+
Действующая цена700 499 руб.
Товаров:
На сумму:

Электронная библиотека диссертаций

Доставка любой диссертации в формате PDF и WORD за 499 руб. на e-mail - 20 мин. 800 000 наименований диссертаций и авторефератов. Все авторефераты диссертаций - БЕСПЛАТНО

Расширенный поиск

Роль поли(ADP-рибозо)полимеразы 1 в координации процесса эксцизионной репарации оснований ДНК

  • Автор:

    Суханова, Мария Владиславовна

  • Шифр специальности:

    03.00.04

  • Научная степень:

    Кандидатская

  • Год защиты:

    2008

  • Место защиты:

    Новосибирск

  • Количество страниц:

    139 с. : ил.

  • Стоимость:

    700 р.

    499 руб.

до окончания действия скидки
00
00
00
00
+
Наш сайт выгодно отличается тем что при покупке, кроме PDF версии Вы в подарок получаете работу преобразованную в WORD - документ и это предоставляет качественно другие возможности при работе с документом
Страницы оглавления работы

ОГЛАВЛЕНИЕ ПРИНЯТЫЕ СОКРАЩЕНИЯ
ВВЕДЕНИЕ
ГЛАВА 1. РОЛЬ ПОЛИ(АПР-РИВОЗО)ПОЛИМЕРАЗЫ-1 В КООРДИНАЦИИ
КЛЕТОЧНЫХ ПРОЦЕССОВ В ОТВЕТ НА ПОВРЕЖДЕНИЕ ДНК (ЛИТЕРАТУРНЫЙ
ОКЗОР)
1.1. ФЕРМЕНТЫ, ОБЕСПЕЧИВАЮЩИЕ МЕТАБОЛИЗМ ПОЛИ(АОР-РИБОЗЫ)
В КЛЕТКАХ ЭУКАРИОТ
1.1.1.СЕМЕЙСТВО ПОЛИ(АОР-РИБОЗО)ПОЛИМЕРАЗ, ПРЕДСТАВЛЕННОЕ В
