Картирование хромосом свиньи (Sus scrofa Dom. L. ) на основе межвидовых гибридов соматических клеток

Картирование хромосом свиньи (Sus scrofa Dom. L. ) на основе межвидовых гибридов соматических клеток

Автор: Жданова, Наталья Сергеевна

Шифр специальности: 03.00.15

Научная степень: Докторская

Год защиты: 2002

Место защиты: Новосибирск

Количество страниц: 245 с. ил

Артикул: 2336788

Автор: Жданова, Наталья Сергеевна

Стоимость: 250 руб.

ОГЛАВЛЕНИЕ
ОГЛАВЛЕНИЕ
СПИСОК СОКРАЩЕНИЙ
ВВЕДЕНИЕ
ГЛАВА 1. ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ
1.1. Геномные карты и способы картирования хромосом
1.1.1. Генетические карты
1.1.2. Физические карты генома
1.1.2.1. Цитогенетические карты
1.1.2.2. Радиационные карты
1.1.2.3. Карты контиг
1.1.3. Сравнительные карты геномов
1.2. Генетические маркеры
1.2.1. Типы генетических маркеров
1.2.1.1. Маркеры первого типа
1.2.1.1.1. Биохимические маркеры
1.2.1.1.2. Рестрикционный полиморфизм
1.2.1.1.3. ПЦР маркеры
1.2.1.1.3.1. праймеры
1.2.1.1.3.2. праймеры
1.2.1.1.3.3.
1.2.1.1.3.4.
1.2.1.2. Маркеры второго типа
1.2.1.3. Маркеры третьего типа
1.2.1.4. маркеры
1.3. Картирование маркеров с помошыо гибридов соматических
клеток
1.3.1. Гибриды соматических клеток
1.3.1.1. Спонтанное и индуцированное слияние клеток
1.3.1.2. Хромосомный состав гибридов соматических клеток
1.3.1.3. Способы идентификации интактных и перестроенных хромосом
в клеточных гибридах
I.3.2. Принципы картирования маркеров с помощью гибридов
соматических клеток
1.3.3. Картирование с помощью радиационных межвидовых
клеточных гибридов
1.3.3 1. Принципы радиационного картирования
1.3 Радиационное картирование отдельных хромосом
1.3.3.3. Радиационное картирование всего генома
1.3.3.4. Радиационное картирование генома человека
1.3.3.5. Современные методы обработки данных радиационного
картирования
1.3.3.6. Проблемы радиационного картирования
1.4. Сравнительный структуры геномов млекопитающих
1.4.1. I.
1.4.2. Сравнительный анализ карт геномов млекопитающих
1.4.2.1 Сравнительный анализ цитогенетических и генетических карт
1.4.2.1 Сравнительный анализ радиационных карт.
1.4.3. Попытки реконструкции предковых кариотипов
1.4.4. Сравнительное позиционное клонирование
1.5. Картирование генома свиньи
1.5.1. Генетическая карта свиньи
1.5.2. Локализация в геноме свиньи
1.5.3. Физическое картирование генома свиньи
1.5.3.1. Цитогенетическая карта
1.5.3.2. Радиационное картирование генома свиньи
1.5.4. Сравнительная карта генома свиньи
ГЛАВА 2. МАТЕРИАЛЫ И МЕТОДЫ
2.1. Методы работы с культурами клеток
2.1.1 Список использованных линий
2.1.2. Получение первичных культур клеток
2.1.2.1. Кратковременная культура лейкоцитов периферической крови
свиньи
2.1.2.2. Получение первичных культур фибробластов животных
Манипуляции с перевиваемыми культурами клеток
Получение гибридов соматических клеток
Сбор образцов клеток для Саузерн блот гибридизации, ПЦР
анализа и электрофоретического анализа белков
