Моделирование структуры и энергии биополимеров : Развитие и применение вычислительных методов

Моделирование структуры и энергии биополимеров : Развитие и применение вычислительных методов

Автор: Воробьев, Юрий Николаевич

Шифр специальности: 05.13.16

Научная степень: Докторская

Год защиты: 2000

Место защиты: Новосибирск

Количество страниц: 245 с. ил.

Артикул: 302279

Автор: Воробьев, Юрий Николаевич

Стоимость: 250 руб.

Моделирование структуры и энергии биополимеров : Развитие и применение вычислительных методов  Моделирование структуры и энергии биополимеров : Развитие и применение вычислительных методов 

Проблемы математического моделирования макромолекул. Цель диссертации. Математические проблемы статистическомеханического моделирования структуры макромолекул. Положения, выносимые на защиту. Введение. Механическая модель молекулы. Структурные единицы. Иерархический характер структур нуклеиновых кислот. Энергия макромолекулы в растворе. Потенциальная энергия макромолекулы. Модели неявного растворителя. Макроскопическая модель диэлектрической среды. Методы решения уравнения Пуассона. Методы сканирования фазового пространства и оптимизации структуры макромолекулы. Заключение. Точное статистическое моделирование свободной энергии в растворе. Иерархия приближенных методов расчта энергии сольватации . Силовое поле с малым числом эмпирических параметров и высокой степенью трансферабельности. Рис. А и В формах. Участки полипептидной цепи могут принимать регулярные низкоэнергетические конформации, альфаспирали и бетацепи ,, составляющие элементы вторичной структуры, стабилизированные взаимодействиями атомов, принадлежащих одной или соседним, вдоль цепи, полимерным единицам, Рис.


Участки полипептидной цепи могут принимать регулярные низкоэнергетические конформации, альфаспирали и бетацепи ,, составляющие элементы вторичной структуры, стабилизированные взаимодействиями атомов, принадлежащих одной или соседним, вдоль цепи, полимерным единицам, Рис. Альфа спирали сильно стабилизированы водородными связями между СО и ЧН4 группами полипептидной цепи одна альфаспираль может включать до пептидных единиц и статистически, всех пептидных единиц находятся в состоянии альфаспирали 3 альфаспирали оказывают сильнейшее воздействие на пространственную организацию молекул белков ,. Бета цепи статистически включают остатков в молекулах белков. Параллельные или антипараллельные бета цени из 5 пептидных групп соединены водородными связями между СО и ТЧН группами остатков из соседних цепей в беталисты, Рис. Анализ экспериментальной базы из нескольких тысяч трехмерных структур молекул белков показывает, что элементы вторичной структуры, из элементов, ассоциированы в супервторичные структуры ,, аа упаковки альфаспиралей ,, стопки из беталистов еф и комбинации сф из взаимодействующих аспиралей и 5листов ,, Рис. Участки полипептидной цепи из 0 мономеров организованы в топологически разные структур, из вторичных и супервторичных структур и составляют компактные глобулярные трехмерные структуры структурные домены , белков. Организация доменов упрощает процесс самоорганизации большой белковой молекулы, который разделяется на серию более простых процессов самоорганизации участков цепи в домены понижая энтропийный барьер сближения удаленных по цени остатков и подстройку доменов друг к другу .

Рекомендуемые диссертации данного раздела

28.06.2016

+ 100 бесплатных диссертаций

Дорогие друзья, в раздел "Бесплатные диссертации" добавлено 100 новых диссертаций. Желаем новых научных ...

15.02.2015

Добавлено 41611 диссертаций РГБ

В каталог сайта http://new-disser.ru добавлено новые диссертации РГБ 2013-2014 года. Желаем новых научных ...


Все новости

Время генерации: 0.348, запросов: 244