Анализ генетической структуры буденновской породы лошадей по локусам полиморфных систем крови и микросателлитов ДНК

• Автор: Курнявко, Наталья Юрьевна
• Шифр специальности: 03.02.07
• Научная степень: Кандидатская
• Год защиты: 2012
• Место защиты: Дивово
• Количество страниц: 141 с. : ил.

Содержание

Список сокращений

1. Введение

2. Обзор литературы

2.1. Характеристика буденновской породы лошадей

2.2. Линейная структура буденновской породы лошадей

2.3. Генетический полиморфизм. Основные сведения и биологическая

роль

2.3.1. Системы групп крови

2.3.2. Генетический полиморфизм систем эритроцитарных

антигенов лошадей
2.3.3. Генетический полиморфизм белков и ферментов крови у лошадей
2.4. Использование полиморфизма систем белков и групп крови в селекции и при контроле происхождения и идентификации лошадей
2.4.1. Использование генетического полиморфизма в селекции
животных
2.5. Молекулярно-генетические методы и их использование
в животноводстве
2.5.1. ДНК-микросателлиты и их использование в коневодстве
3. Материал и методика исследований
3.1. Объект исследований
3.2.Методы исследований
3.3. Генетико-популяционный анализ
3.4. Статистический анализ
4. Результаты собственных исследований
4.1. Особенности аллелофонда буденновской породы лошадей по
локусам полиморфных систем крови и микросателлитов ДНК
4.1.1. Особенности аллелофонда буденновской породы лошадей
по полиморфным системам крови

4.1.2. Особенности аллелофонда буденновской породы лошадей по локусам микросателлитов ДНК
4.2. Ретроспективный анализ аллелофонда лошадей буденновской
породы лошадей по полиморфным системам крови
4.3. Оценка внутрипородной дифференциации лошадей
буденновской породы
4.3.1. Генетические различия между заводскими субпопуляциями
4.3.2. Генетическая дифференциация линейной структуры в буденновской породе лошадей
4.4. Генетическая характеристика буденновских лошадей с
разной степенью кровности по чистокровной верховой породе
4.5. Характеристика генетических особенностей буденновских
лошадей с разной скаковой работоспособностью
4.6. Эффективность контроля происхождения и идентификации лошадей по локусам полиморфных систем крови и микросателлитов
5. Обсуждение результатов
6. Выводы
7. Предложения производству
Список литературы
Приложение
Список сокращений
Tf- Transferrin, трансферрин Al - Albumin, альбумин Es - Esterase, эстераза EAD - D система групп крови
ПЦР (PCR) - polymerase chain reaction, полимеразная цепная реакция STR - short tandem repeat, короткие тандемные повторы SSR- simple sequence repeat, простые повторяющиеся последовательности п.о. - пары оснований
SCID - Severe combined immunodeficiency disease, острый комбинированный иммунодефицит
HYPP - Hyperkaliemic periodic paralysis, периодический паралич лошадей QTL - Quantitative Trait Loci’s - локус количественных признаков Comparison Test - тест сравнения результатов тестирования ISAG - International Society of Animal Genetics, Международное сообщество по генетике животных
ПДРФ (RFLP) - restriction fragment length polymorphism, полиморфизм длин
рестрикционных фрагментов
ГПК - Государственная племенная книга
к/з - конный завод
им. - имени
Чкв - чистокровная верховая порода
Ч.вл. - частный владелец
хх - международное обозначение чистокровной верховой породы (ставится после клички)

меченым зондом. Так как рестрицирующие эндонуклеазы имеют строго специфические места расщепления, то генетические различия в нуклеотидной последовательности ДНК между индивидуумами (т.е. полиморфизм на уровне ДНК) приведут к различному распределению сайтов рестрикции вдоль соответствующих молекул ДНК и получению продуктов рестрикции, в которых длина гомологичных фрагментов будет различаться. Таким образом, полиморфизм ДНК будет тестироваться как ПДРФ [117, 119]. Например, у свиней на сегодня описано более 20 маркеров типа I, сцепленных с генами хозяйственно-полезных признаков свиней [11,-21, 124, 176]. Маркеры типа II базируются на повторяющихся последовательностях, отличающихся высокой степенью полиморфизма. Такие повторяющиеся последовательности могут быть разделены на два класса: диспергированные последовательности и тандемные повторы. Диспергированные последовательности в зависимости от длины классифицируют на два подкласса: длинные интерсперсионные элементы (I ЛЫЕв) длиной до 6-7 тысяч п.о. и короткие интерсперсионные элементы (ЗПМЕэ) длиной менее 500 п.о. Функции этих элементов пока еще до конца не выяснены [44, 51].
Тандемные повторы - это повторения определенных последовательностей в ориентации «голова к хвосту», эти последовательности получили название сателлитов [51, 66]. Так как число тандемных копий в сателлитах сильно варьирует, они нашли применение в качестве высокоинформативного генетического маркера у сельскохозяйственных животных. Число повторов у различных животных сильно варьирует и характеризуется степенью гетерозиготности более 90%. В зависимости от длины повторяющихся участков их подразделяют на несколько классов: макси-, мини-, микросателлиты [67]. Наибольшее распространение для определения генетического полиморфизма нашли микросателлиты. Это фрагменты ДНК различной длины, образующихся вследствие различного числа копий очень коротко повторяющихся последовательностей, ограниченных с обеих сторон однокопийными