Биотехническая система автоматизированных исследований препаратов культур клеток, инфицированных хламидиями

• Автор: Артюхова, Ольга Александровна
• Шифр специальности: 05.11.17
• Научная степень: Кандидатская
• Год защиты: 2013
• Место защиты: Москва
• Количество страниц: 97 с. : ил.

СОДЕРЖАНИЕ

СПИСОК ПРИНЯТЫХ СОКРАЩЕНИЙ
ВВЕДЕНИЕ
Г лава 1. Анализ задач и особенностей проведения исследования препаратов культур клеток, инфицированных хламидиями
1.1. Медицинское, эпидемиологическое и социальное значение хламидийной инфекции
1.2. Методы лабораторной диагностики хламидиоза
1.2.1. Особенности жизненного цикла хламидий
1.2.2. Классификация методов лабораторной диагностики
хламидиоза
1.3. Особенности визуального анализа препаратов культур клеток, инфицированных хламидиями
1.3.1. Особенности диагностики хламидийной инфекции
1.3.2. Использование культурального метода для оценки
степени инфицирования клеток
1.4. Выводы к Главе
Глава 2. Проектирование биотехнической системы автоматизированных исследований препаратов культур клеток, инфицированных хламидиями
2.1. Требования к разрабатываемой биотехнической системе
2.1.1. Структурная схема биотехнической системы
2.1.2. Характеристики качества работы биотехнической
системы
2.2. Разработка и исследование метода автофокусировки
2.2.1. Методы автофокусировки
2.2.2. Характеристики резкости
2.2.3. Оценка качества характеристик резкости

2.2.4. Результаты сравнительных исследований характеристик резкости
2.2.5. Разработка и исследование метода автофокусировки
2.3. Выводы к Главе
Глава 3. Разработка метода анализа флуоресцентно-микроскопических изображений препаратов культур клеток, инфицированных хламидиями
3.1. Анализ цветовых особенностей объектов на исследуемых изображениях
3.2. Алгоритм сегментации изображений препаратов культур клеток, инфицированных хламидиями
3.3. Быстрый алгоритм бинаризации по методу Ниблэка
3.4. Выводы к Главе
Глава 4. Экспериментальные исследования биотехнической системы автоматизированных исследований препаратов культур клеток, инфицированных хламидиями
4.1. Макет специального программного обеспечения
4.2. Разработка и исследование метода автоматизированных исследований препаратов культур клеток, инфицированных хламидиями
4.2.1. Содержание экспериментальных исследований
4.2.2. Экспериментальное исследование качества обнаружения хламидийных включений
4.2.3. Разработка и исследование количественных характеристик хламидийных включений
4.3. Выводы к Главе
ОСНОВНЫЕ РЕЗУЛЬТАТЫ И ВЫВОДЫ
СПИСОК ЛИТЕРАТУРЫ
ПРИЛОЖЕНИЕ

СПИСОК ПРИНЯТЫХ СОКРАЩЕНИЙ
БТС биотехническая система
БЭС Байесовская энтропия спектра
ВОЕ - включениеобразующая единица
РТ ретикулярное тельце
СКГП - Сумма квадратов гауссовых производных
спо - специальное программное обеспечение
УГХ - урогенитальный хламидиоз
УРО - уровень равновероятной ошибки
ФИТЦ - флуоресцеина изотиоцианат
эт элементарное тельце

Таблица 3 - продолжение
15 Характеристика Мейсона и Грина = :-Т), 1>Т ХЕЛ(*,.у)-/(*,т) гг, X У где 1 - ч ХХЛ(*,.у) х у Д(х, у) = 2(/(х, у -1) - /(х, у +I))2 + + 2(/(х -1, у) - /(х +1, у))2 + + (Дх-1,у-1)-/(х + 1,у + 1))2 + + (/(* -1, у +1) - /(х +1, у -1))2.
16 Пороговое число пикселей Л= ХХ>(/ЛтХЛ у X (г, ч I1’ если/{х, у) < в, где 4/(х,у),6') = ^ [0, в противном случае.
17 Энергия изображения Л— = ХЕ/(*>х)2, у X где f{x,y)>в.
18 Энтропия реп,гору =-Ер(0-1о&(/»(0), / г л ^ где р(.1) = —^- — относительная частота встречаемости пикселя с интенсивностью /.
4. Характеристики, основанные на преобразовании изображения
19 Характеристика Файрстоуна Л—/ = '1о8,о(0, где Р - процентное содержание энергии в ьтой спектральной компоненте изображения.