Спонтанная и промотированная ассоциация олигоглициновых пептидов и гликопептидов

• Автор: Цыганкова, Светлана Владимировна
• Шифр специальности: 02.00.10
• Научная степень: Кандидатская
• Год защиты: 2013
• Место защиты: Москва
• Количество страниц: 110 с. : ил.

СОДЕРЖАНИЕ
СПИСОК ИСПОЛЬЗУМЫХ СОКРАЩЕНИЙ
ВВЕДЕНИЕ
СПИСОК ИСПОЛЬЗУЕМЫХ ТЕРМИНОВ
ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ
1.1. Самоассоциация: понятие и силы, ее вызывающие
1.2. Самоассоциация пептидов
1.2.1. Ассоциация самокомплементарных пептидов
1.2.2. Ассоциация амфифильных пептидов
1.2.3. Ассоциация, приводящая к р-амилоидным наноструктурам
1.2.4. Ассоциация пептидов на поверхности
1.3. Полиглицин и полиглициновые структуры
1.3.1. Полиглицин-1 и полиглицин-П
1.3.2. Самоассоциация олигоглициновых производных
1.3.3. Тектомеры
1.4. Природные глицин-насыщенные белки
1.5. Методы исследования супрамолекулярных структур
1.5.1. Атомно-силовая микроскопия 3
1.5.2. Основные режимы АСМ
1.5.3. Поверхности
1.5.3.1. Физическая сорбция
1.5.3.2. Ковалентная привязка молекул к поверхности
ОБСУЖДЕНИЕ РЕЗУЛЬТАТОВ
1. Синтез двухантенных олигоглицинов и их гликопроизводных
2. Изучение ассоциации двухантенных олигоглицинов в растворе методом динамического светорассеяния
2.1. Двухантенные олигоглицины с декаметиленовым кором
2.2. Двухантенные олигоглицины с этиленовым кором
2.3. Двухантенные олигоглицины с олигоэтиленгликолевым кором
3. Изучение ассоциации антенных олигоглицинов методом атомносиловой микроскопии

3.1. Четырехантенный пептид [Н-С1у7№1СН2]4С
3.2. Трехантенный пептид [Н-ОКу-МЮРЬЬССНз
3.3. Двухантенные олигоглицины
4. Противовирусная активность
ЗАКЛЮЧЕНИЕ
ВЫВОДЫ
5. Экспериментальная часть
5.1. Синтез активированных эфиров
5.2. Синтез двухантенных олигоглицинов
5.2.1. Синтез олигоглициновых производных с ОЭЕ кором
5.2.2. Синтез олигоглициновых производных с С2-кором
5.2.3. Синтез олигоглициновых производных с С10-кором
5.3. Синтез двухантенных гликопептидов
5.4. Изучение ассоциации в растовре и на поверхности
5.4.1. Динамическое светорассеяние
5.4.2. Атомно-силовая микроскопия
5.5. Изучение противовирусной активности гликопептидов
БЛАГОДАРНОСТИ
СПИСОК ЛИТЕРАТУРЫ

СПИСОК ИСПОЛЬЗУЕМЫХ СОКРАЩЕНИЙ
AP Р-амилоидный пептид
Ac ацетил
Ala аланин
APTES аминопропилтриэтоксисилан
Ar арил
Arg аргинин
Asp аспарагиновая кислота
Bn бензил
Boc трет-бутилоксикарбонил
br. s уширенный синглет
BSA бычий сывороточный альбумин
d(d) дублет (дублетов)
Et этил
Et3N триэтиламин
Gly глицин
Glu глутаминовая кислота
HOPG высокоориентированный пирографит
H-CB33b водородная связь
Ile изолейцин
Leu лейцин
Lys лизин
m мультиплет
Me метил
NSu Ы-оксисукцинимид
03r олигоэтиленгликоль
PEG полиэтиленгликоль
Phe фенилаланин
6'SLN Ыеи5Аса2-60а1р 1МЫсЫАсР
3’SL №и5Ассс2-ЗСаірі-401сР
spl ОСН2(р-СбН4)ННСОСН2ННСО(СН2)4СО
sp2 0(СН2)3МНС0(СН2)4С
sp3 ШСОСН2ШСО(СН2)4СО
t триплет

самоассоциации в обширные тектомеры, из-за пространственных затруднений больших углеводных заместителей и поэтому малоэффективны в ингибировании вируса гриппа, поскольку плотная упаковка остатков а-Лг-ацетилнейраминовой кислоты затрудняет их взаимодействие с рецептор-связывающими сайтами гемагглютинина. В этом случае небольшие ассоциаты сосуществуют с мономерными формами. Гликозилированные тектомеры стабильны в присутствии солей в физиологических концентрациях; обратимое разрушение наблюдается только в концентрированных растворах бромида лития или при нагревании выше 60°С.
ассоциация
Метод А ацилирование
ацилирование
ассоциация
Метод В
Рисунок 24. Ассоциация (глико)олигоглициновых производных.
1.4. Природные глицин-насыщенные белки
В составе обычных белков нередко встречаются фрагменты с двумя-тремя соседними глицинами; общепринято, что эти участки играют шарнирную роль, обеспечивая гибкость в данном сайте белка, то есть, небольшие олигоглициновые участки являются максимально гибкими структурами, в то время как ассоциированные в полиглицин-Н цепи, наоборот - предельно жесткими. Известно два класса белков, в состав которых входят олигомеры или даже гомополимеры глицина. Структурные белки растительных клеток [58] могут содержать до 60% глицина в составе полипептидной цепи, где олигоглициновые фрагменты содержат до шести остатков С1у подряд. В клетках млекопитающих, в составе белка тубулина, обнаружены уникальные цепи, состоящие только из глицина,