как ГЛТ группа гуанина вытесняет их из малой бороздки. Взаимодействие антибиотиков с малой бороздкой приводит к изменению копланарности пар нуклеоидов и нарушению ее структуры. Кристаллическая структура комплекса нетропсина с додекамером ДНК была расшифрована Дикенсоном и соавторами [Корка М.L., 1985; Clark G.R. et al.,