Популяционно-генетическая адаптация человека к природным и антропогенным факторам среды

• Автор: Боринская, Светлана Александровна
• Шифр специальности: 03.02.07
• Научная степень: Докторская
• Год защиты: 2013
• Место защиты: Москва
• Количество страниц: 190 с. : ил.

Оглавление
1. ВВЕДЕНИЕ

Характеристика популяционно-генетических исследований в целом

Актуальность исследования

Цели и задачи исследования

Научная новизна

Практическая значимость

Основные положения, выносимые на защиту

Апробация работы

Формальные характеристики работы

2. Материалы и методы

2.1. Материалы
2.2. Определение минеральной плотности кости
2.3. Определение фенотипа гиполактазии
2.4. Молекулярно-генетические методы
2.5. Этнографические описания
2.6. Статистические методы и филогенетический анализ
2.7. Выбор объектов исследования - гены АРОЕ, ЬСТ, ССИ5, АОН1В, АЕОН2
3. Ген аполипопротеина Е АРОЕ, аллели е2, еЗ, е
3.1. Обзор литературы. Функции и генетический полиморфизм
аполипопротеина Е
3.2. Определение частот аллелей и генотипов по гену АРОЕ в популяциях
России и сопредельных стран
3.3. Характеристика географического распределения частот аллелей гена
АРОЕ в популяциях мира
3.4. Связь частот аллелей гена АРОЕ с типом хозяйства
3.5. Особенности эволюции АРОЕ у человека и других приматов
3.5.1. Анализ замен аминокислот в линиях приматов
3.5.2. Ускоренная эволюция АРОЕ М-домена в линии человека
4. Ген лактазы ЕСТ, полиморфизм -13910С/Т
4.1. Обзор литературы. Генетическая детерминация наследственной лактазной

недостаточности (гиполактазии)
4.2. Исследование ассоциации генотипа С/С полиморфизма ЬСТ*С/Т-13910 с фенотипом гиполактазии в выборке добровольцев
4.3. Определение частот аллелей и генотипов по локусу С/Г-13910 в
исследуемых популяционных выборках
4.4. Корреляция частот генотипа С/С и фенотипа гиполактазии в популяциях Евразии
4.5. Потребление молока и молочных продуктов носителями разных
генотипов
4.6. Связь потребления молока с МПК
4.7. Связь частоты потребления молока с МПК у носителей разных генотипов
по полиморфизму ЬСТ*С/Т-13
4.8. Корреляция частот персистенции лактазы с этнографическими характеристиками
5. Ген хемокинового рецептора ССЯ5, аллель ССЯ5йе
5.1. Обзор литературы. Полиморфизм гена С СИ 5 и гипотезы о
происхождении и распространении аллеля ССЯ5Ве
5.2. Экспериментальное определение частот аллеля ССЯ5юМе132 в
избранных популяциях
5.3. Распределение частот аллеля ССЯ5с1е132 в популяциях Евразии
5.4. Анализ возможных факторов формирования распределение частот аллеля ССЯ5йе132 в популяциях Евразии
5.5. Протективный эффект ССЯ5с1е132 в отношении ВИЧ:
исследование случая фокусной нозокомиальной ВИЧ-инфекции и мета-анализ
6. Гены, контролирующие метаболизм алкоголя: АОН1В и АІЛН
6.1. Обзор литературы. Полиморфизм генов АйН и АЬОН и их
популяционно-генетические исследования
6.1.1. Метаболизм этанола в организме человека
6.1.2. Полиморфизм генов метаболизма этанола и номенклатура аллелей
6.1.3. Популяционные исследования частот аллелей генов АОНІВ и АЬБН2
6.1.4. Структура гаплотипов локуса АПН
6.2. Экспериментальное определение частот аллелей и генотипов гена альдегиддегидрогеназы А1Л9Н2*аи504Ьув в исследуемых популяциях

6.3. Анализ географического распределения частот аллеля АЬОН2*504Ьу$
в популяциях мира
6.4. Экспериментальное определение частот аллелей и генотипов гена алкогольдегидрогеназы АВН1В *А^48Шй в исследуемых популяциях
6.5. Анализ географического распределения частот аллеля АОН1В*47Шз в популяциях мира
6.6. Исследование фенотипического проявление аллеля АЯЯ77?*48ЯА
6.7. Сопоставление географического распределения частот аллелей АОЯ77?*48Ям и АЬБН2*504Ьуз и возможные факторы отбора
Заключение
Выводы
Благодарности
Литература

Рис. 11. Отличия внутримолекулярного взаимодействия аминокислотных остатков 61 и 112 в изоформах АРОЕЗ и АРОЕ4. В изоформе ЕЗ между остатками Arg61 и Glul09 образован солевой мостик (показан точками). Этот мостик разрушаете я в изоформе £4 за счет взаимодействия Glul09 с Arg-112 в изоформе е4. Модель построена на основе данных рентгеноструктурного анализа N-домена (обсуждение и ссылки в [Mahley, Rail, 2000]).
Рис. 12. Модель трехмерной структуры белка АРОЕ по данным NMR.
N-домен АРОЕ показан синим, С-домен - розовым, связующий участок - зеленым. Согласно NMR-исследованиям, Arg-61 взаимодействует с Thr-194 (показано красной стрелкой). Позиция 112 (полиморфизм Arg->Cys, соответствующий АРОЕЗ и АРОЕ4 ) показан красным кружком (по (Chen et al., 2011 ]).