Микробиологический мониторинг патогенов внутрибольничных инфекций в стационаре

• Автор: Крапивина, Ирина Владимировна
• Шифр специальности: 03.02.03
• Научная степень: Кандидатская
• Год защиты: 2010
• Место защиты: Москва
• Количество страниц: 104 с. : 27 ил.

Оглавление

Оглавление Список сокращений Введение

Глава 1. Обзор литературы

1.1. Понятие об «Инфекции»

1.2. Нозокомиальные инфекции

1.3. Эпидемиология нозокомиальных инфекций

1.4. Патогенез нозокомиальных инфекций

1.5. Этиология нозокомиальных инфекций

1.6. Структура нозокомиальных инфекций

1.6.1. Нозокомиальные инфекции мочевыводящих путей

1.6.2. Нозокомиальные инфекции дыхательных путей

1.6.3. Нозокомиальные раневые инфекции
1.6.4. Ангиогенные (катетерассоциированные) инфекции
1.7. Антимикробная резистентность приоритетных патогенов ВБИ
1.8. Методы детекции БЛРС
1.9. Исследования распространения антибиотикорезистентности
1.10. Профилактика распространения антибиотикорезистентности Собственные исследования
Глава 2. Материалы и методы
2.1. Пациенты
2.2. Штаммы
2.3. Определение чувствительности микроорганизмов к антибактериальным препаратам
2.4. Детекция генов ß-лактамаз с помощью ПЦР
2.5. Статистическая обработка данных
Глава 3. Микробиологический мониторинг ведущих патогенов ВБИ в ДГКБ № 9 Глава 4. 4.1. Антимикробная резистентность патогенов
4.1.1. P. aeruginosa
4.1.2. A. baumannii
4.1.3. К. pneumoniae
4.1.4. E
4.1.5. Enterobacter spp
4.2. Анализ потребления антибактериальных препаратов в группе пациентов, вошедших в исследование Глава 5. Детекция генов ß-лактамаз
5.1. Детекция генов ß-лактамаз класса А энтеробактерий
5.2. Детекция генов металло-Р-лактамаз класса В
Глава 6. Антибиотикочувствительность продуцентов ß-лактамаз
6.1. K. pneumoniae
6.1.1. Антибиотикочувствительность штаммов K. pneumoniae, продуцирующих ß-лактамазы разных типов
6.1.2. Сравнительный анализ антибиотикочувствительности штаммов K. pneumoniae - продуцентов и непродуцентов ESBL
6.2. E

5 10 10 И

20 21 23 27 29 39 41

6.2.1. Антибиотикочувствительность штаммов E. coli, продуцирующих ß-лактамазы разных типов
6.2.2. Сравнительный анализ антибиотикочувствительности штаммов E. coli - продуцентов и непродуцентов ESBL
6.3. Enterobacter spp
6.4. P. aeruginosa
Глава 7. Обсуждение результатов ioi
Выводы
Практические рекомендации
Литература
Приложение

Список сокращений:
AmpC - бета-лакгамазы класса С (цефалоспориназы);
АТСС — Американская коллекция типовых культур;
CLSI — Clinical and Laboratory Standards Institute (Институт клинических и лабораторных стандартов);
CDC - Центр контроля и профилактики заболеваний (США);
CNS — коагулазонегативные стафилококки;
ESBL — [3-лактамазы расширенного спектра;
EUCAST - Европейский комитет по определению чувствительное™ к антибиотикам;
MBL - металло-бета-лактамазы;
MRSA — метициллин резистентные Staphylococcus aureus;
MRSE — метициллин резистентные Staphylococcus epidermidis;
NCCLS — National Committee on Clinical Laboratory Standards (Национальный комитет по клиническим лабораторным стандартам)
NNIS - National Nosocomial Infections Surveillance System;
SENIC - Study of Efficacy of Nosocomial Infection Control;
VRE — ванкомицин резистентные энтерококки;
БЛРС — р-лактамазы расширенного спектра;
ВБИ — внутрибольничная инфекция;
ВОЗ - Всемирная Организация Здравоохранения;
ГВЗ — гнойно-воспалительные заболевания;
ДГКБ № 9 им. Г.Н. Сперанского - Детская городская клиническая больница им. Г.Н. Сперанского;
Д. И. - доверительный интервал;
ЖКТ — желудочно-кишечный тракт;
ИАИ — интраабдоминальные инфекции;
ИВЛ — искусственная вентиляция лёгких;
ИМП — инфекции мочевыводящих путей;
ЛПУ — лечебно-профилактическое учреждение;
МБЛ — металло-бета-лактамазы;
МВП - мочевыводящие пути;
МПК - минимальная подавляющая концентрация;
НГОБ — неферментирующие грамотрицательные бактерии;
НП — нозокомиальная пневмония;
ОРИТ - отделение реанимации и интенсивной терапии;
ПСБ — пенициллин связывающие белки;
ПЦР - полимеразная цепная реакция;
УПМ — условно-патогенные микроорганизмы;
ЦНИИ Эпидемиологии - Центральный научно-исследовательский институт эпидемиологии Роспотребнадзора;
ЦПМ - цитоплазматическая мембрана;
ЭДТА - этилендиаминтетрауксусная кислота;
1 ГКБ им. Н. И. Пирогова - Первая городская клиническая больница им. Н. И. Пирогова.

