Развитие бактерий и грибов в черноземе при разных уровнях аэрации

• Автор: Горбачева, Мария Александровна
• Шифр специальности: 03.02.03
• Научная степень: Кандидатская
• Год защиты: 2013
• Место защиты: Москва
• Количество страниц: 135 с. : ил.

ОГЛАВЛЕНИЕ
ВВЕДЕНИЕ

ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ

ГЛАВА 1 СПЕЦИФИКА РАЗВИТИЯ БАКТЕРИЙ И ГРИБОВ В ПОЧВЕ

ГЛАВА 2 СПЕЦИФИКА РАЗЛОЖЕНИЯ ХИТИНА МИКРООРГАНИЗМАМИ В ПОЧВЕ ПРИ РАЗНЫХ УРОВНЯХ АЭРАЦИИ

2 1 Хитин — один из наиболее распространенных полимеров в природе

2 2 Механизм деградации хитина в природе

2 3 Микроорганизмы, разлагающие хитин

ГЛАВА 3 РАСПРОСТРАНЕННОСТЬ МЕЛКИХ ФОРМ БАКТЕРИЙ В ПРИРОДЕ

ЭКСПЕРИМЕНТАЛЬНАЯ ЧАСТЬ

ГЛАВА 4 ОБЪЕКТЫ И МЕТОДЫ ИССЛЕДОВАНИЯ
4 1 Почва
4 2 Методика инкубации почвенных образцов
4 3 Методика проверки анаэробных условий
4 4 Методика определения численности и биомассы микроорганизмов методом
люминесцентной микроскопии
4 5 Методика учета численности бактерий с помощью метода «каскадной» фильтрации
4 6 Методика оценки жизнеспособности клеток бактерий т situ
4 7 Изучение морфологии и структуры клеток бактерий in situ
ГЛАВА 5 СПЕЦИФИКА РАЗВИТИЯ МИКРООРГАНИЗМОВ В ЧЕРНОЗЕМЕ ТИПИЧНОМ (ЦЕЛИНА) ПРИ ВНЕСЕНИИ ХИТИНА В АЭРОБНЫХ И АНАЭРОБНЫХ УСЛОВИЯХ ПРИ ТЕМПЕРА ТУРЕ ИНКУБАЦИИ 18°С
5 1 Бактерии
5 2 Актиномицеты
5 3 Грибы
5 4 Споры грибов
5 5 Биомасса мицелия и спор грибов
5 6 Доля прокариот
ГЛАВА 6 СПЕЦИФИКА РАЗВИТИЯ МИКРООРГАНИЗМОВ В ЧЕРНОЗЕМЕ ТИПИЧНОМ (ЦЕЛИНА И ПАШНЯ) ПРИ ВНЕСЕНИИ ХИТИНА В АЭРОБНЫХ И АНАЭРОБНЫХ УСЛОВИЯХ ПРИ ТЕМПЕРА ТУРЕ ИНКУБАЦИИ 28°С
6 1 Чернозем типичный (целина)
611 Бактерии
612 Грибы
6 2 Чернозем типичный (пашня)
6 2 1 Бактерии
6 2 2 Грибы
6 3 Отклик разных групп микроорганизмов в черноземе типичном (целина) при температуре инкубации 18°С
6 4 Отклик разных групп микроорганизмов в черноземе типичном (целина) при температуре инкубации 28°С
6 5 Отклик разных групп микроорганизмов в черноземе типичном (пашня) при температуре инкубации 28°С
6 6 Факторный анализ
6 7 Оценка жизнеспособности почвенных бактерий в типичном черноземе (целина и пашня) с помощью красителя LIVEADEAD (L7012) при температуре инкубации 28 °С

