Функциональный анализ пептидаз у цианобактерии Synechocystis sp. PCC 6803

• Автор: Пожидаева, Елена Станиславовна
• Шифр специальности: 03.00.12
• Научная степень: Кандидатская
• Год защиты: 2004
• Место защиты: Мюнхен
• Количество страниц: 145 с. : ил.

СОДЕРЖАНИЕ
СПИСОК СОКРАЩЕНИЙ
ВВЕДЕНИЕ
ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ
Протеазы и их роль в гомеостазе клетки
1. Классификация пептидаз
2. Типы протеолиза белков
3. Семейства пептидаз
3.1. АТФ-зависимые пептидазы
3.1.1. Семейство пептидаз
3.1.2. Семейство пептидаз FtsH
3.2. АТ Ф-независимые пептидазы
3.2.1. Семейство пептидаз Deg
3.2.2. Семейство пептидаз Ctp
3.2.3. Семейство пептидаз SppA
4. Роль пептидаз в клетке
5. Адаптация цианобактерий к изменяющимся условиям окружающей среды
МАТЕРИАЛЫ И МЕТОДЫ
РЕЗУЛЬТАТЫ И ОБСУЖДЕНИЕ
1. Сравнительный анализ пептидаз у Synechocystis и A.thaliana
2. Физиологический анализ мутантов по генам пептидаз у Synechocystis в

условиях стресса
3. Функциональный анализ белков семейства SppA-пептидаз у Synechocystis
ВЫВОДЫ
СПИСОК ЛИТЕРАТУРЫ
СОКРАЩЕНИЯ
СОКРАЩЕНИЯ
а.о. аминокислотные остатки
кДНК комплементарная ДНК
ДМСО диметил сульфоксид
ДНКаза I дезоксирибонуклеаза I
ДТ штамм дикого типа
ИПТГ (IPTG) Изопропил-бета- Н-тиогалактозид
ОП (А) оптическая плотность
п.н. пар нуклеотидов
ПА А полиакриламидный
ПЦР полимеразная цепная реакция
РНКаза рибонуклеаза
ЭДТА (EDTA) этилендиаминтетрауксусная кислота
т.п.н. тысяча пар нуклеотидов
Трис (Tris) трис (гидроксиметил) аминометан
ОРС открытая рамка считывания
сск светособирающий комплекс
ФСІ фотосистема I
ФСІІ фотосистема II
ТВЕ Трис борат, ЭДТА
ТХУ трихлоруксусная кислота
ТЕМЕД И, И, N.. М-тетраметилэтилендиамин
АРС аллофикоцианин
ApR устойчивость к ампициллину
CmR устойчивость к хлорамфениколу
dCTP дезоксицитозинтрифосфат
DL низкий свет (20 мкмоль фотонов м'2 с"1)
DFP диизопропилфторфосфат
ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ

процесс сопровождается активацией экспрессии генов isiA и isiB, продукт которых участвует в защите ФС1 (Pakrasi etal., 1985; Bibby et al., 2001).
Различные исследования демонстрируют роль пептидаз при изменении световой интенсивности (Adamska et al., 1996; Porankiewicz et al., 1998; Grossman et al., 2001; HauBiihl et al., 2001; Lensch et al., 2001), в течение теплового (Lippinska et al., 1990; Spiess et al., 1999; Diamant et al., 2001) и солевого (Gerth et al., 1998; Msadezk et al., 1998) стресса, при дефиците питательных веществ (Damerau, St John, 1993; Collier, Grossman, 1994; Katoh et al., 2001) или в результате отравления химическими реагентами (Andersson, Аго, 1997). Исследования в области геномики и протеомики стресса показали, что концентрация продуктов генов, участвующих в адаптивном ответе, включая неспецифические и специфические пептидазы, белки-шапероны, регуляторы избирательного протеолиза (протеасомы), способные снизить ущерб, вызванный стрессом, как правило, возрастает в первые минуты или даже секунды стресса (Hihara et al., 2001; Adamska, 1997; Mary et al., 2004). Несмотря на интенсивное изучение функциональной роли генов, активно транскрибирующихся при неблагоприятных условиях, знания о механизмах, позволяющих фотосинтетической клетке выживать во время стресса, до сих пор остаются фрагментированными.