Филогенетические и онтогенетические аспекты структурно-функциональных исследований генов, кодирующих кристаллины головоногих моллюсков

• Автор: Зиновьева, Рина Дмитриевна
• Шифр специальности: 03.00.30, 03.00.15
• Научная степень: Докторская
• Год защиты: 2002
• Место защиты: Москва
• Количество страниц: 224 с. : ил

ОГЛАВЛЕНИЕ
ВВЕДЕНИЕ
ГЛАВА I. ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ. МОЛЕКУЛЯРНАЯ БИОЛОГИЯ ХРУСТАЛИКА ПОЗВОНОЧНЫХ И БЕСПОЗВОНОЧНЫХ
1.1. ВВЕДЕНИЕ
1.2. ЭВОЛЮЦИОННАЯ СТРАТЕГИЯ ФОРМИРОВАНИЯ ХРУСТАЛИКА ПОЗВОНОЧНЫХ
1.2.1. Происхождение канонических кристаллинов от стресс индуцируемых белков
1.2.2. Таксонспецифические кристаллины позвоночных
1.3. ЭВОЛЮЦИОННАЯ СТРАТЕГИЯ ФОРМИРОВАНИЯ ГЛАЗА У
БЕСПОЗВОНОЧНЫХ
1.3.1. Кристаллины брюхоногих моллюсков
1.3.2. Кристаллины головоногих моллюсков
1.3.3. Кристаллины медуз
1.3.4. Кристаллины дрозофилы
1.4. РЕГУЛЯЦИЯ ХРУСТАПИКОСПЕЦИФИЧЕСКОЙ ЭКСПРЕССИИ КРИСТАЛЛИНОВЫХ ГЕНОВ
1.5. ЗАКЛЮЧЕНИЕ
ГЛАВА 2. МАТЕРИАЛЫ И МЕТОДЫ
2.1. ОБЪЕКТ ИССЛЕДОВАНИЯ
2.2. ВЫДЕЛЕНИЕ И ФРАКЦИОНИРОВАНИЕ КРИСТАЛЛИНОВ
2.3. ЧАСТИЧНЫЙ СИКВЕНС КРИСТАЛЛИНОВ
2.4. ВЫДЕЛЕНИЕ И ЧАСТИЧНАЯ ОЧИСТКА ГБТ
2.5. ОПРЕДЕЛЕНИЕ ГЭТ АКТИВНОСТИ
2.6. ОПРЕДЕЛЕНИЕ АЛДГ АКТИВНОСТИ
2.7. ВЫДЕЛЕНИЕ РИБОНУКЛЕИНОВОЙ КИСЛОТЫ
2.8. ВЫДЕЛЕНИЕ мРНК
2.9. КОНСТРУИРОВАНИЕ кДНК БИБЛИОТЕК
2.10. ВЫДЕЛЕНИЕ ГЕНОМНОЙ ДНК
2.11. ВЫДЕЛЕНИЕ ПЛАЗМИДНОЙ ДНК
2.12. ЭЛЕКТРОФОРЕТИЧЕСКИЙ АНАЛИЗ РНК и ДНК
2.13. КОНСТРУИРОВАНИЕ ГЕНОМНОЙ БИБЛИОТЕКИ
2.14. МЕЧЕНИЕ ДНК
2.15. СКРИНИНГ кДНК И ГЕНОМНЫХ БИБЛИОТЕК
2.16. ТРАНСФОРМАЦИЯ
2.17. СЕКВЕНИРОВАНИЕ кДНК
2.18. НОЗЕРН И САУЗЕРН БЛОТ АНАЛИЗ
2.19. ПОЛИМЕРАЗНАЯ ЦЕПНАЯ РЕАКЦИЯ
2.20. ОЦЕНКА РАЗМЕРОВ ИНТРОНОВ В ГЕНАХ С ПОМОЩЬЮ ПОЛИМЕРАЗНОЙ ЦЕПНОЙ РЕАКЦИИ
2.21. САТ-ПРОМОТОР КОНСТРУКЦИИ
2.22. ТРАНСФЕКЦИЯ
2.23. IN SITU ГИБРИДИЗАЦИЯ
2.24. ЭКТОПИЧЕСКАЯ ЭКСПРЕССИЯ кДНК РАХ6 КАЛЬМАРА В ДРОЗОФИЛЕ
ГЛАВА 3. РЕЗУЛЬТАТЫ ИССЛЕДОВАНИЯ
3.1. ВВЕДЕНИЕ
3.2. ПОЛУЧЕНИЕ БИБЛИОТЕКИ кДНК ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТЕЙ КОМПЛИМЕНТАРНЫХ ПОЛИ(А)+РНК ХРУСТАЛИКА ГЛАЗА КАЛЬМАРА
3.2.1. Конструирование кДНК библиотек
3.2.2. Анализ кодирующего потенциала мажорных клонов из библиотеки кДНК хрусталика кальмара
3.3. СТРУКТУРНО-ФУНКЦИОНАЛЬНАЯ ХАРАКТЕРИСТИКА кДНК КЛОНОВ, СООТВЕТСТВУЮЩИХ СЕМЕЙСТВУ ГЕНОВ S-КРИСТАЛЛИНОВ КАЛЬМАРА
3.3.1. Определение первичной структуры кДНК клонов, несущих информацию о структуре генов S-кристаллинов кальмара
3.3.2. Структурный анализ мажорных фракций белка хрусталика кальмара
3.3.3. Тканеспецифическая экспрессия генов S-кристаллинов кальмара
3.4. СТРУКТУРНО-ФУНКЦИОНАЛЬНАЯ ХАРАКТЕРИСТИКА ГЕНОВ,
КОДИРУЮЩИХ S-КРИСТАЛЛИНЫ КАЛЬМАРА
3.4.1. Структурная характеристика генов, кодирующих S-кристаллины кальмара
3.4.2. Характеристика 5’фланкирующих последовательностей генов SL20 и SL
3.4.3. Функциональная характеристика промоторов генов SL20 и SL
3.4.4. Определение ферментативной активности S-кристаллинов
3.5. СТРУКТУРНО-ФУНКЦИОНАЛЬНАЯ ХАРАКТЕРИСТИКА ГЕНА,
КОДИРУЮЩЕГО TST КАЛЬМАРА
3.5.1. Выделение и очистка TST из пищеварительной железы кальмара
3.5.2. Выделение и структурная характеристика кДНК клона, содержащего информацию о структуре гена, кодирующего TST кальмара

