Функциональная вариабельность генов подверженности инфекционным заболеваниям

Функциональная вариабельность генов подверженности инфекционным заболеваниям

Автор: Ожегова, Диана Сергеевна

Шифр специальности: 03.00.15

Научная степень: Кандидатская

Год защиты: 2009

Место защиты: Томск

Количество страниц: 165 с. 20 ил.

Артикул: 4310221

Автор: Ожегова, Диана Сергеевна

Стоимость: 250 руб.

ОГЛАВЛЕНИЕ
СПИСОК СОКРАЩЕНИЙ
ВВЕДЕНИЕ.
ГЛАВА 1. ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ.
1.1. Функциональная геномика инфекционных
заболеваний
1.2. Биоинформатика, как инструмент формирования выборки генов из генома человека для изучения патологии.
1.3. Генетическая подверженность туберкулезу и сальмонеллезу.
ГЛАВА 2. МАТЕРИАЛЫ И МЕТОДЫ ИССЛЕДОВАНИЯ
2.1. Характеристика выборки здоровых доноров
2.2. Биоинформационные подходы для поиска и оценки фенотипической значимости выбранных
2.2.1. Поиск функционально значимых с помощью i программ и баз данных.
2.2.2. Выбор потенциально функционально значимых с помощью программы .
2.3. Молекулярногенетические методы исследования.
2.3.1. Выделение ДНК из мононуклеаров венозной крови
2.3.2. Определение полиморфизма генов I, I2, МСР1,
1, 2
2.3.3.Условия культивирования мононуклеарных клеток венозной крови.
2.3.4. Выделение РНК из мононуклеаров венозной крови и получение кДНК с помощью реакции обратной транскрипции
2.3.5. Условия постановки
2.4. Статистические методы
ГЛАВА 3. РЕЗУЛЬТАТЫ И ОБСУЖДЕНИЕ.
3.1. Поиск функционально значимых с помощью
биоинформационных ресурсов
3.2. Оценка уровня экспрессии генов МС.Р1, I, 2, , I2 при стимуляции , , , I, I4 и их комбинациями.
3.3. Сравнение уровней генетической экспрессии в культурах клеток носителей различных генотипов по выбранным полиморфным вариантам генов МСР1, I, 2, 1, I2.
ЗАКЛЮЧЕНИЕ
ВЫВОДЫ
СПИСОК ЛИТЕРАТУРЫ


i работали с чипом iix , который содержал олигонуклеотидные пробы примерно генов человека. Обе группы выделили только те гены, изменение уровня экспрессии которых превышало 2х кратный порог для i Ii, и более чем 3х кратный порог для i i, . Этот список содержал гены, кодирующие МСР1, I, кВ и цитохром Р0. Изучение профилей экспрессии ряда генов с помощью микрочипосых технологий позволяет выявить некоторые особенности функционирования отдельных генов тканей или субпопуляций клеток человеческого организма в нормальных и патологических условиях, а также роль, которую они играют в противоинфекционном иммунитете. Р1апример, М. i с соавторами обнаружили более 0 дифференциально экспрессирующихся генов при стимуляции 4 и 8 1клеток здоровых доноров живыми М. Эти дифференциально экспрессирующиеся гены включали как хорошо известные гены с определенными раннее биологическими функциями, так и не известные, предсказанные i ii, гены. Большая часть генов, отличающихся НО уровню экспрессии между субпопуляциями 4 И 8 Тклеток, относилась к генам иммунного ответа 9, генам сигнальных фан еду кторов клетки и факторов транскрипции по , генам синтеза белка . Некоторые, эти дифференциально экспрессирующиеся гены, могут быть использованы как маркеры при активации 4 и 8 Тклеток i . Для изучения возможных аспектов функционирования Тклеток, вместо самих инфектогенов, можно использовать факторы их жизнедеятельности и клеточные структуры. Посредством воздействия ряда специфических индукторов или их синтетических аналогов на клетки человека и анализа изменений профилей экспрессии генов можно моделировать реакции, сходные с теми которые наблюдаются при ответе организма на инфекцию. Например, Т. с соавторами обнаружили, что ответ Тклеток, инфицированных стафилококковым энтеротоксином В, подобен ответу Тклеток на живые М. В качестве другого примера можно привести, модель острой вирусной инфекции, которую получают путем стимуляции человеческих мононуклеарных клеток крови полицитидиловой кислотой , . Известно, что специфические субпопуляции мононуклеарных клеток крови имеют патогномоничную генную экспрессию. Эту информацию можно использовать для диагностики инфекционных заболеваний. Например, посредством микрочиповых технологий были изучены изменения генной экспрессии, индуцированные цитомегаловирусом V в фибробластах , и инфекцией IIV1 в Тлимфоцитах , , и обнаружены огромные различия в профилях генной экспрессии. Инфицирование фибробластов V приводило к индукции интерферон опосредованного ответа, тогда как инфицирование Тлимфоцитов V1 активировало ряд генов, использующих в роли ядерного трансдуктора кВ. Кроме того, показано, что, основываясь на специфических характеристиках экспрессионного ответа, можно не только распознавать действующий инфекционный агент, но и идентифицировать категорию класс этого агента , . Это особенно важно для тех случаев заболевания, когда культивирование клеток, зараженных патогенами, затруднено. Ответ организма на инфекционные антигены в виде изменения уровня экспрессии генов иммунного ответа, можно наблюдать в первые часы после заражения. В этом случае профилирование генной экспрессии может быть использовано для стратификации пациентов в соответствующие патофизиологические группы. Лечение в каждой группе, соответственно, будет определяться степенью прогрессирования клинических симптомов заболевания. Паттерны экспрессии каждого гена тесно связаны с биологической ролью его продукта. Систематические исследования вариаций в генной экспрессии, которые могут быть обусловлены наличием однонуклеотидных полиморфных замен в гене, могут обеспечить подход для выявления езязи между специфическими генами и заболеванием. Например, аллельные различия в регуляторных регионах генов цитокинов могут существенно влиять на их экспрессию в течение иммунного ответа i, .

Рекомендуемые диссертации данного раздела

28.06.2016

+ 100 бесплатных диссертаций

Дорогие друзья, в раздел "Бесплатные диссертации" добавлено 100 новых диссертаций. Желаем новых научных ...

15.02.2015

Добавлено 41611 диссертаций РГБ

В каталог сайта http://new-disser.ru добавлено новые диссертации РГБ 2013-2014 года. Желаем новых научных ...


Все новости

Время генерации: 0.190, запросов: 145