Методы работы с ДНК
Выделение ДНК
Выделение суммарной ДНК
Получение 1 ДНК
Выделение плазмидной ДНК
Обработка ДНК эндонуклеазами
Электрофорез ДНК в агарозном геле
Блот гибридизации по Саузсрну
Мечение плазмидной ДНК методом статистической затравки Процедура блот гибридизации по Саузерну ПЦР анализ
Гетеродуплексный анализ Методы цитогенетического анализа Получение препаратов метафазных хромосом дифференциальное окрашивание хромосом Подготовка препаратов для микродиссекции I i гибридизация Мечение проб
Мечение проб биотином биодУТФ или дигоксигенином дигдУТФ методом никтрансляции Мечение проб биотином с помощью iI ПЦР Изотопное мечение проб методом статистической затравки Нерадиоактивная гибридизация i i Подготовка пробы Подготовка препаратов Процедура т i гибридизации Отмывка препаратов после гибридизации
2.3.4.2.5. Детекция сигнала на препаратах
2.3.4.2.5.1. Детекция сигнала с помощью флуоресцентных красителей
2.3.4.2.5.2. Детекция сигнала с помощью псроксидазы и красителей ЫВТ ВС1Р
2.3.4.2.6. Анализ изображения
2.3.4.3. Изотопная гибридизация тНи
2.4. Электрофоретический анализ белков
2.5. Статистический анализ данных радиационного
картирования
ГЛАВА 3. РЕЗУЛЬТАТЫ И ОБСУЖДЕНИЕ
3.1. Получение и характеристика клеточной линии американской
норки МУТК, устойчивой к 5БДУ
3.1.1. Селекция устойчивого клона
3.1.2. Кариотип линии МУТК
3.1.3. Получение межвидовых гибридов с клетками МУТК. Генный
состав района 2рюгр, транспонированного в МУТК на хромосому 7
3.2. Гибриды соматических клеток свинья американская норка
3.2.1. Получение гибридных клонов и общая характеристика
3.2.2. Идентификация перестроенных хромосом свиньи в гибридном
клоне БУЗб с помощью микродиссекциионных библиотек
3.2.3. Получение и характеристика монохромосомных гибридных
клеточных линий свиньи
3.3. Картирование генов свиньи с помощью межвидовых
гибридов соматических клеток
3.3.1. Картирование генов свиньи с помощью гибридных клеточных
линий, содержащих хромосомы 2, 5 и 8 свиньи
3.3.2. Картирование у свиньи генов из синтенной группы,
локализованной на хромосоме человека
3.3.2.1. Картирование генов ТКI и МРН2 с использованием
биохимических маркеров
3.3.2.2. Картирование генов 1, , А и 2 с
помощью клонированных проб
3.3.2.3. Картирование генов 1, 1, , 1, Р4НВ,
4, I 1, , 1, I, 2, 5, и
1 с помощью ПЦР анализа со специфическими праймерами
3.3.2.3.1. Тестирование праймеров разного типа
3.3.2.3.2. Хромосомное и региональное картирование генов с помощью
гибридов соматических клеток
3.3.3. Определение порядка генов , 1, 4, ТОР2А,
5, 1, МРО, МСР1, 1 с помощью радиационной панели всего генома I
3.3.4. Сравнение порядка генов в хромосоме свиньи с порядком
генов в районах хромосомной гомеологии других видов млекопитающих
3.4. Изучение структуры хромосомы свиньи с помощью
гетерологичных региональных микробиблиотек
3.4.1. Структу ра консервативного района, представленного в геноме
человека хромосомой , в геномах других видов млекопитающих