ВЫСШИХ ЭУКАРИОТАХ. СТРОЕНИЕ ПОЛИ(АОР-РИБОЗО)ПОЛИМЕРАЗЫ
1.1.2. СИНТЕЗ И ДЕГРАДАЦИЯ ПОЛИГАОР-РИБОЗЬП В КЛЕТКЕ
1.2. ФУНКЦИОНИРОВАНИЕ ПОЛИ(АИР-РИБОЗО)ПОЛИМЕРАЗЫ 1 ПРИ
РЕПАРАЦИИ ПОВРЕЖДЕНИЙ ДНК 17
1.2.1. ЭКСПЕРИМЕНТАЛЬНОЕ ИЗУЧЕНИЕ ФУНКЦИИ
ПОЛИ(АОР-РИБОЗО)ПОЛИМЕРАЗЫ 1 НА УРОВНЕ КЛЕТКИ И ОРГАНИЗМА
1.2.2. ВОВЛЕЧЕНИЕ ПОЛИ(АОР-РИБОЗО)ПОЛИМЕРАЗЫ 1 В ПРОЦЕСС
ЭКСЦИЗИОННОЙ РЕПАРАЦИИ ОСНОВАНИЙ ДНК ЭУКАРИОТ
1.2.2.1. ОСНОВНЫЕ ПУТИ ЭКСЦИЗИОННОЙ РЕПАРАЦИИ ОСНОВАНИЙ
ДНК В КЛЕТКАХ ЭУКАРИОТ
1.2.2.2. ВЛИЯНИЕ ПОЛИ(АОР-РИБОЗО)ПОЛИМЕРАЗЫ 1 НА РЕПАРАЦИЮ ДНК
СОДЕРЖАЩЕЙ РАЗЛИЧНЫЕ ТИПЫ ПОВРЕЖДЕНИЙ
1.2.3.3. ВЗАИМОДЕЙСТВИЕ ПОЛИ(АОР-РИБОЗО)ПОЛИМЕРАЗЫ 1 С
БЕЛКАМИ И ДНК-ИН ГЕРМЕДИАТАМИ В ПРОЦЕССЕ ЭКСЦИЗИОННОЙ
РЕПАРАЦИИ ОСНОВАНИЙ
1.2.3.4. ИЗМЕНЕНИЕ СТРУКТУРЫ ХРОМАТИНА В ПРОЦЕССЕ РЕПАРАЦИИ ДНК ЗА
СЧЕТ ПОЛИ(АОР-РИБОЗИЛ)ИРОВАНИЯ ГИСТОНОВ
1.2.3. РОЛЬ АКТИВАЦИИ ПОЛИ(АОР-РИБОЗО) ПОЛИМЕРАЗЫ 1 11РИ
МАССИРОВАННОМ ПОВРЕЖДЕНИИ ДНК, ПРИВОДЯЩЕМ К АПОПТОТИЧЕСКОЙ
ИЛИ НЕКРОТИЧЕСКОЙ ГИБЕЛИ КЛЕТКИ
1.2.4. МОДЕЛЬ ФУНКЦИО! 1ИРОВАНИЯ ПОЛИ(АОР-РИБОЗО)ПОЛИМЕРАЗЫ 1 В
КЛЕТОЧНЫХ ПРОЦЕССАХ, ИНДУЦИРУЕМЫХ
ГЕНОТОКСИЧЕСКИМ ВОЗДЕЙСТВИЕМ
ГЛАВА 2. ЭКСПЕРИМЕНТАЛЬНАЯ ЧАСТЬ
2.1. МАТЕРИАЛЫ
2.1.1. РЕАКТИВЫ, РАДИОАКТИВНЫЕ МАТЕРИАЛЫ, ПРЕПАРАТЫ НУКЛЕОТИДОВ
2.1.2. БАКТЕРИАЛЬНЫЕ ШТАММЫ И ПЛАЗМИДНЫЕ ДНК

