Молекулярно-цитогенетический анализ эволюции хромосом полевок группы arvalis рода Microtus (Arvicolinae, Rodentia)

Молекулярно-цитогенетический анализ эволюции хромосом полевок группы arvalis рода Microtus (Arvicolinae, Rodentia)

Автор: Рубцова, Надежда Владимировна

Шифр специальности: 03.00.15

Научная степень: Кандидатская

Год защиты: 2003

Место защиты: Новосибирск

Количество страниц: 146 с. ил

Артикул: 2611574

Автор: Рубцова, Надежда Владимировна

Стоимость: 250 руб.

ОГЛАВЛЕНИЕ.
СПИСОК СОКРАЩЕНИЙ.
ВВЕДЕНИЕ
Глава 1. ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ
1.1. Некоторые аспекты организации и эволюции генома млекопитающих
1.2. Гетерохроматиновые районы в хромосомах млекопитающих
1.2.1. Конститутивный гетерохроматин
1.2.2. Центромерные районы
1.2.3. Теломерные районы
1.2.4. Ядрышкообразующие районы.
1.3. Повторяющиеся последовательности ДНК и хромосомные перестройки
1.3.1. Мобильные элементы.
1.3.2. Интерстициальные теломерные повторы
1.3.3. Сегментные дупликации
1.4. Эволюционная консервативность Ххромосомы млекопитающих.
1.5. Микродисекционные ДНКпробы в хромосомном пэйнтинге.
1.6. Группа обыкновенных полевок рода i отряд Кобепйа
1.6.1. Систематическое положение и филогенетические отношения
внутри группы.
1.6.2. Кариологические характеристики обыкновенных полевок
Глава 2. МАТЕРИАЛЫ И МЕТОДЫ
2.1. Животные
2.2. Получение культур первичных фибробластов легких.
2.3. Фиксация клеток.
2.4. Приготовление препаратов метафазных хромосом
2.5. Дифференциальное окрашивание метафазных хромосом
2.5.1. СТОдифференциальное окрашивание хромосом
2.5.2. кшивни.
2.5.3. Последовательное окрашивание хромосом разными методами.
2.5.4. Сдифференциальное окрашивание.
2.5.5. СТвокрашивание хромосом для микродиссекции
2.6. Получение микродиссскционных ДНКпроб
2.7. Введение метки в ДНК микродиссскционных ДНКпроб.
2.8. ДИКпроба для детекции рДИК
2.9. Флуоресцентная i i гибридизация
2.9.1. Супрессионная i i гибридизация.
2 Детекция на цитологических препаратах меченых ДНКпроб
. Детекция ДНКпроб, меченных биотин дУТФ.
. Детекция ДНКпроб, меченых дигоксигениндУТФ.
. Совместное выявление двух гаптенмеченых ДНКпроб.
2 Микроскопический анализ препаратов метафазных хромосом
Глава 3. РЕЗУЛЬТАТЫ.
3.1. Локализация ядрышкообразующих районов в хромосомах
обыкновенных полевок
3.1.1. Локализация ЯОрайонов с применением окрашивания хромосом.
3.1.2. Локализация генов рибосомных РНКс применением I.
3.1.3. Сравнение хромосомной локализации ЯОрайонов у разных видов
3.2. Анализ реорганизации гомологов хромосом 5 и 8 М. vi при формировании дополнительных блоков гетерохроматина и
в процессе эволюции видов.
3.2.1. Характеристика дополнительных блоков гетерохроматина перестроенных гомологов хромосом 5 и 8 М. vi
3.2.2. Районоспецифические ДНКпробы хромосом .vi
3.2.3. I гибридизация ДНКпроб гетерохроматиновых блоков 5КС и 8КС
3.2.4. Сравнение организации эухроматиновых районов хромосом 8, 8К .vi и их гомеологов
3.2.5. Сравнение организации эухроматиновых районов хромосом
5 и 5.vi .
3.2.6. Сравнение организации эухроматиновых районов хромосомы
.vi и ее гомеологов.
3.3. Распределение в хромосомах полевок подрода i кластеров повторяющихся последовательностей ДНК, выявленных
в разных вариантах 1.
3.3.1. I гибридизация ДНКпроб гетерохроматинового блока 5КС
с метафазными хромосомами полевок
3.3.2. Iгибридизация ДНКпробы гетерохроматинового блока 8КС
с метафазными хромосомами полевок
3.3.3. Iгибридизация ДНКпробы рплеча хромосомы
с метафазными хромосомами полевок.
3.3.4. Одновременная I ДНКпроб разных гетерохроматиновых блоков
с метафазными хромосомами полевок.
3.3.5. Межвидовые различия обыкновенных полевок по характеру
распределения кластеров повторяющихся последовательностей,
гомологичных ДНК гетерохроматиновых блоков .vi
3.4. Анализ организации эухроматиновых районов Ххромосом
обыкновенных полевок.
3.4.1. Установление гомологии эухроматиновых районов в Ххромосомах полевок.
3.4.2. Анализ возможных перестроек эухроматиновых районов Ххромосом
в эволюции обыкновенных полевок.
3.4.3. Анализ локализации точек разрывоввоссоединений предполагаемых инверсий в ходе реорганизации Ххромосом полевок.
Глава 4. ОБСУЖДЕНИЕ.
4.1. Кластеры гомологичных повторяющихся последовательностей
ДК в хромосомах обыкновенных полевок.
4.2. Повторяющиеся последовательности ДНК и дивергенция
видов обыкновенных полевок.
4.3. ЯОрайоны и кластеры повторяющихся последовательностей
ДНК в хромосомах обыкновенных полевок.
4.4. Эволюция ЯОрайонов обыкновенных полевок
4.5. Транспозиции центромер в хромосомах полевок.
4.5. Эволюция Ххромосом обыкновенных полевок
ЗАКЛЮЧЕНИЕ.
ВЫВОДЫ.
СПИСОК ЛИТЕРАТУРЫ