аминогликозиды и фторхинолоны. Энтеробактерии, продуцирующие БЛРС, определённо можно отнести к полирезистентным бактериям [180].
Продуцентами БЛРС могут быть различные энтеробактерии, но наиболее часто они определяются у Klebsiella spp. и E. coli, реже наблюдаются у P. mirabilis, Citrobacter spp., Serratia spp., Salmonella enterica [49, 55, 58, 149, 211]. В связи с плазмидной локализацией эти ферменты могут легко передаваться другим энтеробактериям, что объясняет госпитальные вспышки инфекций, вызванных БЛРС-продуцирующими бактериями [149].
Частота БЛРС-продуцирующих патогенов ВБИ варьирует в отдельных географических регионах и среди медицинских учреждений. В ряде зарубежных исследований показано, что частота БЛРС-продуцирующих штаммов Klebsiella spp. составляет 21-58% [76, 117, 129]. По результатам многоцентрового исследования SENTRY частота выделения штаммов K. pneumoniae, продуцирующих БЛРС, составляет: 45% в Латинской Америке, 25% в Западно-Тихоокеанском регионе, 23% в Европе, 8% в США, 5% в Канаде [223]. По данным многоцентрового исследования MYSTYC в Европе частота БЛРС среди Klebsiella spp. достигает 32,8%, а среди E. coli — 14,4% [143]. Причём наибольшая частота БЛРС в ОРИТ отмечается в России, Польше, Турции [168]. По данным исследования по программе «Micromax» в стационарах г. Москвы частота продукции БЛРС у Klebsiella spp. колебалась от 0 до 93%, у E. coli — 8-48% [50]. Со второй половины 90-х годов XX века отмечается постоянный рост частоты выделения БЛРС, особенно в ОРИТ. По последним данным, которые получены при проведении многоцентровых исследований, в 28 городах России (программы NPRS, RESORT) зарегистрирован резкий рост частоты выявления БЛРС-продуцирующих штаммов в ОРИТ. По этим данным в среднем почти 60% бактерий из семейства Enterobacteriaceae являются БЛРС-продуцентами. В среднем 39% K. pneumoniae продуцируют БЛРС (от 47% в Смоленске и Ставрополе до 73% в Москве, 76-79% в Новосибирске и Санкт-Петербурге). Среди E. coli выявление БЛРС на территории Российской Федерации колеблется от 5-15% и может достигать 55%. Показателен сравнительный рост выделения БЛРС в 1997-98 г. г. и в 2003 г.: K. pneumoniae — с 60 до 84%, E. coli — с 16 до 55%, P. mirabilis — с 19 до 61%. Таких темпов нарастания БЛРС в ОРИТ не знает ни одна другая страна мира, где ведётся мониторинг резистентности [17, 55, 52, 108].
К наиболее распространенным ферментам с хромосомной локализацией генов относятся ß-лактамазы класса С (АтрС) [68]. Эти ß-лактамазы кодируются геном, локализующимся в хромосомах, поэтому, в отличие от плазмидных БЛРС обычно не передаются другим энтеробактериям. В то же время они характеризуются индуцибельностью и гиперпродукцией, возникающей на фоне лечения. С феноменом гиперпродукции связана недостаточная эффективность цефалоспоринов III поколения или рецидивы инфекции при применении этих препаратов. Наиболее частыми гиперпродуцентами АтрС ß-лактамаз являются