2.1.3. ОЛИГОДЕЗОКСИРИБОНУКЛЕОТИДЫ
2.1.4. ФЕРМЕНТЫ
2.2. МЕТОДЫ ИССЛЕДОВАНИЯ
2.2.1. ВЫДЕЛЕНИЕ И ОЧИСТКА РЕКОМБИНАНТНОЙ ПОЛИ(АИР-РИБОЗО)ПОЛИМЕРАЗЫ 1 ЧЕЛОВЕКА, ЭКСПРЕССИРОВАННОЙ
В КЛЕТКАХ Е.СОЫ
2.2.1. ВВЕДЕНИЕ [32Р]-МЕТКИ В 5'-КОНЕЦ ОЛИГОНУКЛЕОТИДА
2.2.3. ФОРМИРОВАНИЕ ДНК-ДУПЛЕКСОВ
2.2.4. ГЕЛЬ-ЭЛЕКТОФОРЕЗ НУКЛЕИНОВЫХ КИСЛОТ И БЕЛКОВ
2.2.5. АНАЛИЗ ВЛИЯНИЯ ПОЛИ(АОР-РИБОЗО) ПОЛИМЕРАЗЫ 1,
АПУРИНОВОЙ/АПИРИМИДИНОВОЙ ЭНДОНУКЛЕАЗЫ 1 И ФЛОП-ЭНДОНУКЛЕАЗЫ 1 НА Д11К-СИ11ТЕЗИРУЮЩУЮ АКТИВНОСТЬ ДНК-ПОЛИМЕРАЗЫ р
2.2.6. АНАЛИЗ ЭНДОНУКЛЕАЗНОЙ И ЭКЗОНУКЛЕАЗНОЙ АКТИВНОСТИ
АПУРИНОВОЙ/АПИРИМИДИНОВОЙ ЭНДОНУКЛЕАЗЫ
2.2.7. АНАЛИЗ АКТИВНОСТИ ФЛЭП-ЭНДОНУКЛЕАЗЫ
2.2.8. АНАЛИЗ РЕПАРАЦИИ ДНК-ДУПЛЕКСОВ, КАТАЛИЗИРУЕМОЙ БЕЛКАМИ
ЯДЕР1ЮГО ЭКСТРАКТА ИЗ СЕМЕННИКОВ КРУПНОГО РОГАТОГО СКОТА
2.2.9. АНАЛИЗ ИНТЕРМЕДИАТА ДНК-ЛИГАЗА-[32Р]АМР В ЯДЕРНОМ ЭКС ТРАКТЕ
2.2.10. ФОТОАФФИННАЯ МОДИФИКАЦИЯ РЕКОМБИНАНТНЫХ БЕЛКОВ И БЕЛКОВ ЯДЕРНОГО ЭКСТРАКТА ИЗ СЕМЕННИКОВ КРУПНОГО РОГАТОГО СКОТА ФОТОРЕАКЦИОННОСПОСОБНЫМИ, ПРЕДСИНТЕЗИРОВАНПЫМИ
ДНК-СТРУКТУРАМИ
2.2.1 1. АНАЛИЗ ВЗАИМОДЕЙСТВИЯ ПОЛИ(АОР-РИБОЗО)ПОЛИМЕРАЗЫ 1 С
ДНК-СТРУКТУРАМИ, ИМИТИРУЮЩИМИ ИНТЕРМЕДИАТЫ РЕПАРАЦИИ ДНК
ГЛАВА 3. РЕЗУЛЬТАТЫ И ИХ ОБСУЖДЕНИЕ (УСТАНОВЛЕНИЕ РОЛИ ПОЛЩАИР-РИБОЗО)ПОЛИМЕРАЗЫ 1 В КООРДИНАЦИИ ПРОЦЕССА ЭКСЦИЗИОННОЙ РЕПАРАЦИИ ОСНОВАНИЙ ДНК)
3.1. ВЗАИМОДЕЙСТВИЕ 1ТОЛИ(АИР-РИБОЗО)ПОЛИМЕРАЗЫ
С ДНК-ИНТЕРМЕДИАТАМИ ЭКСЦИЗИОННОЙ РЕПАРАЦИИ ОСНОВАНИЙ, СОДЕРЖАЩИМИ ОДНОНУКЛЕОТИДНУЮ БРЕШЬ ИЛИ
ОДНОЦЕПОЧЕЧНЫЙ РАЗРЫВ
3.2. ВЛИЯНИЕ ПОЛИ(АШ>-РИБОЗО)ПОЛИМЕРАЗЫ 1 НА СИНТЕЗ ДНК, КАТАЛИЗИРУЕМЫЙ ДНК-ПОЛИМЕРАЗОЙ р
3.2.1. ВЛИЯНИЕ ПОЛИ(АОР-РИБОЗО)ПОЛИМЕРАЗЫ 1 НА СИНТЕЗ ДПК, КАТАЛИЗИРУЕМЫЙ ДНК-ПОЛИМЕРАЗОЙ р ПРИ ЗАСТРАИВАНИИ ОДЫОНУКЛЕОТИДНОЙ БРЕШИ

