Микроэкологические основы коррекции "дисбиозной" микробиоты человека

• Автор: Соловьева, Ирина Владленовна
• Шифр специальности: 03.02.08, 03.02.03
• Научная степень: Докторская
• Год защиты: 2013
• Место защиты: Нижний Новгород
• Количество страниц: 396 с. : ил.

ОГЛАВЛЕНИЕ
ВВЕДЕНИЕ
Глава 1. Обзор литературы. Современные аспекты синэкологии симбиотических микроорганизмов толстой кишки человека и принципы коррекции микробиоты с помощью препаратов из штаммов-симбионтов

1.1. Видовая структура биотических сообществ

1.2. Симбиотические сообщества как объекты биоэкологических исследований

1.3. Роль микробиоты в процессе жизнедеятельности макроорганизма

1.4. Структурная организация микробиоценоза пищеварительного тракта

1.5. Функции нормальной микрофлоры пищеварительного тракта

1.6. Формирование микрофлоры у детей

1.7. Качественный и количественный состав нормальной микрофлоры ЖКТ

1.8. Дисбиоз кишечника

1.9. Средства коррекции микрофлоры
1.10. Молекулярно-биологические методы для индикации, идентификации пробиотических микроорганизмов и типирования промышленно-значимых штаммов
1.11. Современные принципы коррекции дисбиозов различных биотопов организма человека
СОБСТВЕННЫЕ ИССЛЕДОВАНИЯ
Глава 2. Материалы и методы исследований
2.1. Дизайн исследования
2.2. Объем экспериментальных данных
2.3. Методы изучения видового состава и численности симбиотических микроорганизмов
2.3.1. Классические микробиологические методы
2.3.2. Методика молекулярно-генетического анализа
2.3.3. Метод экспертных оценок

2.3.4. Клинические методы исследований, использованные в работе для оценки эффективности пробиотиков
2.3.5. Методы статистического анализа
2.3.6. Методы ранговых распеределений
2.3.7. Методы экологического анализа
Глава 3. Синэкологический анализ симбиотичнской микробиоты толстой кишки людей разных возрастных групп
3.1. Выбор параметров оценки состояния микробиоценоза толстой кишки
3.2. Особенности возрастной динамики численности симбиотических микроорганизмов толстой кишки «здоровых» людей
3.2.1. Характеристика микрофлоры просвета толстой кишки «здоровых» детей
3.2.2. Характеристика микрофлоры просвета толстой кишки «здоровых» взрослых
3.3. Особенности возрастной динамики численности симбиотических микроорганизмов толстой кишки «больных» людей
3.4. Сравнение возрастной динамики численности симбиотических микроорганизмов толстой кишки «здоровых» и «больных» людей
3.4.1. Сравнительная характеристика микрофлоры просвета толстой кишки «здоровых» и «больных» детей
3.4.2. Сравнительная характеристика микрофлоры просвета толстой кишки «здоровых» и «больных» взрослых
3.5. Синэкологический анализ микробиоценозов толстой кишки «здоровых» и «больных» людей разных возрастных групп
3.5.1. Анализ ранговых распределений
3.5.2. Результаты кластеризации исходного массива данных бактериологических исследований
3.5.3. Результаты статистического анализа с использованием критериев Манна-Уитни и Краскала-Уоллиса
3.5.4. Анализ видового разнообразия

Глава 4. Теоретические и экспериментальные основы отбора производственных штаммов-продуцентов пробиотиков
4.1. Изучение биологических свойств штаммов-продуцентов пробиотиков
4.1.1. Определение антагонистической активности пробиотических штаммов лактобацилл
4.1.2. Изучение биосовместимости штаммов лактобацилл и бифидобактерий
4.1.3. Определение антагонистической активности лактобацилл к грибам рода Candida
4.1.4. Изучение выживаемости молочнокислых бактерий в кислой среде
4.1.5. Характеристика антибиотикорезистентности стартерных культур пробиотиков
4.2. Молекулярно-генетическая идентификация штаммов-продуцентов
4.2.1. Разработка методики индикации бактерий рода Lactobacillus и Bifidobacterium на основе ПЦР гена 16S рРНК
4.2.2. Разработка методики видовой идентификации лактобацилл с использованием гнездового варианта ПЦР
4.2.3. Изучение динамики роста лактобацилл в аксеничной и смешанной культуре
4.2.4. Разработка алгоритма контроля динамики культивирования лактобацилл в смешанной культуре методом ПЦР
Глава 5. Конструирование новых жидких пробиотиков как средств коррекции микробной экосистемы человека
5.1. Конструирование и разработка технологии производства жидкого бактериального концентрата на основе лактобацилл «LL-комплекс»
5.2. Конструирование и разработка технологии производства пробиотика в форме БАД к пище на основе лакто-и бифидобактерий «LB-комплекс»
5.3. Конструирование и разработка технологии производства жидкого бактериального концентрата на основе лакто-и бифидобактерий «LB-комплекс S»

микробиоценозах человека изменяются, нарушаются защитные, метаболические, регуляторные свойства микробиоты.
1.6.ФОРМИРОВАНИЕ МИКРОФЛОРЫ У ДЕТЕЙ
Заслуживает внимания вопрос о формировании микробиоценоза у детей.
До недавнего времени считалось, что формирование микробиоценоза новорожденного начинается в процессе рождения ребенка, когда он продвигается по родовому каналу, и обусловлено видовым составом микрофлоры родовых путей матери. До рождения во внутриутробном периоде плод стерилен. Только в случае патологии вследствие проницаемости плодных оболочек и плаценты (чаще для вирусных агентов, реже для бактериальных) могут происходить колонизация и инфицирование и, как следствие этого, иммунная реакция со стороны плода. (Перетц, 1955; Блохина, Дорофейчук, 1979).
Однако, с конца 80-х годов прошлого века в зарубежной литературе стали появляться работы, демонстрирующие контакт микрофлоры матери с плодом in utero. Открытие отечественными учеными «феномена бактериальной транслокации» еще в большей степени подвергло сомнению убеждение о стерильности ЖКТ плода (Никитенко, 2001). Работы O.A. Глушковой, И.А. Бочкова, Martin с сотрудниками, свидетельствуют в пользу того, что внутриутробно развивающийся плод не является стерильным, а получает от матери какое-то количество индигенных микроорганизмов (Глушкова, 2000; Бочков, Юрко, Юдицкая, 2004; Martin, 2004; 2005; 2008).
Массивная колонизация кишечника здорового доношенного младенца начинается в момент рождения, имеет определенные закономерности и состоит из нескольких последовательных стадий. Первая стадия, которую с современных позиций можно считать условно асептической, берет начало в интранатальном периоде. Вторая, наступающая через 10-20 ч после рождения, стадия «нарастающего инфицирования», которую точнее было бы называть стадией «нарастающей колонизации» (Fanaro et al, 2003). В этот