ГЛАВА 7. СПЕЦИФИКА РАЗВИТИЯ БАКТЕРИЙ В ЧЕРНОЗЕМЕ ТИПИЧНОМ (ПАШНЯ) ПРИ ВНЕСЕНИИ ХИТИНА В АЭРОБНЫХ И АНАЭРОБНЫХ УСЛОВИЯХ С ПОМОЩЬЮ МЕТОДА «КАСКАДНОЙ» ФИЛЬТРАЦИИ ПРИ ТЕМПЕРАТУРЕ ИНКУБАЦИИ 28°С
7.1. Динамика численности бактерий по их размерам во всех слоях горизонта Айв горизонте В чернозема типичного (пашня)
7.2. Динамика общей численности всех групп бактерий по их размерам в ходе микробной сукцессии в аэробных и анаэробных условиях
7.3. Распределение бактерий по их размеру на всех стадиях микробной сукцессии..
7.4. Изучение морфологии и структуры клеток бактерий in situ
7.5. Доля (%) биомассы доминирующих групп бактерий (>0,43 и >0,38 мкм)
7.6. Общая биомасса бактерий
7.7. Объем и диаметр бактериальных клеток
ЗАКЛЮЧЕНИЕ
ВЫВОДЫ
ЛИТЕРАТУРА

ВВЕДЕНИЕ
Актуальность работы
Почва с микробиологической позиции представляет собой гетерогенную среду и не может рассматриваться как единая однородная среда обитания (Звягинцев, 1987). Благодаря своей структурированности и микрозональности, она должна быть изучена как набор различных макро-, мезо- и микросред, в каждой из которых создаются различные и часто прямо противоположные условия для развития отдельных групп микроорганизмов. Микро- и мезозоны разделены в пространстве и во времени. Во всех почвах и в разных почвенных горизонтах микрозональность основывается на локальном поступлении органических остатков и корневых выделений, а также на микрозональности распределения физико-химических условий и минералогических факторов. Во всех почвах и в разных почвенных горизонтах имеются аэробные и анаэробные макро-, мезо- и микрозоны, резко различающиеся по величине окислительно-восстановительного потенциала (Eh). Анаэробные условия могут сохраняться на протяжении больших временных периодов (Зайдельман, 1985; Орлов, 1987).
Однако до настоящего времени изучены в основном аэробные микроорганизмы и их активность в аэробных условиях, причем, главным образом, эта работа проводилась с использованием метода посева и изучались чистые культуры микроорганизмов. В то же время неоднократно отмечалось, что изучать микроорганизмы необходимо непосредственно в

факторам окружающей среды происходит через оперон proU, что свидетельствует об общих механизмах воздействия как химических, так и физических факторов (Dorman, 1996). Интересно отметить, что «наннобактерии», выделенные из воды и сыворотки крови, более устойчивы к воздействию неблагоприятных факторов (Schut et al., 1997). При исследованиях почвы было показано, что 72% бактериальных клеток, отделенные от почвенных частиц, имели «карликовые» размеры менее 0,3 мкм в диаметре (Amann et al., 1993). С помощью методов многократного центрифугирования и фильтрации водной суспензии образцов почв были выделены ультрамелкие формы бактерий (200 нм) (Bowden, 1977). В природных и антропогенных почвах их численность составила от 12 до 300 млн. кл./г почвы (Лысак и др., 2010). При этом их доля в городских загрязненных почвах составляла до 15% (Соина и др., 2012). Доказано, что «обычные» бактерии в сообществах почв и пород находятся в устойчивых ассоциациях с бактериями, размеры которых меньше 400 нм. Связи взаимодействия этих групп очень прочные и не позволяют выделить их в чистую культуру, что может указывать на специфическую роль этих мелких форм бактерий в микробных сообществах почв и пород (Soina et al., 2004). Известно, что эти клетки обладают низкими скоростями роста и плохо культивируются, поэтому непонятно, являются ли они представителями новых таксонов или это мелкие формы обычных клеток бактерий (Вайнштейн, Кудряшова, 2000). Еще Красильников и Новогрудский высказали предположение о том, что в почвах клетки могут уменьшаться в