3.2.2. ВЛИЯНИЕ ПОЛИ(ЛОР-РИБОЗО)ПОЛИМЕРАЗЫ 1 НА СИНТЕЗ ДНК С ВЫТЕСНЕНИЕМ ЦЕПИ, КАТАЛИЗИРУЕМЫЙ ДНК-ПОЛИМЕРАЗОЙ В
3.2.3. ВЛИЯНИЕ ПОЛИ(АОР-РИБОЗО)ПОЛИМЕРАЗЫ 1 НА ВЗАИМОДЕЙСТВИЕ
Д11К-ПОЛИМЕРАЗЫ р С ФОТОРЕАКЦИОННОСПОСОБНЫМИ Д11К-ИНТЕРМЕДИТАМИ ЭКСЦИЗИОННОЙ РЕПАРАЦИИ ОСНОВАНИЙ, СОДЕРЖАЩИМИ ОДНОЦЕПОЧЕЧНЫЙ РАЗ Р Ы В
3.3. ФУНКЦИОНАЛЬНОЕ ВЗАИМОДЕЙСТВИЕ
ПОЛИ(АПР-РИБОЗО)ПОЛИМЕРАЗЫ 1 И АПУРИНОВОЙ/АНИРИМИДИНОВОЙ ЭНДОНУКЛЕАЗЫ 1 В ПРОЦЕССЕ СИНТЕЗА ДНК,
КАТАЛИЗИРУЕМОГО ДНК-ПОЛИМЕРАЗОЙ р
3.3.1. ВЛИЯНИЕ АПУРИНОВОЙ/АПИРИМИДИНОВОЙ ЭНДОНУКЛЕАЗЫ 1 СИНТЕЗ ДНК, КАТАЛИЗИРУЕМЫЙ ДНК-ПОЛИМЕРАЗОЙ [3, ПРИ НАЛИЧИИ НЕКАНОНИЧЕСКОЙ И КАНОНИЧЕСКОЙ ПАРЫ ОСНОВАНИЙ НА З'-КОНЦЕ ОДНОЦЕПОЧЕЧНОГО РАЗРЫВА
3.3.2. ВЛИЯНИЕ ПОЛИ(АОР-РИБОЗО)ПОЛИМЕРЛЗЫ 1 НА СИНТЕЗ ДНК, КАТАЛИЗИРУЕМЫЙ ДНК-ПОЛИМЕРАЗОЙ В, В ПРИСУТСТВИИ
АПУРИНОВОЙ/АПИРИМИДИНОВОЙ ЭНДОНУКЛЕАЗЫ
3.3.3. ВЗАИМОДЕЙСТВИЕ ДНК-ПОЛИМЕРАЗЫ Р С ИНТЕРМЕДИАТАМИ РЕПАРАЦИИ ДНК, СОДЕРЖАЩИМИ ОДНОЦЕПОЧЕЧПЫЙ РАЗРЫВ, В ПРИСУ ТСТВИИ АПУРИНОВОЙ/АПИРИМИДИНОВОЙ ЭНДОНУКЛЕАЗЫ 1 И
ПОЛИ(АОР-РИБОЗО)ПОЛИМЕРАЗЫ I
3.4. ФУНКЦИОНАЛЬНОЕ ВЗАИМОДЕЙСТВИЕ
ПОЛИ(АОР-РИБОЗО)ПОЛИМЕРАЗЫ 1,ЕЕ АПОПТОТИЧЕСКОГО 24 КДА-ФРАГМЕНТА И БЕЛКОВ ЯДЕРНОГО ЭКСТРАКТА ИЗ СЕМЕННИКОВ КРУПНОГО РОГАТОГО СКОТА В ПРОЦЕССЕ РЕПАРАЦИИ ДНК ПО ДЛИННОЗАПЛАТОЧНОМУ И КОРОТКОЗАПЛАТОЧНОМУ ПУТИ
3.4.1. ВЛИЯ11ИЕ ПОЛИ(АОР-РИБОЗО)ПОЛИМЕРАЗЫ 1 И ЕЕ 24 КДА-ФРАГМЕНТА 11А РЕПАРАЦИЮ ДПК-ДУПЛЕКСОВ ПО КОРОТКОЗАПЛАТОЧНОМУ И
ДЛИННОЗАПЛАТОЧНОМУ ПУТИ ЭКСЦИЗИОННОЙ РЕПАРАЦИИ ОСНОВАНИЙ
3.4.2. ВЛИЯНИЕ I ЮЛИ(АГ)Р-РИБОЗО)ПОЛИМЕРАЗЫ 1 И ЕЕ 24 КДА-ФРАГМЕНТА НА ВЗАИМОДЕЙСТВИЕ БЕЛКОВ ЯДЕРНОГО ЭКСТРАКТА С ДНК-ИНТЕРМЕДИАТАМИ ЭКСЦИЗИОННОЙ РЕПАРАЦИИ ОСНОВАНИЙ
3.4.3. ВЛИЯНИЕ 24 КДА-ФРАГМЕНТА НА РЕПАРАЦИЮ ДНК ПО
ДЛИ11НОЗАПЛАТОЧ1 ЮМУ ПУТИ
ЗАКЛЮЧЕНИЕ
ВЫВОДЫ
СПИСОК ЛИТЕРАТУРЫ

