Анализ вариабельности нуклеотидных последовательностей ядерного и цитоплазматического геномов представителей рода Fagopyrum

• Автор: Кадырова, Гузель Дамировна
• Шифр специальности: 03.01.04
• Научная степень: Кандидатская
• Год защиты: 2011
• Место защиты: Казань
• Количество страниц: 160 с. : ил.

СОДЕРЖАНИЕ

СПИСОК СОКРАЩЕНИЙ

ВВЕДЕНИЕ

Глава 1 Обзор литературы

1.1 Методы изучения полиморфизма нуклеотидных последовательностей

ДНК растений

1.1.1 Изучение полиморфизма нуклеотидных последовательностей ДНК

растений основанного на ПЦР - реакции

1.1.1.1 Метод КАРБ- анализа

1.1.1.2 Метод АРЬР- анализа

1.1.1.3 Метод КБЛ- анализа
1.1.1.4 Метод ЗБЛ- анализа
1.1.2 Изучение полиморфизма нуклеотидных последовательностей ДНК,
основанного на детекции полиморфизма точковых замен БОТ
1.1.3 Изучение полиморфизма нуклеотидных последовательностей
хлоропластной ДНК растений
1.1.4 Изучение полиморфизма нуклеотидных последовательностей
митохондриальной ДНК растений
1.2 Морфо-биологическая характеристика рода Fagopyrum
1.2.1 Описание и внутривидовая классификация культивируемого вида
Fagopyrum е8си1еп1ит МоепсЬ
1.2.2 Описание культивируемого вида Fagopyru.ni 1а1апсит (Ь.) Са&Чп
1.3 Классификация рода Fagopyrum
1.4 Биохимическая характеристика культивируемых видов Fagopyrum
1.5 Центры происхождения, распространение и филогенетические
отношения у видов Fagopyrllm
Глава 2 Материалы и методы
Глава 3 Результаты и обсуждение
3.1 Молекулярный анализ ядерного генома Рароругит
3.1.1 Анализ генома представителей рода Fagopyrum АРЬР методом
3.1.1.1 Подбор праймерных комбинаций и рестрицирующих эндонуклеаз для проведения АРЬР анализа последовательностей ДНК
гречихи
3.1.1.2 АРЬР-анализ межвидового полиморфизма нуклеотидных
последовательностей ДНК Fagopynlm

3.1.2 Молекулярный анализ полиморфизма ДНК культивируемых видов
гречихи Fagopyrum esculentum и Fagopyrum tataricum
3.1.2.1 AFLP анализ полиморфизма культивируемых видов гречихи
Fagopyrum esculentum и Fagopyrum tataricum
3.1.2.2 RAPD анализ полиморфизма ДНК культивируемых видов гречихи
Fagopyrum esculentum и Fagopyrum tataricum
3.1.2.3 ISSR анализ полиморфизма ДІЖ видов и сортов рода
Fagopyrum
3.1.3 Комплексный анализ вариабельности ДНК представителей
культивируемых видов гречихи Fagopyrum esculentum и Fagopyrum tataricum с использованием RAPD, ISSR и AFLP методов
маркирования
3.2 Анализ полиморфизма микросателлитных SSR локусов видов и сортов
Fagopyrum
3.2.1 Тестирование и отбор праймеров для амплификации микросателлитных
локусов гречихи
3.2.2 Микросателитный анализ видов и образцов группы cymosum
3.2.2.1 Характеристика полиморфизма последовательности
микросателлитного локуса Fes 1
3.2.2.2 Характеристика полиморфизма последовательности
микросателлитного локуса Fes 2
3.2.2.3 Характеристика полиморфизма микросателлитных локусов Fes 1368,
Fes 1585, Fes 1303, Fes 3177, Fes 3
3.3 Анализ полиморфизма последовательностей хлоропластного генома
видов Fagopyrum
3.3.1 Полиморфизм последовательностей хпДНК спейсера IrnL-trnFу
представителей рода Fagopyrum
3.3.2 Полиморфизм последовательностей спейсераpsbA-trnHу представителей
Fagopyrum
3.3.3 Полиморфизм последовательностей спейсера trnT-trnYу представителей
ром Fagopyrum
3.3.4 Полиморфизм последовательностей интрона гена rpS16 у представителей
ром Fagopyrum
3.3.5 Анализ вторичной структуры интрона rpS16 представителей
Fagopyrum

3.3.6 Комплексный анализ четырех областей хлоропластного генома
Fagopyrum
3.4 Анализ полиморфизма последовательностей митохондриального генома
видов Fagopyrшn
3.4.1 Анализ вторичной структуры Ь/с интрона пасії представителей
Fagopyrum
3.5 Комплексный анализ полиморфизма последовательностей
хлоропластного и митохондриального генома видов Fagopyrum
ЗАКЛЮЧЕНИЕ
ВЫВОДЫ
СПИСОК ЛИТЕРАТУРЫ

Группа urophyllum так же образовала два подютастера. Первый подкластер включает F. gilessii, F. capillatum и F. gracilipes, а виды F. macrocarpum и F. pleioramosum сформировали второй подкластер. Виды F. statice, F. urophyllum и F. lineare не сформировали кластеры ни с одним из видов [Sharma et al. 2002].
Т. Ohsako с соавторами (2002) описали два новых вида в составе группы urophyllum - F. jinshaense Ohsako et Ohnishi и F. gracilipedoides Ohsako et Ohnishi, изучив их филогенетическое родство с уже известными видами Fagopyrum. Выявили, что F. gracilipedoides по морфологии схож с видами F. gracilipes Dämmer и F. capillatum Ohnishi, по отличается от F. gracilipes гетеростилией и перекрестным опылением, а от F. capillatum более мелкими листьями, цветками и плодами. F. jinshaense морфологически схож с видами F. gilesii Hemsl. и
F. leptopodum Diels., но отличается кистевидным соцветием от F. gilesii и плотными матовыми листьями от F. leptopodum.
Таким образом, несмотря на достаточно обширные знания, касающиеся изучения морфо-биологических особенностей представителей рода Fagopyrum целый ряд вопросов, относящихся к происхождению, эволюции, генетическому разнообразию видов остается не ясным. Особый интерес для селекционногенетических исследований составляет определение внутривидового, меж- и внутрисортового полиморфизма ДНК. Биохимические и молекулярные данные вариабельности последовательностей ядерного и цитоплазматического геномов представителей рода Fagopyrum довольно скудны, и требуют комплексного и системного изучения.