Функциональная структура бактериоценозов урбопочв г. Ростова-на-Дону

• Автор: Горовцов, Андрей Владимирович
• Шифр специальности: 03.02.08
• Научная степень: Кандидатская
• Год защиты: 2013
• Место защиты: Ростов-на-Дону
• Количество страниц: 148 с. : ил.

СОДЕРЖАНИЕ
Введение
Глава 1. ХАРАКТЕРИСТИКА ПОЧВ ГОРОДСКИХ ТЕРРИТОРИЙ И ДЕЙСТВУЮЩИХ НА НИХ АНТРОПОГЕННЫХ ФАКТОРОВ

1.1. Урбаноземы

1.2. Антропогенные факторы, действующие на урбаноземы

1.2.1. Загрязнение почв

1.2.1.1 Загрязнение почв тяжелыми металлами

1.2.1.2 Загрязнение почв неметаллами

1.2.1.3 Загрязнение почв органическими веществами

1.2.2. Нарушение физико-механических параметров почвы

1.2.3. Микробиологические методы оценки уровня загрязнения почв
1.3. Микрофлора урбаноземов
1.3.1. Аминогетеротрофы
1.3.2. Аминоавтотрофы
1.3.2.1 Азотфиксаторы
1.3.2.2 Нитрификаторы
1.3.3. Олиготрофы
1.3.4. Актиномицеты
Глава 2. ОБЪЕКТЫ И МЕТОДЫ ИССЛЕДОВАНИЯ
2.1 Объекты исследования
2.2. Методы исследования
2.2.1. Подготовка почвенных проб к микробиологическому анализу
2.2.2. Метод учета колоний на твердых питательных средах
2.2.3. Метод учета колоний на жидких питательных средах
2.2.4. Методы учета основных эколого-трофических групп микроорганизмов
2.2.4.1 Учет аммонифицирующих бактерий
2.2.4.2 Учет бактерий, использующих минеральные формы азота и актиномицетов
2.2.4.3 Учет педотрофных бактерий и актиномицетов

2.2ЛЛ Учет олиготрофных бактерий
2.2.4.5 Учет олигонитрофильных бактерий
2.2.4.6 Учет денитрифицирующих микроорганизмов
2.2.4.7 Учет анаэробных азотфиксаторов Clostridium pasteurianum
2.2.4.8 Учет нитрифицирующих бактерий
2.2.4.9 Учет почвенных цианобактерий
2.2.4.10 Метод селективного выделения грамотрицательных форм бактерий на средах МПА и КАА
2.2.4.11 Определение обилия бактерий p. Azotobacter
2.2.5. Метод расчета основных коэффициентов, отражающих структуру микробоценоза почвы
2.2.6. Методы родовой и видовой идентификации почвенных бактерий
2.2.6.1 Определение принадлежности по Граму
2.2.6.2. Окраски спор по Цилю
2.2.6.3 Выявление каталазной активности
2.2.6.4 Выявление оксидазной активности
2.2.6.5 Постановка реакции Фогес-Проскауэра
2.2.6.6 Выявление лецитиназной активности
2.2.6.7 Выявление амилазной активности
2.2.6.8 Выявление уреазной активности
2.2.6.9 Выявление желатиназной активности
2.2.6.10 Выявление нитратредуктазной активности
2.2.6.11 Выявление устойчивости к 7% NaCl
2.2.6.12 Установление способности к поглощению цитрата
2.2.6.13 Определение типа расщепления глюкозы (тест Хью-Лейфсона)
2.2.6.14 Установление способности к анаэробному росту
2.2.6.15 Установление способности к образованию кислоты газа из
углеводов и сахароспиртов
2.2.6.16 Постановка тест-систем API® strips bio Mérieux
2.2.7. Методы статистической обработки данных
2.2.8. Дискодиффузионный метод определения токсичности тяжелых металлов

