Генетические и антигенные варианты ротавируса человека, циркулирующие на Европейской территории России

• Автор: Новикова, Надежда Алексеевна
• Шифр специальности: 03.00.06
• Научная степень: Докторская
• Год защиты: 1998
• Место защиты: Нижний Новгород
• Количество страниц: 300 с. : ил.

МИНИСТЕРСТВО ЗДРАВООХРАНЕНИЯ РОССИЙСКОЙ ФЕДЕРАЦИИ Нижегородский научно-исследовательский институт эпидемиологии
и микробиологии
На правах рукописи
Новикова Надежда Алексеевна
ГЕНЕТИЧЕСКИЕ И АНТИГЕННЫЕ ВАРИАНТЫ РОТАВИРУСА ЧЕЛОВЕКА, ЦИРКУЛИРУЮЩИЕ НА ЕВРОПЕЙСКОЙ ТЕРРИТОРИИ РОССИИ
( 03.00.06. - Вирусология )
Диссертация на соискание ученой степени доктора биологических наук
Научный консультант: академик РАМН, доктор медицинских наук, профессор С.Г.Дроздов
Нижний Новгород - 1998 г.

ОГЛАВЛЕНИЕ
І. ВВЕДЕНИЕ

II. ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ

III.МАТЕРИАЛЫ И МЕТОДЫ

IV. РЕЗУЛЬТАТЫ И ИХ ОБСУЖДЕНИЕ.
1.Характеристика генетических вариантов ротавируса человека с использованием электрофоретипирования геномной РНК.
1.1.Оптимизация методических приемов электрофорети-
1.2.Анализ электрофоретипов РНК ротавируса человека
1.3.Особенности доминирования генетических вариантов ротавируса группы А на территориях ряда городов.
2.Характеристика антигенных вариантов ротавируса человека с использованием анализа геномной РНК.
2.1.Создание ДНК-зондов для выявления и подгрупповой дифференциации ротавирусов.
2.1.1.Клонирование генома ротавирусов с 3-м ЭФ-типом РНК
2.1.2.ДНК-зонд для выявления ротавирусной РНК различных ЭФ-типов
2.1.3.ДНК-зонд для специфического выявления РНК ротавирусов Б11 подгруппы
2.1.4.ДНК-зонд для специфического выявления РНК ротавирусов Б1 подгруппы
2.2.Анализ гена УР7 природных штаммов ротавируса че-
пирования РНК

европейской части России

ловека.
2.2.1.Определение G-серотипа ротавируса на основе анализа нуклеотидной последовательности гена

2.2.2.ДНК-зонды для выявления РНК ротавирусов G1
G3-, С4-серотипов
2.3.Дифференциация природных штаммов ротавируса методом молекулярной гибридизации с использованием
ДИГ-ДНК-зондов
3.Изучение эпидемиологических и клинических особенностей ротавирусной инфекции, вызванной различными генетическими и антигенными вариантами ротавируса.
3.1.Многолетние наблюдения циркуляции ротавирусов в г.Нижнем Новгороде.
3.1.1.Возрастные особенности ротавирусной инфекции
3.1.2.Сезонность ротавирусной инфекции
3.1.3.Анализ циркуляции ротавирусов с различными ЭФ-типами РНК
3.1.4.Анализ циркуляции ротавирусов разных серо-типов
3.2.Характеристика гастроэнтерита, вызванного разными генетическими и антигенными вариантами ротавируса группы А.
3.2.1.Клинические проявления гастроэнтерита
3.2.2.Выявление РНК ротавируса в носоглоточных смывах больных РВГЭ

ном состоянии в цитоплазме инфицированных клеток, что свидетельствует о его роли в вирусной репликации [191,523].
Репродукция ротавируса в чувствительной клетке.
Информация о структуре и функциях белков, кодируемых рота-вирусным геномом, помогла понять молекулярные механизмы репродукции ротавируса в инфицированной клетке. Однако, следует отметить, что многие моменты репродуктивного цикла все еще остаются неясными.
Ротавирусная инфекция начинается прикреплением вируса к специфическому клеточному рецептору, находящемуся на клетках цилиндрического эпителия, покрывающего вершины ворсинок слизистой оболочки тонкого кишечника. Изучение природы клеточных рецепторов РВ животных в реакции гемагглютинации и при их взаимодействии с фракцией энтероцитов показало участие в связывании нейраминовой кислоты [113,459]. В то же время, для РВ человека таких убедительных данных не получено. Существует мнение, что РВ человека могут иметь и отличные от РВ животных эпитопы связывания [208]
Долгое время открытым оставался вопрос о прикрепительном белке ротавириона. Первоначально считалось, что таким белком является VP7, поскольку только он был связан с клетками однослойных культур при нанесении экстракта зараженных клеток, содержащих радиоактивные ротавирусные белки. Разрушение дисуль-фидных связей в VP7 препятствовало узнаванию клеточных рецепторов [13,465]. Однако, в процессе определения вирусного белка, адгезирующегося in vivo с клетками мишенями при ротавирусной инфекции установлено, что с клетками МА-104 и эритроцитами мыши