Видовой состав и структура популяций возбудителей фитофтороза и альтернариоза картофеля и томата

• Автор: Еланский, Сергей Николаевич
• Шифр специальности: 03.02.12
• Научная степень: Докторская
• Год защиты: 2012
• Место защиты: Москва
• Количество страниц: 325 с. : ил.

ОГЛАВЛЕНИЕ
Введение

Часть 1. Глава 1. Обзор литературы

Часть 2. Глава 2. Материалы и методы

Часть 3. Результаты и их обсуждение

Глава 3. Систематическое положение возбудителя

фитофтороза картофеля и томата

Глава 4. Анализ независимых маркерных

признаков P. infestans

Глава 5. Генотипический анализ популяций

Глава 6. Изучение ооспорообразования в

природных популяциях P. infestans
Г лава 7. Устойчивость к фунгицидам
Глава 8. Вирулентность к сортам картофеля и томата
Глава 9. Оценка агрессивности при реципрокных заражениях картофеля и томата в
лабораторных условиях
Глава 10. Развитие P. infestans на диких Licopersicon
hirsutum в Московской области
Глава 11. Возможные механизмы изменчивости
популяций P. infestans
Глава 12. Особенности развития фитофтороза
В России
Глава 13. Видовой состав возбудителей альтернариоза
Глава 14. Устойчивость возбудителей
альтернариоза к фунгицидам
Глава 15. Разработка праймеров, позволяющих дифференцировать разные виды рода Alternaria
Заключение
Выводы

Благодарности
Список работ, опубликованных по теме диссертации
Список цитированной литературы
Приложения
Приложение 1. Типы спаривания исследованных
изолятов P. infestons
Приложение 2. Спектры изоферментов пептидазы
исследованных изолятов P. infestons
Приложение 3. Гаплотипы митохондриальной ДНК
протестированных изолятов P. infestons
Приложение 4. Встречаемость ооспор в пораженных
фитофторозом образцах
Приложение 5. Устойчивость изолятов
P. infestons к металаксилу
Приложение 6. Определенные последовательности
нуклеотидов штаммов AIternaria sp

Введение.
Картофель - одна из наиболее распространенных столовых и технических культур в мире. В России по потреблению на душу населения картофель обгоняет другие культуры, включая зерновые. Кроме прямого потребления в пищу в виде вареных, печеных и жареных клубней, употребляются и продукты его переработки в виде картофельной муки, пюре и чипсов. Картофельная мука, обогащенная витаминами и специфическими биодобавками используется как основа для детского, диетического и лечебного питания, является одним из основных компонентов популярной в наше время безглютеновой диеты; широко применяется она и в производстве кормов для домашних животных. Существуют сорта с повышенным содержанием белка, перспективные для производства кормов для животных; сорта с окрашенной мякотью, из которых получают природные красители, обладающие антиоксидантными свойствами. Одним из основных направлений использования картофеля является его переработка на спирт, используемый, прежде всего, для моторного топлива, и крахмал, также имеющий очень широкую область применения в пищевой, бумажной, фармакологической, нефтегазовой отраслях промышленности. Имеется опыт использования картофеля для получения съедобных вакцин. Картофель может сорбировать из почвы разнообразные вещества, в том числе находящиеся в крайне малых концентрациях. Его используют также для получения некоторых витаминов.
К настоящему времени накоплен большой опыт возделывания картофеля в самых разных агроклиматических зонах. При этом практически повсеместно признается, что наибольшие сложности в работе с картофелем создают патогенные организмы и паразиты, вредящие картофелю как во время вегетации, так и при хранении. Возбудители болезней не только снижают урожай, ухудшают внешний вид, лёжкость и вкус клубней, но и
малоинформативным. Метод перспективен при использовании в комплексе с другими маркерами (Elansky, Smirnov 2003).
Для более быстрого определения типов спаривания предпринимались попытки выявления участков генома, связанных с типом спаривания, с целью их дальнейшего использования для определения типа спаривания методом ПЦР. Одними из первых успешный эксперимент по выявлению подобного участка провели американские исследователи (Judelson et al., 1995). С использованием метода RAPD они смогли идентифицировать регион W16, связанный с типом спаривания у потомков двух скрещиваемых изолятов, и сконструировать пару 24-нуклеотидных праймеров для его амплификации (W16-1 (5 '-ААС ACGC AC AAGGC AT AT АААТ GTA-3') и W16-2 (5'-GCGTAATGTAGCGTAACAGCTCTC-3'). После рестрикции ПЦР-продукта с помощью рестриктазы НаеIII удавалось разделить изоляты с типами спаривания А1 и А2.
Другая попытка получить ПЦР-маркеры для определения типов спаривания была предпринята корейскими исследователями (Kim, Lee, 2002). Идентификацию специфических продуктов они проводили с использованием метода AFLP. В результате была разработана пара праймеров PHYB-1 (forward) (5 '-GATCGGATT AGTC AGACGAG-3') и PHYB-2 (5'-GCGTCTGCAAGGCGCATTTT-3'), позволяющие избирательно амплифицировать участок генома, связанный с А2 типом спаривания. В дальнейшем (Kim et al., 2005) они продолжили эту работу и сконструировали праймеры 5'-AAGCTATACTGGGACAGGGT-3' (INF-1, forward) и 5'-GCGTTCTTTCGTATTACCAC-3' (INF-2), позволяющие избирательно амплифицировать участок генома Mat-Al, характерный для штаммов с типом спаривания А1. Использование ПЦР-диагностики типов спаривания показало хорошие результаты при исследовании популяций из Чехии (Mazakova et al., 2006), Туниса (Jmour, Hamada, 2006) и других регионов. В нашей работе мы метод ПЦР для определения типов спаривания не использовали.