Роль туберина в регуляции аутофагии на примере туберозного склероза

• Автор: Пархитько, Андрей Александрович
• Шифр специальности: 03.01.03
• Научная степень: Кандидатская
• Год защиты: 2012
• Место защиты: Москва
• Количество страниц: 130 с. : ил.

ОГЛАВЛЕНИЕ

СПИСОК СОКРАЩЕНИЙ

ВВЕДЕНИЕ

1. ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ

1.1. Аутофагия: механизмы, регуляция и участие в поддержании

клеточного гомеостаза

1.1.1. Молекулярные механизмы образования аутофагосом

1.1.2. Молекулярные механизмы регуляции аутофагии

1Л .3. Роль аутофагии в поддержании клеточного гомеостаза

1.1.3.1. Роль аутофагии в развитии и дифференцировке

1.1.3.2. Роль аутофагии в селективной деградации митохондрий

(митофагия)
1.1.3.3. Роль аутофагии в регуляции метаболизма
1.1.3.4. Роль аутофагии в регуляции иммунитета
1.2. Методы определения активности аутофагии
1.2.1. Электронная микроскопия
1.2.2. Анализ деградации долгоживущих белков
1.2.3. Мечение аутофагических вакуолей монодансилкадаверином 26 (МДК)

1.2.4. Определение внутриклеточной локализации белка ЬСЗ
1.2.5. Деградация специфических для аутофагии субстратов
1.3. Роль аутофагии в развитии опухолей
1.3.1. Сигнальный путь Т8С/ЮзеЬ/тТ(ЖС1
1.3.2. Общие представления о супрессорах опухолевого роста 33 туберине и гамартине
1.3.3. Киназный комплекс тТСЖС1
1.3.4. Неканонические функции туберин/гамартинового комплекса
1.3.4.1. Неканонические функции туберин/гамартинового 42 комплекса, связанные с центросомами
1.3.4.2. Неканонические функции туберин/гамартинового 43 комплекса, связанные с транспортом, секрецией и активацией сигнальных каскадов через плазматическую мембрану
1.3.4.3. Неканонические функции туберин/гамартинового 44 комплекса, связанные с регуляцией актинового цитоскелета
1.3.5. Рабин-8 - новый регулятор киназного комплекса тТ(ЖС1
1.4. Туберозный склероз как модель для изучения роли аутофагии в
развитии опухолей
1.4.1. Туберозный склероз: характеристика, клинические
проявления и лечение

1.4.2. Животные модели туберозного склероза
2. МАТЕРИАЛЫ И МЕТОДЫ
2.1. Материалы
2.1.1. Реагенты
2.1.2. Клеточные линии
2.2. Методы работы с клеточными культурами
2.2.1. Трансфекция
2.2.2. Получение лентивирусных частиц и инфекция
2.2.3. Иммуноблоттинг
2.2.4. Коиммунопреципитация
2.2.5. Измерение уровня АТР
2.2.6. Измерение дыхательной активности митохондрий
2.2.7. Определение количества мертвых клеток с использованием 56 иодида пропидия
2.3. Методы работы с мышами
2.3.1. Мыши, гетерозиготные по генам Tsc2 и Beclinl
2.3.2. Образование подкожных опухолей в иммунодефицитных 58 мышах

activated protein kinase), которая фосфорилирует туберин по остаткам Thr 1227 и Ser 1345 и активирует туберин/гамартиновый комплекс, в
Рис. 3. Схема расположения сайтов фосфорилирования в белках гамартине и туберине [171. Красным цветом обозначены стимулы, приводящие к ингибированию гамартин/туберинового комплекса, зеленым - к его активации.
результате чего происходит инактивация киназного комплекса mTORCl, несмотря на наличие в среде ростовых факторов [50]. Киназа GSK3ß фосфорилирует гамартин (Ser 302, 430 и Thr 357,390) и активирует туберин/гамартиновый комплекс [112].