Сравнительное исследование эволюционных историй букетов видов байкальских беспозвоночных

Сравнительное исследование эволюционных историй букетов видов байкальских беспозвоночных

Автор: Щербаков, Дмитрий Юрьевич

Шифр специальности: 03.00.08

Научная степень: Докторская

Год защиты: 2003

Место защиты: Иркутск

Количество страниц: 216 с. ил

Артикул: 3296135

Автор: Щербаков, Дмитрий Юрьевич

Стоимость: 250 руб.



Наиболее точные и надежные оценки темпов эволюции мтДНК животных получены для гена В млекопитающих Ii . В обоих исследованиях авторы имели довольно редкую возможность опираться на обширную, а в последнем случае, практически, полную палеонтологическую летопись изучаемых организмов. Дивергентные скорости накопления трансверсий в третьей позиции кодонов в гене млекопитающих и моллюсков близко совпадают друг с другом 0. В обоих случаях обнаружено, что период линейного накопления трансверсий составляет не менее млн. В работе по млекопитающим Ii . Ген наиболее часто использовался в качестве маркера в молекулярнофилогенетических исследованиях, в основном, благодаря тому, что подбор праймеров, обеспечивающих его амплификацию в ПЦР, не представлял сложности для большинства форм позвоночных животных. Проблема поиска универсальных праймеров для беспозвоночных животных долгое время служила сдерживающим фактором в широком применении молекулярнофилогенетического подхода в изучении их эволюции до тех пор, пока такие праймеры не были найдены для фрагмента гена СО I . Ген СО I, кодирующий первую субъединицу цитохром С оксидазы, считается самым эволюционно консервативным во всем митохондриальном геноме Минченко, Дударева, , , Vv . Эта его особенность делает возможным изучение филогении очень далеких таксонов, в то же время, наблюдаемое количество синонимичных замен достаточно для проведения исследований и на межвидовом, и даже, на популяционном уровне . Число эволюционных работ на беспозвоночных животных с использованием последовательностей гена СО I в последние годы стремительно возрастает . Следовательно, этот маркер можно рассматривать как наиболее перспективный для филогенетических исследований, поскольку потенциальных возможностей для сравнительного исследования его эволюции в разных группах беспозвоночных существенно больше, чем для других митохондриальных генов. Поэтому, для обнаружения таких событий используют попарное сравнение современных последовательностей ДНК происшедших от общей предковой молекулы. Таким образом, проблема количественной оценки различий между двумя нуклеотидными последовательностями является одной из важнейших при изучении молекулярной эволюции. Именно на этой основе делаются заключения о скоростях эволюции и временах дивергенции, во многих методах филогенетической реконструкции используется матрица генетических расстояний. Для описания процесса замены нуклеотидов предложено множество теоретических моделей, основное отличие которых между собой состоит в количестве учитываемых параметров, определяющих вероятность перехода от одного состояния нуклеотида к другому. Матрица переходных вероятностей, содержащая значения вероятности замены каждого из четырех нуклеотидов состоит из элементов 4x4. Она должна отвечать следующим условиям 1 все элементы матрицы имеют положительные значения и 2 их сумма в каждом ряду равна единице. Первая и наиболее простая схема процесса нуклеотидных замен была предложена Джуксом и Кантором , . Она предполагает, что замена любого одного нуклеотида на другой равновероятна. Эта вероятность и является единственным учитываемым фактором, поэтому данную модель называют однопараметровой. Чтобы сделать ее более реалистичной, Кимура i, предложил двухпараметровую модель, предполагающую, что трансверсии и транзиции происходят с разной вероятностью. Наиболее простой путь оценки степени дивергенции двух последовательностей ДНК состоит в вычислении доли сайтов, по которым они различаются. Однако, полинуклеотиды состоят из оснований всего лишь четырех типов и, в процессе эволюции довольно часто происходят такие события как множественные, обратные и параллельные замены нуклеотидов, искажающее влияние которых необходимо учитывать при расчете истинных эволюционных дистанций. Именно в этом состоит смысл разработки различных моделей эволюции. Обычно, дистанцию между двумя последовательностями выражают через число нуклеотидных замен на сайт Я, а не через общее количество замен, что позволяет сравнивать последовательности разной длины. ДНК. Ы .

Рекомендуемые диссертации данного раздела

28.06.2016

+ 100 бесплатных диссертаций

Дорогие друзья, в раздел "Бесплатные диссертации" добавлено 100 новых диссертаций. Желаем новых научных ...

15.02.2015

Добавлено 41611 диссертаций РГБ

В каталог сайта http://new-disser.ru добавлено новые диссертации РГБ 2013-2014 года. Желаем новых научных ...


Все новости

Время генерации: 0.170, запросов: 145