3.5 Радиационное картирование р плеча хромосомы 2 свиньи
3.5.1. Получение и характеристика радиационной панели
3.5.1.1. Характеристика панели с помощью маркеров
3.5.2. Цитогенетическая характеристика панели
3.5.3. Радиационная карта короткого плеча хромосомы 2 свиньи
3.5.3.1. Порядок микросателлитов
3.5.3.2. Порядок генов , 1, , РТН и С 1
3.5.4. Сравнение полученной радиационной карты р плеча хромосомы 2 и радиационных геномных карт этого района
3.5.5. Итоговая карга короткого плеча хромосомы 2 свиньи
3.5.6. Сравнение структуры р плеча хромосомы 2 и гомеологичного
ему района в геноме человека
ЗАКЛЮЧЕНИЕ
СПИСОК ЛИТЕРАТУРЫ
СПИСОК СОКРАЩЕНИЙ
5БДУ 5бромдезоксиуридин
ГАТ селективная среда Игла с добавлением тимидина, гипоксантина и
аминоптерина
п.н. пара нуклеотидов
ГТЦР полимеразная цепная реакция
т.п.н. тысяча пар нуклеотидов
ФГА фитогемаагглютинин
ВАС искусственная бактериальная хромосома
уникальные эволюционноконсервативные последовательности сМ сантиморган сантиРей
короткие уникальные транскрибируемые последовательности ДНК 1 флуоресцентная i i гибридизация локус количественного признака
полиморфные фрагменты ДНК, выявляющиеся после амплификации
ДНК вида со случайными короткими праймерами
рестрикционный полиморфизм по длинам фрагментов ДНК
1 короткие повторенные последовательности ДНК
минимальные эволюционноконсервативные районы
короткие уникальные последовательности ДНК
праймеры, созданные для амплификации ортологичных генов
ПЦР Г1ЦР с выроженным праймером, предобработанным
топоизомеразой
У АС искусственная дрожжевая хромосома
Названия картированных в работе генов по I .ii.v, кодирующих
2 адренергический рецептор, бета 2 цепь 1 адренергический рецептор, киназа 1 1 ген рака груди первого типа 1 кальпаин
1 кристаллин, бета А
1 рецептор колониестимулирующего фактора
2 колониестимулирующий фактор
3 енолаза 1 енолазаЗ
2 онкогенный нейробластомный гомолог
эс гераза Д
4 рецептор 4 ростового фактора фибробластов II фолликулостимулирующий гормон, бета цепь гастрин
I глюкозо6фосфат изомераза
1 глутамат оксалоацетат трансаминаза, растворимая
НЕХВ ген болезни Сандхофа, гексоаминидаза Б
НК1 гексокиназа
1 ядерная РНК геликаза
НЗ гистон, семейство ЗБ
лактатдегидрогеназа А лактатдегидрогеназа Б
I 1 ген синдрома МиллераДикера
МСР1 белок хемотаксиса моноцитов,
, рецептор альдостероне
МРО мислопероксидаза
4 миозин, легкая цепь
1 3 миогенный фактор
1 нейрофиброматоз 1 типа
нуклсозидфосфорилаза
1 пропротеинконвертаза, тип
РР пирофосфатаза, неорганическая
протеинкиназа С, альфа цепь
РТН паратериоидный гормон
Р4НВ проколлагенпролин, 2оксаглутарат4дигоксигеназа, бета субъединица гомолог гена репарации у дрожжей рецептор рстиноевой кисто гы. альфа цепь 5 переносчик сигнала и активатор транскрипции 5Б
ТНЯА1 рецептор тирсоидного гормона, альфа 1 цепь
ТК1 тимидинкиназа 1, расворимая
ТОР2А ДНК тоиоизомсраза
иМРН2 уринин 5монофосфат гидролаза
ВВЕДЕНИЕ
Актуальность


