In silico скрининг последовательностей нуклеотидов генома человека, специфически экспрессирующихся в опухолях

In silico скрининг последовательностей нуклеотидов генома человека, специфически экспрессирующихся в опухолях

Автор: Лобашев, Андрей Владимирович

Шифр специальности: 03.00.15

Научная степень: Кандидатская

Год защиты: 2002

Место защиты: Москва

Количество страниц: 91 с. ил

Артикул: 2315316

Автор: Лобашев, Андрей Владимирович

Стоимость: 250 руб.

In silico скрининг последовательностей нуклеотидов генома человека, специфически экспрессирующихся в опухолях  In silico скрининг последовательностей нуклеотидов генома человека, специфически экспрессирующихся в опухолях 



В этой БД содержится информация о последовательностях нуклеотидов клонированных молекул кДНК, синтезированных на основе тотальной мРНК, выделяемой из клеток различных тканей и клеточных культур человека. Отсеквенированные фрагменты клонов кДНК называются x . Все в БД объединены в кластеры по принципу взаимной гомологии. Предположительно каждый кластер представляет собой образ гена, а точнее его мРНК. Этот образ мозаичен. Он составлен из , представляющих разные ткани, в частности опухолевые и нормальные. Проверка первоисточников информации о принадлежности кДНК библиотеки к опухолевой или нормальной ткани человека. Разработка адекватных компьютерных методов и программных средств для проведения компьютерного дифференциального дисплея КДД, так как доступные программы имели ряд существенных ограничений. Группировка , входящих в состав каждого кластера по заданным признакам. Научная новизна. Создана программа , позволившая провести анализ электронных баз данных о последовательностях нуклеотидов кДНК человека и растения ii i с ранее не применявшейся постановкой задачи выявлением кластеров с преобладающим по заданным параметрам относительным числом . Практическая значимость. В данной работе найден ряд генов человека, повышенная экспрессия которых, как предполагается, маркирует процесс образования иили прогрессии опухоли. Продукты экспрессии генов, найденных в результате КДД мРНК а в некоторых случаях и белок, могут служить маркерами опухолевого роста, что имеет большое значение для исследований опухолевых процессов а, возможно и для их диагностики в клинике. Найден ряд генов АгаЫЗорз, повышенная экспрессия которых, возможно, маркирует процесс ответа генома на стрессовые условия засоленность. Данные гены могут являться мишенями для селекции на устойчивость к стрессам, в том числе у хозяйственно ценных растений. Работа проводилась в рамках плановой тематики ЙОГен РАН и поддерживалась грантами российских программ Гэном человека и Интеграция. С генетической точки зрения в основе всех раковых заболеваний лежат изменения последовательности нуклеотидов в геноме соматических клеток. В течение всей жизни клетки подвергаются действию мутагенов, происходят случайные ошибки репликации и т. ДНК. И вот однажды очередная мутация приводит к нарушению функции какоголибо гена, играющего критическую роль в регуляции клеточного цикла, клетка дает начало новой популяции. В настоящее время рак является одним из самых распространенных типов заболеваний у человека. В развитых странах в среднем у каждого третьего из взрослых людей развивается опухоль и один из пяти умирает от рака. Практической целью изучения молекулярногенетических процессов, связанных с раковыми опухолями является спользование полученных данных в клинической практике для лечения раковых заболеваний. В каждом случае возникновения опухоли важно знать ее, разновидность и специфику. Классификация раковых образований исторически базировалась в основном на морфологических и гистологических особенностях опухоли. Однако этот подход имеет принципиальные ограничения. Опыт показывает, что опухоли, имеющие даже сходные гистопатологические черты, могут требовать разного подхода к клиническому лечению и поразному реагируют на терапию. В некоторых случаях такая клиническая гетерогенность объясняется при разделении морфологически близких опухолей на подтипы. Примером служат острые лейкемии, лимфомы неХоджкинского типа или ряд детских опухолей с неоднородной реакцией на химиотерапию 2, которые в настоящее время на основе молекулярных данных разделены на такие классы как нейробластома, рабдомиосаркома, саркома Юинга i и другие. Авторы работы продемонстрировали возможность классификации ряда опухолей по спектру генной экспрессии. Отталкиваясь от данных, полученных из образцов тканей острой лимфобластоидной лейкемии и острой миелоидной лейкемии, они разработали аналитический метод определения, к какому типу опухоли принадлежит тот или иной исследуемый образец. Суть метода заключается в следующем. Предполагается, что, в идеализированной ситуации, для каждого из двух типов опухоли существуют ген 0 с высоким уровнем экспрессии, который не экспрессируется в другом типе.

Рекомендуемые диссертации данного раздела

28.06.2016

+ 100 бесплатных диссертаций

Дорогие друзья, в раздел "Бесплатные диссертации" добавлено 100 новых диссертаций. Желаем новых научных ...

15.02.2015

Добавлено 41611 диссертаций РГБ

В каталог сайта http://new-disser.ru добавлено новые диссертации РГБ 2013-2014 года. Желаем новых научных ...


Все новости

Время генерации: 0.264, запросов: 145