2.2.9, Методы определения содержания гумуса, pH и валовых форм тяжелых металлов в исследуемых образцах почвы
2.2.10. Определение актуальной влажности почвы
Глава 3. КОЛИЧЕСТВЕННЫЕ ХАРАКТЕРИСТИКИ МИКРОБОЦЕНОЗОВ УРБОПОЧВ Г. РОСТОВА-НА-ДОНУ
3.1. Количественные характеристики микробоценозов почв в весенний период
3.2. Количественные характеристики микробоценозов почв в летний период
3.3. Количественные характеристики микробоценозов почв в осенний период
3.4. Сезонная динамика и показатели структуры микробоценозов городских почв...90 Глава 4. КАЧЕСТВЕННЫЙ СОСТАВ МИКРОБОЦЕНОЗОВ УРБОПОЧВ Г. РОСТОВА-НА-ДОНУ
4.1. Характеристика часто встречающихся родов и видов в составе микробоценозов урбопочв
4.2. Секционная структура и видовой состав актиномицетного комплекса городских

Глава 5. ДЕЙСТВИЕ ТЯЖЕЛЫХ МЕТАЛЛОВ НА МИКРОБОЦЕНОЗЫ УРБОПОЧВ Г. РОСТОВА-НА-ДОНУ
5.1. Содержание тяжелых металлов в исследованных почвах
5.2. Влияние тяжелых металлов на микробоценоз урбопочв
5.3. Оценка токсичности тяжелых металлов по отношению к актиномицетам,
выделенным из городских почв
ВЫВОДЫ
СПИСОК ИСПОЛЬЗОВАННЫХ ЛИТЕРАТУРНЫХ ИСТОЧНИКОВ

соединений предварительно переводят их в аммиак и из аммиака синтезируют аминокислоты. Аммиак, как восстановленная форма азота в клетке, довольно легко преобразуется в аминогруппы. Но надо иметь в виду, что многие виды бактерий этой группы не развиваются на готовых аммиачных солях, так как эти соли обладают большой физиологической кислотностью, pH цитоплазмы слишком сильно снижается. Мочевина -простейшее органическое соединение - также сначала расщепляется на аммиак и углекислоту. Аминоавтотрофы могут сами синтезировать все необходимые им аминокислоты из простых источников углерода, азота, серы. В научной литературе имеется крайне мало сведений об особенностях экологии данной группы микроорганизмов, несмотря на то, что они широко представлены в микробоценозах почв. Так, A.A. Танасиенко с соавторами указывают, что аминоавтотрофы составляют доминирующую группу в снежных массах пригородной зоны г. Новосибирска (Танасиенко и др., 1999), что косвенно иллюстрирует их обилие в городской среде. Показано также преобладание данной группы микроорганизмов в сильно нарушенных песчаных почвах вблизи шахтных выработок, причем авторы связывают это с преобладанием минеральных форм азота в исследуемых почвах (Rasulic, 1998).
1.3.2.1. Азотфиксаторы
Баланс доступного растениям азота в биосфере поддерживается за счет деятельности особой группы организмов - так называемых азотфиксаторов. Данные микроорганизмы для восстановления азота используют целую серию ферментов (ферредоксин, гидрогеназа), важнейшим из которых является нитрогеназа (Умаров, Кураков, 2007).
Один из наиболее распространенных в почве родов азотфиксирующих микроорганизмов - Azotobacter. Данный микроорганизм имеет крупные клетки овальной формы, диаметром 1,5-2,0 мкм, плеоморфные, от палочковидных - до кокковидных. Располагаются клетки одиночно, парами или группами неправильной формы, иногда в виде цепочек разной длины. Эндоспор не образуют, но образуют цисты. Микроорганизмы данного рода грамотрицательные, подвижные за счет перитрихиальных жгутиков или неподвижные. Являются аэробами, но могут также расти при пониженном парциальном давлении кислорода. У всех видов некоторые штаммы продуцируют водорастворимые и