Петельно-доменная организация хромосом животных

• Автор: Глазков, Михаил Васильевич
• Шифр специальности: 03.00.15
• Научная степень: Докторская
• Год защиты: 1999
• Место защиты: Москва
• Количество страниц: 366 с. : ил.

ИСПОЛЬЗУЕМЫЕ СОКРАЩЕНИЯ:
ГСПХ - гранулярный слой периферического хроматина;
ДТТ - дитиотреитол;
ИГ - иммуноглобулины;
мДНК - фрагменты хромосомной ДНК, прочно связанные с ядерным матриксом;
ПААГ - полиакриламидный гель;
СК - синаптонемный комплекс;
скДНК - фрагменты хромосомной ДНК, выделенные из СК;
слДНК - «случайные» фрагменты ДНК, смоделированные на основе равномерного распределения всех 4-х нуклеотидов с помощью датчика случайных чисел; срДНК - фрагменты хромосомной ДНК, выделенные из сердцевин розетко-подобных структур;
ФМСФ - фенилметилеульфонилфторид;
2-м.э. - 2-меркаптоэтанол;
ЭДТА - этилендиаминтетрауксусная кислота;
ялДНК - фрагменты хромосомной ДНК, выделенные из ядерной ламины;
яоДНК - фрагменты хромосомной ДНК, выделенные из ядерных оболочек;
5’флДНК - фрагменты ДНК, фланкирующие 5’-области ткане-специфич-ных эукариотических генов;
ARBP - Attachment Region Binding Protein;
ARS - автономно реплицирующиеся сегменты ДНК;
BSA - бычий сывороточный альбумин;

CNM - Chicken Nuclear Membrane;
DCR - Dominant Control Region;
HMG - High Mobil Group;
HRE -Hormone Responsive Element;
LCR - Locus Control Region;
LINE - длинные диспергированные по геному повторы ДНК;
LIS - 3’, 5’-дииодосалицилат лития;
MARs/SARs - Matrix/Scaffold Associated Regions; m-AMSA - amsacrine;
RAP-1 - Repressor Activator Binding Protein-1;
SAF-A - Scaffold Attachment Factor A;
SAF-B - Scaffold Attachment Factor B;
SATB1 - Special AT-rich Sequence-Binding Protein 1; scs/scs’ - specialized chromatin structures;
SINE - короткие диспергированные по геному повторы ДНК;
SDS - додецил сульфат натрия;
VM26 - teniposide;
5’HS, 3’IIS - сверхчувствительные к ДНКазе I сайты, располагающиеся в 5’- и в 3’-областях генов, соответственно;
ОГЛАВЛЕНИЕ
I. ВВЕДЕНИЕ
И. ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ
II. 1. Интерфазные хромосомы соматических клеток
II. 1.1 .Ультраструктурный анализ интерфазных хромосом
И. 1.2. Нуклеазный метод анализа организации интерфазных хромосом
II. 1.3. Ассоциация интерфазных хромосом с ядерной оболочкой
11.2. Петельная организация метафазных хромосом
11.2.1. Линейная неоднородность метафазных хромосом
И. 3. Петельная организация хромосом в мейозе
11.4. Нуклеоиды - экспериментальная модель для изучения петельной
организации хромосомной ДНК в интерфазных ядрах
11.4.1. Молекулярный анализ нуклеоидов
11.4.2. Электронно-микроскопический анализ нуклеоидов
и лишенных гистонов интерфазных хромосом
II. 5. Я дерн ы й матрикс
11.5.1. Состав ядерного матрикса
11.5.2. Остаточные ядерные белки,
ассоциированные с хромосомной ДНК
11.5.3. Нуклеотидные последовательности хромосомной ДНК, ассоциированные с ядерным матриксом
11.5.4. Репликация хромосомной ДНК и ядерный матрикс

данном типе клеток, реплицируются рано в S-фазе, а неактивные гены реплицируются в поздней S-фазе. Авторами был сделан вывод о том, что постоянно-активные гены ("гены домашнего пользования") всегда локализованы в R-бендах, в то время как ткане-специфические гены, обычно, локализованы в G-бендах (Goldman et al., 1984). Однако, отмечается (Holmquist et al., 1987), что корреляция между временем репликации ткане-специфи-ческих генов в S-фазе и их локализация в G-бендах не является абсолютной. Ткане-специфичный ген, локализованный в поздно-реплицирующем-ся G-бенде, сам реплицируется в ранней S фазе в тех типах клеток, где он экспрессируется.
Различия в степени компактизации ДНК в составе G- и R-бендов показаны при гидролизе хромосом ДНКазой (Schweizer, 1977), а также при катион-зависимой частичной деконденсации хромосом (Zatsepina et al., 1983; Зацепина и др., 1985). Результаты этих исследований свидетельствуют о том, что ДНК в составе G-бендов имеет более плотную упаковку по сравнению с ДНК в составе R-бендов.
Камингс и Окада (Comings, 1978; Okada, Comings, 1979) высказали предположение о том, что G-сегменты метафазных хромосом образованы скоплением большого количества элементарных хромомеров, имеющих ро-зетко-подобную организацию, в то время как R-сегменты лишены хромомерной организации. При этом, было постулировано, что розетко-подоб-ная организация - это форма организации сателлитной ДНК.