Фитофторозные корневые гнили малины и земляники, методы их диагностики

• Автор: Копина, Мария Борисовна
• Шифр специальности: 06.01.07
• Научная степень: Кандидатская
• Год защиты: 2013
• Место защиты: Москва
• Количество страниц: 132 с. : ил.

ГЛАВА 1. ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ
1Л. Видовой состав и распространенность возбудителей рода Phytophthora на малине и землянике
1.2. Биологические особенности возбудителей фитофторозных корневых гнилей малины и земляники
1.2.1. Систематическое положение
1.2.2. Морфология возбудителей фитофторозных корневых гнилей малины и земляники
1.2.3. Симптомы проявления фитофторозов, их вредоносность
1.3. Диагностика фитофторозных корневых гнилей малины и
земляники
ГЛАВА II. МАТЕРИАЛЫ И МЕТОДЫ ИССЛЕДОВАНИЙ
ГЛАВА III. ИЗУЧЕНИЕ ВИДОВОГО РАЗНООБРАЗИЯ ВОЗБУДИТЕЛЕЙ ФИТОФТОРОЗНЫХ КОРНЕВЫХ ГНИЛЕЙ МАЛИНЫ И ЗЕМЛЯНИКИ
3.1 Видовой состав возбудителей рода Phytophthora в насаждениях малины, земляники и посадочном материале отечественного происхождения
3.2 Видовой состав возбудителей рода Phytophthora в посадочном
материале импортного происхождения
ГЛАВА IV. ПРИМЕНЕНИЕ МЕТОДА ПЦР ДЛЯ ИЗУЧЕНИЯ ВОЗБУДИТЕЛЕЙ ФИТОФТОРОЗОВ
4.1. Оптимизация методов выделения ДНК из чистых культур возбудителей фитофторозов
4.2. Идентификация возбудителей фитофторозов методом классической ПЦР
4.3. Разработка внутреннего положительного контроля классической ПЦР и ПЦР «в реальном времени»

ГЛАВА V. РАЗРАБОТКА МЕТОДОВ ВЫЯВЛЕНИЯ И ИДЕНТИФИКАЦИИ ОСНОВНЫХ ВОЗБУДИТЕЛЕЙ
ФИТОФТОРОЗОВ МАЛИНЫ И ЗЕМЛЯНИКИ МЕТОДОМ
МУЛЬТИПЛЕКСНОЙ ПЦР «В РЕАЛЬНОМ ВРЕМЕНИ»
5Л. Подбор праймеров и зондов, определение их специфичности
5.2. Оптимизация мультиплексной ПЦР «в реальном времени»
5.3. Определение чувствительности подобранных зондов при
постановке ПЦР «в реальном времени»
ГЛАВА VI. ОПТИМИЗАЦИЯ МЕТОДОВ ВЫДЕЛЕНИЯ ДНК ИЗ БИОПРИМАНОК ПРИ ДИАГНОСТИКЕ ФИТОФТОРОЗНЫХ
КОРНЕВЫХ ГНИЛЕЙ
ГЛАВА VII. ЭКОНОМИЧЕСКАЯ ЭФФЕКТИВНОСТЬ МЕТОДОВ ДИАГНОСТИКИ ОСНОВНЫХ ВОЗБУДИТЕЛЕЙ ФИТОФТОРОЗОВ МАЛИНЫ И ЗЕМЛЯНИКИ
7.1. Экономическая эффективность пробоподготовки образцов для диагностики фитофторозов малины и земляники методом ПЦР
7.2. Экономическая эффективность метода мультиплексной ПЦР в режиме реального времени при диагностике фитофторозов малины и
земляники
ВЫВОДЫ
РЕКОМЕНДАЦИИ ПО ПРАКТИЧЕСКОМУ ПРИМЕНЕНИЮ
СПИСОК ЛИТЕРАТУРЫ
ПРИЛОЖЕНИЕ

