Анализ метилирования ДНК при раке шейки матки

• Автор: Петренко, Анатолий Анатольевич
• Шифр специальности: 14.00.14
• Научная степень: Кандидатская
• Год защиты: 2003
• Место защиты: Москва
• Количество страниц: 110 с. : ил.

ОГЛАВЛЕНИЕ стр. СПИСОК СОКРАЩЕНИЙ. МЕТИЛИРОВАНИЕ ДНК. Распространение метилирования ДНК. Функция метилирования ДНК. Метилирование во время развития. Роль метилирования в канцерогенезе. ДНК. Заключение. МАТЕРИАЛЫ И МЕТОДЫ. Список использованных реактивов. Клинические материалы. Выделение ДНК и РНК из клеточных культур. Рестрикция геномной ДИК. Полимеразная цепная реакция. Мет ил чувствител ьная IIЦР со статистическими ССбогатыми праймерами. Метилспецифическая ПЦР. Выделение продуктов ПЦР из гелей. Выделение продуктов ПЦР из агарозного геля. Клонирование продуктов IЩР. Вектор. Получение компетентных клеток ii i. Выделение плазмидной ДНК. Электрофоретическое разделение ДНК в агарозном геле. Электрофоретическое разделение РНК в агарозном геле. Блотгибридизация. Обратная транскрипция. Переосаждение ДНК РНК. Анализ нуклеотидных последовательностей. Поиск гомологий в банках данных. Поиск островков, гиперметилированных в опухолях шейки матки
всех динуклеотпдов метилировано, и эти метилированные динуклеотиды рассредоточены по геному в виде одиночных сайтов i .


Поиск гомологий в банках данных. Поиск островков, гиперметилированных в опухолях шейки матки
всех динуклеотпдов метилировано, и эти метилированные динуклеотиды рассредоточены по геному в виде одиночных сайтов i . В то же время в геноме позвоночных существуют скопления немстилированных нуклеотидов, именуемых островками у человека от всего числа динуклеотидов. Эти последовательности обладают длиной от 0. На основании компьютерного анализа в геноме человека предсказано существование тыс. Ср эстровков . V . Считается, что 6 человеческих генов содержат СрОосгровки i . Они имеются, повидимому, у всех генов, выполняющих базовые клс. Большинство из островков остаются неметилированными на вс стадиях развития организма и во всех типах тканей, даже когда ассоциированный с ними ген не функционирует. Например, тканеспецифичс. I. имеют островки, которые остаются неметилированными во x протестированных тканях, независимо от статуса экспрессии гена. Гак. X
хромосомы см. Считается, что метил приводит к перестройке X инактивацию транскрипц i . Показано, что важную роль в этом связывающих белков, привлекая к ПК гистоновые деацетилазы, которые, в свою с группы у гистонов в составе нуклеосом. Такая белков приводит к превращению открытой, структуры хроматина в закрытую, о рис. Рисунок 1. II перестройке хроматина в недо . ДИК на структуру хроматина. При ОМПТШ имеет открытую конфигурацию, которая а ктивностыо, Мети л и рован ые цитозин ы ми белками МВЗб, которые привлекают в район метилированной ДНК.