Полиморфизм генов биотрансформации ксенобиотиков (CYP2C9, CYP4F2, CYP2D6, GSTM1, GSTT1) и гена VKORC1 в популяциях коренных этносов Северной Сибири

• Автор: Корчагина, Роза Павловна
• Шифр специальности: 03.02.07
• Научная степень: Кандидатская
• Год защиты: 2012
• Место защиты: Новосибирск
• Количество страниц: 110 с. : ил.

ОГЛАВЛЕНИЕ
СПИСОК ИСПОЛЬЗОВАННЫХ СОКРАЩЕНИЙ
ВВЕДЕНИЕ
ГЛАВА Е ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ
1.1. Понятие о полиморфизме генов
1.2. Понятие о системе биотрансформации ксенобиотиков
1.3.1 фаза биотрансформации ксенобиотиков. Цитохромы Р450
1.3.1. Цитохром Р450 2С9 и его ген СУР2С9 (структура, функции, полиморфизм, популяционные частоты)
1.3.2. Цитохром Р450 2Б6 и его ген СУР2Вб (структура, функции, полиморфизм, популяционные частоты)
1.3.3. Цитохром Р450 4Б2 и его ген СУР4Р2 (структура, функции, полиморфизм, популяционные частоты)
1.4. II фаза биотрансформации ксенобиотиков
1.4.1. Глутатион-8-трансферазы
1.4.2. Структура и хромосомная локализация ОЛТЫ!-гена. С8ТМ1 и связь с заболеваниями
1.4.3. Структура и хромосомная локализация 08777-гена. (75777 и связь с заболеваниями
1.5. Ген УКОЛС1 (строение, полиморфизм). Функции фермента УКОЛС1
ГЛАВА 2. МАТЕРИАЛЫ И МЕТОДЫ
2.1. Описание изучаемых популяций коренных этносов Сибири
2.1.1. Происхождение самодийских народов
2.1.2. Селькупы
2.1.3. Ненцы
2.1.4. Нганасаны
2.1.5. Русские
2.2. Методика выделения ДНК
2.3. Генотипирование однонуклеотидных замен в генах СУР2С9, СУР2В6, СУР4Р2 и УК(ЖС1
2.4. Выявление делений в генах СЛТМ! и СЛТТ!
2.5. Метод фиксированного индекса
2.6. Метод генетических дистанций Харпендинга и Дженкинса
2.7. Статистическая обработка данных
ГЛАВА 3. РЕЗУЛЬТАТЫ ИССЛЕДОВАНИЯ
3.1. Распределение полиморфных вариантов гена CYP2C9 в исследованных популяциях и межпопуляционные различия
3.2. Распределение полиморфных вариантов гена CYP2D6 в исследованных популяциях и межпопуляционные различия
3.3. Полиморфизм G1347A гена CYP4F2 в исследованных популяциях и межпопуляционные различия
3.4. Распределение генотипов GSTM1 и GSTT1 в исследованных популяциях и межпопуляционные различия
3.5. Полиморфизм С1173Тгена VKORC1 в исследованных популяциях и межпопуляционные различия
3.6. Значения Fst, вычисленные на основе частот вариантов CYP2C9*2, CYP2C9*3,
CYP4F2*3, CYP2D6*3, CYP2D6*4n VKORC1 1173T
3.7. Построение карт генетических дистанций
ГЛАВА 4. ОБСУЖДЕНИЕ РЕЗУЛЬТАТОВ
ВЫВОДЫ
СПИСОК ЛИТЕРАТУРЫ

СПИСОК ИСПОЛЬЗОВАННЫХ СОКРАЩЕНИЙ
АКО - аминокислотные остатки ДНК - дезоксирибонуклеиновая кислота кДа - килодальтон мкл - микролитр
НАДФ+ - никотинамиддинуклеотидфосфат окисленный НАДФН - никотинамиддинуклеотидфосфат восстановленный нм - нанометр
НПВП - нестероидные противовоспалительные препараты
ППЦ - полипептидная цепь
п.н. - пара нуклеотидов
ПЦР - полимеразная цепная реакция
т.п.н. - тысяча пар нуклеотидов
УДФ - уридиндифосфат
сМТР - дезоксирибонуклеозидтрифосфаты

ГЛАВА 2. МАТЕРИАЛЫ И МЕТОДЫ
2.1. Описание изучаемых популяций коренных этносов Сибири
В настоящем исследовании приняли участие этнические представители пяти популяций: селькупы, лесные ненцы, тундровые ненцы Ямало-Ненецкого
автономного округа (ЯНАО), нганасаны полуострова Таймыр и русские Северной Сибири, проживающие в Ямало-Ненецком автономном округе и Красноярском крае (всего 1475 человек).
Генетический материал собирался во время экспедиций в ЯНАО и п-ов Таймыр сотрудниками лаборатории популяционной этногенетики ИЦиГ СО РАН под руководством к.б.н. Л. П. Осиповой. Выборки формировались из пула этнических представителей селькупов (N=330), тундровых (N=310) и лесных (N=303) ненцев, нганасан (N=186), русских (N=346) (последние использовались в качестве группы сравнения) на основании изучения генеалогических и демографических данных. В выборки не вошли метисы разных уровней от браков самодийцев с русскими и представителями других пришлых этносов. Забор крови производился квалифицированными медицинскими работниками по международным правилам с использованием «Информированного согласия» от добровольцев, практически здоровых на момент исследования.
Селькупы, ненцы и нганасаны, коренные малочисленные народы Сибири (КМНС), относятся к самодийской ветви уральской языковой семьи. По антропологическим и генетическим данным в их генофондах фиксируются европеоидная и монголоидная компоненты [Дебец, 1947; Бикеппк е? а.1, 1978; Карафет и др., 1994; Осипова, 1994; Дербенева и др., 2002; КагаГег et а1., 2002; Аксянова и др., 2003; Гольцова и др., 2005]. Наличие европеоидной компоненты, по мнению В. И. Васильева, объясняется тем, что «этническое ядро современных северо-самодийских народностей сформировалось в результате синтеза древнего аборигенного субстрата Заполярья и самоедоязычных групп, имевших контакт с европеоидами на разных этапах своей истории» [Васильев, 1979].
Коренные малочисленные народы Сибири важны для изучения происходящих в популяциях человека генетических процессов в силу относительной изолированности этих этносов, ведущей к повышенному