3.5.3. Тканеспецифическая экспрессия гена TST
кальмара
3.5.4. Структурный анализ гена, кодирующего TST кальмара. Экзон-интронная композиция гена TST кальмара
3.6. СТРУКТУРНО-ФУНКЦИОНАЛЬНАЯ ХАРАКТЕРИСТИКА ГЕНОВ, КОДИРУЮЩИХ БЕЛКИ ХРУСТАЛИКА ОСЬМИНОГА
3.6.1. Структурный анализ мажорных фракций белка хрусталика осьминога
3.6.2. Структурно-функциональная характеристика генов, кодирующих S-кристаллины осьминога
3.6.3. Определение глутатион-Э-трансферазной активности белковых экстрактов хрусталика осьминога
3.6.4. Тканеспецифическая экспрессия S-кристаллинов осьминога
3.7. ИДЕНТИФИКАЦИЯ И СТРУКТУРНО-ФУНКЦИОНАЛЬНАЯ ХАРАКТЕРИСТИКА ГЕНОВ, КОДИРУЮЩИХ НОВЫЕ ТАКСОНСПЕЦИФИЧЕСКИЕ КРИСТАЛЛИНЫ, О - И О-КРИСТАЛЛИН ОСЬМИНОГА
3.7.1. Определение первичной структуры кДНК Q -кристаллика
3.7.2. Определение ферментативной активности в экстрактах хрусталика осьминога
3.7.3. Хрусталикоспецифическая экспрессия генов Q -кристаллинов осьминога и кальмара
3.7.4. О-кристаллиновые гены осьминога и кальмара
3.7.5. Идентификация и структурно-функциональная характеристика О-кристаллина осьминога
3.7.6. Тканеспецифическая экспрессия О-кристаллина осьминога
3.8. Структурно-функциональная характеристика генов, кодирующих кристаллины каракатицы
3.8.1. Тканеспецифическая экспрессия генов S-кристаллинов каракатицы
3.8.2. Сравнительный анализ структур S-кристаллинов кальмара, осьминога и каракатицы
3.9. Механизмы регуляции экспрессии кристаллинов головоногих
ТАБЛИЦА 2. ПРОИСХОЖДЕНИЕ КРИСТАЛЛИНОВ БЕСПОЗВОНОЧНЫХ
КРИСТАЛЛИНЫ ВИДЫ родственны/идентичны
Б* осьминог, кальмар, ГБТ (БЫ1/Ьорг4),
каракатица остальные ГЭТ
а осьминог,
морской гребешок альдегиддегидрогеназа
ь фотофора кальмара
О осьминог липид-связывающий белок
80 кД О
63 кД улитки
28 кД

13 сапозин позвоночных
70 кД кубамедузы
60 кД
40 кД
52 кД дрозокристаллин
47 кД насекомые
45 вД Б. те1аподазбег
антиген 366
■*- множественное семейство белков (не менее 10 членов)