Поиск и изучение мутаций в гене BRCA1 у больных семейными формами рака молочной железы в Санкт-Петербурге

• Автор: Грудинина, Наталья Андреевна
• Шифр специальности: 03.00.04
• Научная степень: Кандидатская
• Год защиты: 2004
• Место защиты: Санкт-Петербург
• Количество страниц: 155 с. : ил.

1. ВВЕДЕНИЕ
1.1. Актуальность проблемы
1.2. Научная новизна
1.3. Цель работы
1.4. Задачи
2. ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ
2.1. Строение молочной железы
2.2. Формы пака молочной железы. Классификация И
2.3. Статистика заболеваемости раком молочной железы
2.4. Возможные механизмы возникновения рака при мутациях в
генах опухолевых супрессоров
2.5. Тканеспецифичность проявления мутаций в гене ВЯСА1
2.6. Заболевания, связанные с мутациями в генах ВЯСА1 и ВЯСА2
2.7. Наследственная предрасположенность к раку молочной железы
2.8. Структура гена и белка В11СА1
2.9. Роль ВЯСА1 в регуляции транскрипции
2.9.1. С-Мус и ВЯСА1
2.9.2 СВР и ВЯСА1
2.9.3 ЯНА и ВЯСА 1
2.9.4 п53 и ВЯСА1
2.10. Роль В11СА1 в репарации ДНК
2.11. Роль ВЯСА1 в посте и дифференцировке клеток
2.12. Мутации гена ВЯСА1
2.13. Спектп мутаций в гене ВЯСА1 в пазных популяциях
3. МАТЕРИАЛЫ И МЕТОДЫ
3.1. Пациенты
3.2. Выделение ДНК из свежей и замороженной крови по методу Кюнкеля
3.2.1 Выделение ДНК из свежей крови
3.2.2 Выделение ДНК из замороженной крови
3.3. Электрофорез ДНК в агарозном геле
3.4. Полимеразная цепная реакция
3.5. Электрофорез ДНК в полиакриламидном геле
3.6. Электрофорез в ПААГ в денатурирующих условиях
3.7. Гетеродуплексный анализ
3.8. ЗБСР-анализ
3.9. Окрашивание образцов ДНК
3.9.1 Окрашивание бромистым этидием
3.9.2 Окрашивание нитратом серебра
3.10. Клонирование
3.10.1 Лигирование
3.10.2. Трансформация Е.соИ
3.10.3. Идентификация рекомбинантных клонов путем амплификации клонированных последовательностей
3.11. Секвенирование ДНК
3.12. Статистические методы
4. РЕЗУЛЬТАТЫ
4.1. Мутация 2963бе110 (с.2963-2972бе110)
4.2. Мутация 5382шзС (с.5382-5383шзС)
4.3. Мутация 38Ше15 (с.1234-1235йе15)
4.4. Мутация 3875бе14 (с.1252-1253бе14)
4.5. Мутация 2274тзА (с.720тзА)
4.6. Мутация Ш203Х (с.3726С>Т)
4.7. Мутация Е1250К (с.38670А)
4.8. Полиморфизм 86948 (с.2201С>Т)
4.9. Полиморфизм Ь771Ь (с.2430Т>С)
4.10. Полиморфизм Е1038в (с. 3232А>С)
5. ОБСУЖДЕНИЕ РЕЗУЛЬТАТОВ
5.1. Введение

5.2. Мутация 5382insC — одна из наиболее распространенных в мире
5.3. Впервые обнаруженная мутация 2963dell0
5.4. Роль мутаций 3819del5 и 3875del4 в развитии предрасположенности
к заболеванию
5.5. Редкая мутация 2274insA
5.6. Нонсенс-мутация R1203X
5.7. Миссенс-мутация Е1250К - мутация или полиморфизм?
5.8. Полиморфизмы E1038G, S694S и L771L
5.9. Поиск мутаций в 5 экзоне гена BRCA1
5.10. Заключение
6. ВЫВОДЫ
7. СПИСОК ЛИТЕРАТУРЫ

Таблица 2.6. Продолжение
Страна Заболевание (Число обследованных) Преобладающие мутации Редкие мутации Литературный источник
название Доля носителей
Венгрия Любой*** РМЖ (500) С6Ш 5382тзС 1.8% 1.4% 1 ХЗОсЗАО, осуществлялось тестирование только на наиболее распространенные мутации Уап Иег Ьооц й а1., 2000(6)
Любой РЯ (90) ШйеШЗ С6Ю 5382тзС 5.6% 4.4% 1.1% Осуществлялось тестирование только на наиболее распространенные мутации Уап Оег Ьооц й а1., 2000(6)
Великобри- тания РЯ(ЮЗ) 3875(1е14 4184бе14 1284бе140 43040-А 2073бе1А 5381 ниС 4% 4% 3% 3% 2% <1% Всего 29 различных мутаций (20 мутаций, приводящих к сдвигу рамки считывания, 4 нонсенс-мутации, 4 мутации сайтов сплайсинга, 1 миссенс-мутация). Мутация 185с1с1АО была обнаружена в одной семье. вауЛег е! а!., 1999
Турция РМЖ и РЯ (28) 2990тэА Ю203Х 3.6% 3.6% Исследовали 11 экзон и тестировали на наличие мутаций 185с1е1АС1,5382тзС, Туг975Х. Маг^ш^1и ус! а1., 2003
РМЖ и РЯ, РМЖ (105) 53821шС 38Ше15 2% 1% 1851шА, 1623<1е15,2139(1е1С, 2476(1е1Т, 4508бе1С (новая). Исследовали 11 экзон и тестировали на наличие мутаций 1 В5(3е1 АО, 5382тзС и тч-14+1<1еЮ. Уаг1с1 й а!., 2000
РМЖ и РЯ (15) 5382тяС 56220Т 6.7% 6.7% Не найдено Ва1с1 е1 а!., 1999

(Продолжение на следующей странице)