Изучение клинико-генетической гетерогенности при наследственной и спорадической формах меланомы кожи.

• Автор: Черненко, Полина Андреевна
• Шифр специальности: 14.01.12
• Научная степень: Кандидатская
• Год защиты: 2013
• Место защиты: Москва
• Количество страниц: 135 с. : 15 ил.

ОГЛАВЛЕНИЕ
ОГЛАВЛЕНИЕ

СПИСОК СОКРАЩЕНИЙ

ВВЕДЕНИЕ

ГЛАВА 1. ЛИТЕРАТУРНЫЙ ОБЗОР

ГЛАВА 2. МАТЕРИАЛЫ И МЕТОДЫ

2.1 Характеристика больных меланомой кожи

2.2 Методы молекулярно-генетических исследований

2.2.1 Молекулярно-генетические исследования гена СОКЫ2А/р16 с использованием метода ЭБСР и метилчувствительной ПЦР (МЧ-ПЦР)
2.2.2 Молекулярно-генетические исследования гена ВЛАЛ с использованием биологических микрочипов
2.2.3 Молекулярно-генетические исследования гена ВЛАЛ с использованием аллель-специфичной полимеразной цепной реакции (ПЦР) в режиме реального времени
2.3 Методы статистической обработки данных
ГЛАВА 3. РЕЗУЛЬТАТЫ ИССЛЕДОВАНИЯ СТРУКТУРНО-ФУНКЦИОНАЛЬНЫХ ПЕРЕСТРОЕК ГЕНА СОШ2А У БОЛЬНЫХ МЕЛАНОМОЙ КОЖИ
3.1 Изучение инактивации гена СВ/Ш2А у больных МК
3.1.1 Исследование герминальных мутаций в гене С/Ж/УЛА
3.1.2 Исследование статуса аномального метилирования промоторной области гена СБКА
ГЛАВА 4. РЕЗУЛЬТАТЫ ИССЛЕДОВАНИЯ СОМАТИЧЕСКИХ МУТАЦИЙ ГЕНА ВЛАЛУ БОЛЬНЫХ МЕЛАНОМОЙ КОЖИ
4.1 Валидация методик исследования соматических мутаций гена ВЛАЛ
4.2 Сравнительная характеристика больных в зависимости от мутационного статуса гена ВЛАЛ
4.3 Оценка влияния ВЛАЛ-статуса на клинические характеристики и результаты лечения больных МК в зависимости от возраста
4.4 Оценка влияния ВЛАЛ-статуса на клинические характеристики и результаты лечения больных МК в зависимости от пола
4.5 Оценка влияния ВЛАЛ-статуса на толщину опухоли у больных МК
4.6 Оценка влияния ВЛАЛ-статуса на наличие изъязвления у больных МК
4.7 Оценка влияния мутационного статуса гена ВЛАЛ на отдаленные результаты лечения больных МК

4.7.1 Анализ влияния мутационного статуса гена бйАЛ на шанс развития
прогрессирования у больных МК
ГЛАВА 5. РЕЗУЛЬТАТЫ ИССЛЕДОВАНИЯ БОЛЬНЫХ МЕЛАНОМОЙ КОЖИ С НАЛИЧИЕМ ПЕРВИЧНО-МНОЖЕСТВЕННЫХ ЗЛОКАЧЕСТВЕННЫХ ОБРАЗОВАНИЙ
5.1 Сравнительная характеристика больных в зависимости от наличия первичномножественных злокачественных образований
5.2 Оценка влияния наличия ПМЗО на отдаленные результаты лечения больных МК
5.3 Анализ мутационного статуса гена ВИАИу больных МК с ПМЗО
ЗАКЛЮЧЕНИЕ
ВЫВОДЫ
СПИСОК ЛИТЕРАТУРЫ

СПИСОК СОКРАЩЕНИЙ
МК - меланома кожи
ПМЗО - первично-множественные злокачественные образования
XT - химиотерапия
ЦНС - центральная нервная система
МПЖ - медиана продолжительности жизни
БПВ - беспрогрессивная выживаемость
БРВ - безрецидивная выживаемость
ВДП - время до прогрессирования
OB - общая выживаемость
ОШ - отношение шансов
OR - odds ratio (отношение шансов)
FNCLCC - Fédération Nationale des Centres de Lutte Contre le Cancer ДИ - доверительный интервал wt - ген «дикого типа» mt - ген с мутацией
RT-ПЦР - аллель-специфичная полимеразная цепная реакция (ПЦР) в режиме реального времени

Сигнальный путь PI3K-AKT Ген PIK3CA (PI3K, PHOSPIIATIDYLINOSITOL 3-KINASE, CATALYTIC, 110-KD, ALPHA) (OMIM 171834) (3q26.32). Активация сигнального пути PI3K-AKT может происходить как в результате влияния гена NRAS [153], так и в результате инактивации гена PTEN, наблюдающейся в 10-30% случаев (рисунок 5) [176, 202].
В конце 1980-х годов было обнаружено, что семейство липидных киназ, называющихся фосфатидилинозитол 3-киназы (PI3Ks), посредством влияния на различные сигнальные пути, регулирующие процессы клеточной пролиферации, дифференцировки, выживания и апоптоза клеток, приводят к возникновению и развитию опухолевой ткани [11, 62, 188]. Семейство киназ PI3Ks подразделяется на три класса и несколько подклассов в зависимости от первичной структуры, регуляции и активности липидного субстрата in vitro. Наиболее изученным является класс 1а в связи с его влиянием на развитие злокачественных новообразований. Эти белки состоят из каталитической субъединицы pi 10 и регуляторной субъединицы р85.
Активация гена PIK3CA связана с мутациями в субъединице рПОа, наиболее часто (> 80%) выявляемых в 9-ом экзоне, который кодирует спиральный домен, или 20-ом экзоне, кодирующем киназный домен [63]. В исследовании Janku F. с соавторами мутации протоонкогена PIK3CA были зарегистрированы у 1 (2%) из 55 больных МК [99]. Liu Р. с соавторами суммировали данные, касающиеся частоты генетических перестроек сигнального пути PI3K при различных видах рака, при этом частота мутаций протоонкогена PIK3CA при меланоме составила 9% (у 24 из 278 больных) [120]. Curtin J.A. с соавторами секвенировали вега кодирующую часть гена PIK3CA в 118 образцах первичной меланомы и в 34 клеточных линиях меланомы с «диким типом» гена PTEN. Была обнаружена одна соматическая мутация -замена цистеина на треонин (P539L) в образце первичной МК, а также одна соматическая мутация - замена глицина на аланин (Е970К), два «молчащих» варианта (I121I, F139F) и три (10%) новых герминальных полиморфизма