(MARCKS), которая обеспечивает нековалентное взаимодействие с поли(АОР-рибозой) (117). Например, такая последовательность присутствует в ДНК-связывагощем домене ядсрпого белка р53, который в ответ на повреждение ДНК блокирует клеточный цикл в фазе Gi или G2 или индуцирует апоптоз (13, 128). Исследования in vitro показали, что регуляция активности р53 может осуществляться через взаимодействие с поли(АЭР-рибозил)ированной формой PARP1 (128, 129, 130). Согласно этой модели, повреждение ДНК в клетке приводит к активации PARP1, которая через синтез поли(АОР-рибозы) модулирует сигнал для р53. В зависимости от уровня повреждения генома р53 может блокировать прохождение клетки из фазы Gi в фазу S или из фазы G2 в фазу М цикла до завершения репарации ДНК или запустить апоптоз (9, 130). Предполагается также, что регуляция функций р53 с помощью PARP1 может осуществляться за счет поли(АЕ)Р-рибозил)ирования р53, что было продемонстрировано in vitro, однако in vivo данный факт пока не был подтвержден (131, 132). Однако при массированном повреждении ДНК "гиперактивация" PARP1 приводит к резкому снижению концентрации NAD+ в клетке, что ведет к падению уровня АТР и вызывает некротическую гибель клетки (9, 22, 82). Показано, что форма клеточной гибели — по пути апоптоза или некроза - во многом определяется внутриклеточной концентрацией NAD+ и АТР, и снижение уровня NAD1 и АТР ведет к индукции некроза (133, 134). Некротическая гибель клетки сопровождается воспалительным процессом в тканях и органах, в то время как апоптоз не вызывает патофизиологических реакций в многоклеточном организме (135). При апоптозс, индуцированном повреждением ДНК, активируются клеточные каспазы, которые в первую очередь осуществляют расщепление ряда белков, обуславливающих потребление внутриклеточной энергии в ходе репарации ДНК (82). По имеющимся данным, PARP1 является мишенью действия каспазы-7 и каспазы-3 (136, 137, 138). Для реализации апоптотической программы клеточной гибели в условиях массированного повреждения ДНК протеолиз PARP1 позволяет предотвратить ее "сверхактивацию" и истощение энергетического ресурса клетки, обусловленное снижением уровня NAD* в клетке (22, 82). В результате протеолиза PARP1 образуется два фрагмента 89 кДа и 24 кДа (136); 89 кДа-фрагмент содержит два домена: каталитический и самомодификации, а 24 кДа-фрагмен г - ДНК-связываюший мотив "цинковые пальцы", через который непосредственно осуществляется взаимодействие с разрывами в ДНК (26, 137). Следует также отметить, что формирующиеся фрагменты 89 кДа и 24 кДа могут дополнительно способствовать подавлению функциональной активности PARP1, так, например, 89 кДа-фрагменг препятствует гомодимеризации интактной PARP1 на сайте повреждения, а 24 кДа-

Рекомендуемые диссертации данного раздела

Время генерации: 0.107, запросов: 967