ДНК, принимавшим участие в формировании новых Сгетерохроматиновых блоков в аутосомах 5 и 8. Провести анализ распределения в хромосомах обыкновенных полевок кластеров повторяющихся последовательностей, гомологичных последовательностям ДНК новых Сгетерохроматиновых блоков двух аутосом М. Сравнить порядок расположения эухроматиновых сегментов рплеча и околоцентромерного района плеча в стандартной хромосоме 5 М. Сгстсрохроматина. Сравнить порядок расположения эухроматионовых сегментов рплеча и околоцснтромерного района плч в хромосоме 5 М. Ш оЬбсыгш с порядком сегментов в гомеологичных районах хромосом других видов обыкновенных полевок. Определить расположение гомологичных эухроматиновых районов в Ххромосомах пяти близкородственных видов рода Мкго1ш, и провести анализ возможных перестроек в эволюции Ххромосом полевок. Научная новизна. Впервые для сравнительного анализа хромосом полевок был применен пэйнтинг с использованием районоспецифических ДНКпроб, и не только эухроматиновых, но и гетерохроматиновых районов хромосом полевок. Впервые было показано, что формирование новых гетерохроматиновых Сблоков в аутосомах полевок может происходить за счет амплификации последовательностей ДНК, представленных в виде кластеров в прителомерных, прицентромерных и ядрышкообразующих районах многих хромосом кариотипа. Впервые однозначно показано, что транспозиция центромерного района при формировании акроцентричсского гомолога хромосомы 5 М. Ш оЬэсигш не сопровождалась изменением позиции теломерного, центромерного и эухроматиновых сегментов рплеча исходной субметацентрической хромосомы. Впервые в хромосомах четырех видов обыкновенных полевок показана связь межвидовых различий в субхромосомной локализации ЯОР с наличием разных наборов кластеров повторяющихся последовательностей ДНК. Впервые сравнительный анализ Ххромосом близкородственных видов был проведен с использованием набора районоспецифических ДНКпроб, перекрывающих все эухроматиновые районы Ххромосомы. При анализе перестроек в Ххромосомах пяти видов серых полевок была обнаружена солокализация горячих точек эволюционных перестроек с расположением интеркалярных кластеров повторяющихся последовательностей. Практическая ценность. Ххромосомах млекопитающих. Полученные в работе результаты расширяют наши представления о возможных механизмах эволюционных перестроек в хромосомах млекопитающих и позволяют поновому взглянуть на роль повторяющихся последовательностей ДНК в возникновении однотипных перестроек хромосом, в том числе в эволюции ядрышкообразующих районов. Апробация. I iii vi i i i i i I ivii vii, i, . Кроме того, результаты были представлены на отчетной сессии Института цитологии и генетики СО РАН в феврале . Публикации. По теме диссертации опубликовано печатных работ в отечественных и зарубежных изданиях. Работы были поддержаны 1рантами РФФИ, ПНГ и I. Вклад автора. Автором были выполнены в основном или в полном объеме следующие виды работ получение и культивирование используемых в работе первичных линий фибробластов полевок фиксация клеток и приготовление препаратов метафазных хромосом для всех вариантов цитогенетического анализа и для микродиссекции дифференциальное окрашивание хромосом разными методами и в различных комбинациях и анализ полученных при этом результатов анализ результатов всех вариантов I обработка и анализ полученных данных. Мечение и I клонированного фрагмента ДНК, содержащего последовательности рДНК человека, провели к. Воробьева Н. В. и с. Сердюкова лаборатория цитогенетики человека и животных Института цитологии и генетики СО РАН. Получение микродиссекционных ДНКпроб и I с их использованием выполнили д. Рубцов Н. Б.и к. Карамышева Т. В. лаборатория морфологии и функции клеточных структур Института цитологии и генетики СО РАН. Структура и объм диссертации. Диссертация включает следующие разделы введение, обзор литературы, материалы и методы, результаты, обсуждение, заключение, выводы и список цитируемой литературы 7 ссылок изложена на 6 страницах машинописного текста, иллюстрирована рисунками и содержит 4 таблицы.

Рекомендуемые диссертации данного раздела

28.06.2016

+ 100 бесплатных диссертаций

Дорогие друзья, в раздел "Бесплатные диссертации" добавлено 100 новых диссертаций. Желаем новых научных ...

15.02.2015

Добавлено 41611 диссертаций РГБ

В каталог сайта http://new-disser.ru добавлено новые диссертации РГБ 2013-2014 года. Желаем новых научных ...


Все новости

Время генерации: 0.206, запросов: 145