Молекулярная эволюция и филогенетические отношения в двух группах рыб семейств Mugilidae и Cyprinidae

• Автор: Семина, Алиса Владимировна
• Шифр специальности: 03.00.15
• Научная степень: Кандидатская
• Год защиты: 2008
• Место защиты: Владивосток
• Количество страниц: 178 с. : ил.

СПИСОК СОКРАЩЕНИЙ
Глава 1. ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ
1Л. Кефалевые - сем. М1щШ<Зае
1 Л.1. Общая характеристика исследуемой группы видов
1.1.2. Таксономический статус исследуемых видов
1.1.3. Систематика и филогения кефалевых на основе генетических данных
1.1.4. Внутривидовая генетическая изменчивость и популяционно-генетическая
структура кефалевых
1.2. Карповые - сем. Сурптбае
1.2.1. Общая характеристика исследуемой группы видов
1.2.2. Таксономический статус исследуемых видов
1.2.3. Генетические характеристики карповых 26 -
Глава 2. МАТЕРИАЛЫ И МЕТОДЫ ИССЛЕДОВАНИЯ
2.1. Материалы
2.1.1. Кефалевые
2.1.2. Карповые
2.2. Выделение ДНК
2.3. Амплификация мтДНК
2.4. Амплификация ядерной ДНК
2.5. Электрофоретический анализ полиморфизма длины рестрикционных ПЦР-фрагментов мтДНК
2.6. Статистический анализ полиморфизма длины рестрикционных ПЦР-фрагментов мтДНК
2.7. Филогенетический анализ полиморфизма длины рестрикционных ПЦР-фрагментов мтДНК
2.8. ПЦР-ПДРФ-анализ ядерных генов
2.9. Клонирование ДНК
2.10. Определение нуклеотидной последовательности ДНК
2.11. Анализ нуклеотидных последовательностей
Глава 3. РЕЗУЛЬТАТЫ
3.1. Кефалевые
3.1.1. Гаплотипическое и нуклеотидное разнообразие в выборках кефалевых
3.1.2. Нуклеотидная дивергенция между выборками кефалевых
3.1.3. Внутривидовая изменчивость мтДНК в выборках пиленгаса, сингиля и лобана
3.1.4. Филогенетические отношения кефалевых на основе ПЦР-ПДРФ-анализа
3.1.5. Филогенетические отношения кефалевых на основе анализа
последовательностей субъединицы I оксидазы цитохрома с (С01)
3.2. Карповые
3.2.1. Гаплотипическое и нуклеотидное разнообразие у карповых
3.2.2. Нуклеотидная дивергенция у карповых
3.2.3. Филогенетические отношения карповых на основе ПЦР-ПДРФ-анализа
3.2.4. Филогенетические отношения карповых на основе анализа последовательностей субъединицы I оксидазы цитохрома с (С01)
3.2.5. Филогенетические отношения карповых на основе анализа последовательностей гена цитохрома Ь (су! Ь)
3.2.6. Популяционно-генетическая структура Т. засНаИпет15
3.2.7. Популяционно-генетическая структура Т. ЬгапсЬП
3.2.8. Популяционно-генетическая структура Т. Иакопепз1з
3.2.9. ПЦР-ПДРФ-анализ и секвенирование ядерных генов
3.2.9.1. Ген гормона роста ОН
3.2.9.2. Интрон 1 гена рибосомного белка Б7 ЮМ
Глава 4. ОБСУЖДЕНИЕ
4.1. Кефалевые
4.1.1. Филогенетические отношения кефалевых
4.1.2. Вероятный сценарий происхождения и дивергенции кефалевых
4.1.3. Изменчивость мтДНК в выборках М. серка1ш
4.1.4. Изменчивость мтДНК в выборках/,. НаетШосИеИш
4.1.5. Изменчивость мтДНК в выборках Ь. аига1а
4.2. Карповые
4.2.1. Филогенетические отношения карповых
4.2.2. Вероятный сценарий происхождения и дивергенции карповых

4.2.3. Анализ внутривидовой изменчивости мтДНК
4.2.3.1. Популяционно-генетическая структура Т. заскаїіпетія
4.2.3.2. Популяционно-генетическая структура Т. ЬгапсІШ
4.2.3.3. Популяционно-генетическая структура Т. какопетіз
4.2.4. Молекулярные доказательства видообразования южной формы Т. Иакопетіз
ЗАКЛЮЧЕНИЕ
ВЫВОДЫ
СПИСОК ЛИТЕРАТУРЫ
ПРИЛОЖЕНИЕ

1125/165 рРНК І ЫОЗ/Ш41_/Ш4 І М05/М06 і Среднее
0.020-і

0.015-

со (0
« 0.01012Э/165 рРНК Ы03/Ы041_/Ы04 Мй5/М06 Среднее
о 0.005Н

0.000^
■І5 , Пя
Рис. 10. Гаплотипическое (А) и нуклеотидное (В) разнообразие в выборках кефалевых. Гистограммы иллюстрируют уровни изменчивости в разных участках мтДНК каждого вида.
Выборки: 1 - пиленгас, Японское море; 2 - пиленгас, Азовское море; 3 -сингиль, Азовское море; 4 - сингиль, бассейн Средиземного моря; 5 - лобан, Японское море; 6 - лобан, Азовское море; 7 - лобан, бассейн Средиземного моря; 8 -губач, бассейн Средиземного моря.