Экология бактерий рода Rhodococcus из глубоководных битумных построек озера Байкал

• Автор: Лихошвай, Александр Викторович
• Шифр специальности: 03.02.08
• Научная степень: Кандидатская
• Год защиты: 2011
• Место защиты: Иркутск
• Количество страниц: 95 с. : ил.

ОГЛАВЛЕНИЕ
Введение

Глава 1. Обзор литературы

1.1. Распространение районов естественных выходов нефти в водных экосистемах

1.2. Бактерии рода Югойососсиз, осуществляющие деструкцию углеводородов

1.3. Биосурфактанты, синтезируемые бактериями рода Л/гоососсш'

1.4. Ферментативное и генетическое обоснование деградации углеводородов представителями рода Т?/гой?ососсц5

1.5. История изучения нефтепроявлений на озере Байкал

1.6. Исследование биодеструкции углеводородов

Глава 2. Экологическая и микробиологическая характеристика района мыса Горевой Утёс

2.1. Состав байкальской нефти и битумных построек

2.2. Состав микробного сообщества в районе мыса Горевой Утёс
Глава 3. Объекты и методы исследования
Глава 4. Химическое и микробиологическое исследование битума неактивной постройки
4.1. Химический состав постройки №8
4.2. Анализ суммарного микробного сообщества битумных построек на основе пиросеквенирования
4.3. Исследование экологических, физиолого-биохимических и морфологических характеристик штаммов, выделенных из битумной постройки №8
4.4. Филогенетическая принадлежность выделенных штаммов на
основании анализа структуры гена 16Б рРНК
Глава 5. Идентификация генов у выделенных штаммов Шос1ососси$ егуЛгороИя, участвующих в деструкции и-алканов

5.1. Исследование а1к-генов у выделенных штаммов Шойососст егу1кгороИ$
5.2. Полногеномное секвенирование пШ?-генов штамма №4
Глава 6. Исследование выделенных штаммов Шюс1ососст егу(кгороИз в лабораторных условиях
6.1. Биодеградация и-алканов выделенными штаммами в лабораторных условиях
6.2. Анализ гликолипидов, продуцируемых штаммом Якойососсш
егугороШ №4
Заключение
Выводы
Список литературных источников

ВВЕДЕНИЕ
Актуальность проблемы. Бактерии рода Rhodococcus, относящиеся к филуму Actinobacteria, семейству Nocardiaceae, обитают в почве, соляных шахтах, антарктических льдах, морских осадках, сточных водах и многих других экосистемах (Construction of eco-collection
В озере Байкал при исследовании поверхностных вод в районе естественных нефтепроявлений у м. Горевой Утёс и близ устья р. Большая Зеленовская культивированием было выявлено микробное сообщество с доминированием бактерий-деструкторов нефти из родов Pseudomonas, Micrococcus и Rhodococcus. В отличие от других бактерий, родококки были найдены не только в нефти на водной поверхности, но и в донных осадках того же района (Сравнительная характеристика
Открытие на дне Байкала в районе м. Горевой Утёс битумных построек при погружениях глубоководных обитаемых аппаратов (ГОА) «Мир» в 2008 г., в которых участвовал автор настоящей работы, инициировало исследования по изучению механизмов их образования и деструкции

2.2. Состав микробного сообщества в районе мыса Горевой Утёс
Интерес к бактериям, способным окислять углеводороды нефти, связан с распространением в окружающей среде нефтепродуктов. В наше время с увеличением нефтедобычи и, как следствие, роста разливов углеводородов, изучение углеводородокисляющих микроорганизмов приобретает особое значение. Как показали недавние события, последствия техногенных катастроф при добыче и транспортировке нефтепродуктов могут быть весьма трагичными (MacDonald, 2010; Perte totale suite à avarie
Процесс окисления углеводородов бактериями весьма распространён в природе, и многие бактерии могут использовать их в качестве единственного источника углерода, как в морских, так и в пресноводных экосистемах (Жуков и др., 2006; Bioremidiation of coastal
Для бассейна Байкала С.Д. Талиев пытался определить методы диагностики источников углеводородов и установить, как микроорганизмы реагируют на них (Углеводородокисляющие микроорганизмы