Малина и земляника наиболее популярны среди ягодных культур. Скороспелость, урожайность, содержание полезных веществ ставят эти культуры на первое место, как в промышленном, так и в любительском садоводстве.
В мире, по данным FAOSTAT (2011), выращивается около 543 тыс. тонн ягод малины в год, производство земляники, на долю которой приходится свыше 70 % общемирового производства ягод, составляет около 4,5 млн. тонн в год. Крупнейшими производителями ягод земляники являются США, Испания, Россия, Корея, Япония, Польша, Италия, Мексика, Турция и Германия. Лидером по производству является США, здесь выращивается 25-28% мирового производства земляники.
Основное мировое товарное производство малины сосредоточено в странах Западной Европы (Сербия, Польша, Германия, Венгрия, Великобритания) и Северной Америке (США, Канада). По информации FAOSTAT в 2011 году лидером по производству малины была Россия, выращивая 140 тыс. тони ягод в год, что составляет 25,7% мирового производства,
Как и многие культурные растения, земляника и малина подвержены поражению многих грибных, бактериальных и вирусных патогенов, вызывающих заболевания всего растения. Проявление инфекции на надземных частях, достаточно известны и хорошо распознаваемы, в то время как поражения подземных органов диагностируются значительно труднее. Среди патогенов, поражающих корневую систему, известны возбудители ризоктониозной гнили Rhizoctonia spp., питиозной гнили Pythium spp., виды из родов Verticillium и Fusarium. Однако, высокую распространенность и наибольшую вредоносность во всем мире имеют фитофторозные корневые гнили ягодных культур. Эти болезни приводят к гибели от 40 % до 78% растений за вегетационный период (Abad et al., 2008; Kroon, 2010). Также эти болезни являются одним из факторов, лимитирующих получение здорового посадочного материала. Вредоносность

Комплекс возбудителей фитофторозиых корневых гнилей Ph. nicotianae, Ph. cactorum и Ph. citricola был выявлен в Москве, Коломенском и Ленинском районах Московской области. Как было сказано выше, в последнем районе был также идентифицирован карантинный возбудитель Ph. fragariae var. rubi. В Пушкинском районе был выявлен только один возбудитель Ph. nicotianae, его выделяли из 11,1% растений. В Егорьевском районе было обнаружено 2 представителя рода Phytophthora - Ph. nicotianae и Ph. cactorum, частота встречаемости которых составила 27,2% и 9,1 % соответственно
обследованных насаждениях малины Архангельской и Рязанской областей были выявлены единичные представители корневых Phytophthora spp.
В обследованных насаждениях малины и земляники помимо возбудителей фитофорозов были выявлены возбудители питиозных корневых гнилей (Pythium spp). Причем эти оомицегы выделялись как из пораженных растений, так и из прикорневой почвы. Наиболее часто в исследуемых образцах идентифицировали вид Р. ultimum в среднем 17,3% растений земляники и 25,8% малины. Менее встречаемыми были виды Р. debaryanum и Р. acanticum выявленные соответственно в 3,2% малины и 4,3%, 6,5% земляники.
О выявлении представителей семейства Pythiaceae ранее сообщалось в исследованиях Головина С.Е. (2010), согласно которым в совхозе «Крекшино» и АОЗТ «Совхоз им. Ленина» Московской области на плантациях земляники, отмечали развитие интенсивной корневой гнили, вызванной оомицетами из рода Pythium - Р. salpingophorum, Р. acanticum и Pythium intermedium. Из корневх отпрысков малины (сорт Лазаревская), выращиваемых в ящиках с горфо-песчаной смесью, с симптомами черной ножки выделяли Р. ultimum и Р. debatyanum.
Таким образом, в обследованных насаждениях малины и земляники (Московской, Рязанской и Архангельской областях) было отмечено наличие трех наиболее часто встречаемых видов рода Phytophthora, связанных с корневыми гнилями: Ph. nicotianae, Ph. cactorum и Ph. citricola. Высокая зараженность