Электронномикроскопическое исследование слияния соматических клеток млекопитающих под действием полиэтилен гликоля ПЭГЦитология. Керкис А. Ю., Жданова Н. С. Электронномикроскопический анализ процесса гибридизации соматических клеток под действием полиэтиленгликоля Тезисы международного генетического конгресса. М. . Жданова Н. С., Урженко А. В., Градов А. А. Клональная культура клеток американской норки vi устойчивая к 5бромдезоксиуридину Успехи теоретической и прикладной генетики. Новосибирск. Жданова Н. С., Урженко А. В., Градов А. А. Получение и хромосомный анализ устойчивых к 5бромдезоксиуридину клеток клональной культуры американской норки vi Н Цитология. Т С. Жданова Н. С., Градов А. А., Рубцов Н. Б., Серов . Субхромосомное картирование восьми генов на 2й хромосоме американской норки vi Н ДАН СССР. Т.0. I., , v , i i i i vi ii I i i ii i . V . Матяхина Л. Д., Жданова , Матвеева , Сукоян М. А., Жданова II. С., Пак С. Д. Использование метода гибридизации i i для выявления хромосомного материала в гибридных и трансформированных клонах Известия СО АН СССР. Т.2. С. . V.5. Жданова , Пак С. Д., Астахова Н. М., Матяхина Л. Д., Серов О. Л. Линия клеток китайского хомячка с хромосомой человека Генетика. V . Астахова , Жданова Н С. Картирование генома свиньи с помощью клеточных гибридов Генетика. Астахова Н. М., Жданова Н. С., Кафтановская Е. М., Кузнецов С. Б., Серов О. Л. Предварительная локализация генов ТК1 и 2 на хромосому свиньи Генетика. I 2 i i i. I 2 i . V.5. X 1 i . V.5. V., , v. V.7. V., v , v . Ivv . V., i , v , i ii i 1 i i i i i i. V . V . V . Рубцов Н. Б., Плюснина . В., Сердюкова Н. В., Астахова Н. М., Кузнецов С. Б., Жданова Н. С. Новые возможности анализа сложных хромосомных перестроек в клеточных гибридах Генетика. I.V. V . I.V. Ivv . V., v , ix . V.9. Ivv . V . Кузнецов С. Б., Ларкин Д. М., Кафтановская Е. В., Иванова Е. В., Астахова Н. М., Черяукене О. В., Жданова Н. С. Хромосомная локализация и анализ синтении у свиньи, крупного рогатого скота и овцы i Генетика . Т С. V . Жданова , Иванова , Кузнецов С. Б., Аксенович Т. И., Свищова Г. Астахова Н. М. Картирование хромосомы свиньи 2 съезд Вавиловского общества генетиков и селекционеров. Тезисы докладов. Т.2. V., v , i . III i i ii i VI5 . Т., i Т. V., . Т., . I, i i , I ii ii iii i. Ларкин Д. М., Кузнецов С. Б , Астахова Н. М., Жданова Н. С. Использование ПЦРмаркеров для картирования хромосомы свиньи Генетика . Иванова Е. В., Королева И. В., Кузнецов С Б. Аксенович Т. И., Свищева Г. Р., Мальченко С. Н., Бендиксен К. Жданова Н. С. Радиационная карта коротког о плеча хромосомы 2 свиньи Генетика. Жданова Н. С. Радиационное картирование геномов. Настоящее и будущее Генетика. Объем и структура работы. Работа иллюстрирована таблицами и рисунками. Фактический материал получен автором лично, а также в ходе работ с сотрудниками Института цитологии и генетики СО РАН. Работа выполнена в лаборатории генетических основ онтогенеза Института цитологии и генетики СО РАН, и в разные периоды была поддержана отечественными и зарубежными грантами Приоритетные направления генетики в г. РФФИ 1а, 5, 9 а также грантом i iii i i в г. Проект РФФИ 5 был отмечен среди лучших за период г. Вестник РФФИ 3 , . Кроме того, работа была поддержана грантами , . Министерства науки России в поддержку международных проектов в г. Конкурса между народа ых научных проектов СО РАН в г. Автор выражает благодарность заведующему лабораторией генетических основ онтогенеза д. Серову . I. за предоставленную возможность и помощь в выполнении данной работы. Автор выражает крайнюю признательность сотрудникам лаборатории генетических основ онтогенеза, сотрудникам Института цитологии и генетики СО РАН Рубцову Николаю Ьорисовичу, Графодатскому Александру Сергеевичу, Аксенович Татьяне Иосифовне, Свищевой Гульнаре Рустамовне, Горелову Ивану Григорьевичу, а также Христиану Бендиксену, Иребену Томсену и Люцу Шулеру, которые на разных этапах исследования принимали участие либо в выполнении ряда экспериментов, либо обсуждении полученных данных, что отражено в совместных публикациях.

Рекомендуемые диссертации данного раздела

28.06.2016

+ 100 бесплатных диссертаций

Дорогие друзья, в раздел "Бесплатные диссертации" добавлено 100 новых диссертаций. Желаем новых научных ...

15.02.2015

Добавлено 41611 диссертаций РГБ

В каталог сайта http://new-disser.ru добавлено новые диссертации РГБ 2013-2014 года. Желаем новых научных ...


Все новости

Время генерации: 0.187, запросов: 145