Идентификация белков, взаимодействующих с пероксиредоксином 6

Идентификация белков, взаимодействующих с пероксиредоксином 6

Автор: Буданова, Евгения Николаевна

Шифр специальности: 03.00.04

Научная степень: Кандидатская

Год защиты: 2007

Место защиты: Пущино

Количество страниц: 124 с., ил.

Артикул: 3325705

Автор: Буданова, Евгения Николаевна

Стоимость: 250 руб.



Временные белокбелковые взаимодействия также задействованы в сборке транскрипционных комплексов, в транспорте белков через мембраны, в фолдинге нативных белков, катализируемом шаперонами, в отдельных этапах трансляции, а также в распаде и реорганизации субклеточных структур в процессе клеточного цикла микротрубочки цитоплазмы, веретена деления, мембраны ядра и комплекса ядерной поры. Временные комплексы намного труднее изучать, так как сначала следует идентифицировать белки а затем и условия, ответственные за временные взаимодействия ii Е. М., i . Огромное число ферментов, транспортных и опорных белков, факторов регуляции транскипции функционируют в клетке в виде гомоолигомеров. Ассоциация нековалентно взаимодействующих белков на уровне четвертичной структуры обеспечивает некоторые преимущества в регуляции активности подобных белков С. Силы, участвующие в белокбелковом взаимодействии. Стерическис, гидрофобные, электростатические взаимодействия и водородные связи главные факторы, ответственные за белокбелковое взаимодействие. Структурная комплиментарность. Анализ белковых контактов показал, что их поверхности хорошо дополняют друг друга. Степень соответствия зависит от типа белкового взаимодействия. Постоянные комплексы имеют самое высокое соответствие, а временные комплексы обладают более низким соответствием . Гидрофобное взаимодействие. Гидрофобные силы вносят большой вклад в белокбелковые взаимодействия i . Это объясняется тем фактом, что белковые компоненты постоянных комплексов обычно существуют в длительном тесном взаимодействии, и гидрофобные силы более предпочтительны для этой цели, тогда как временные комплексы формируются в водной среде на непродолжительное время, и это делает энергетически невыгодным высокую гидрофобность их поверхностей. Однако временные комплексы мембранных белков в отличие от водорастворимых белков, обусловлены гидрофобным взаимодействием. Гидрофобное взаимодействие часто рассматривается как главная движущая сила стабилизации белокбелкового комплекса, однако в возникновении комплекса вклад этих взаимодействий незначителен. Электростатические силы и заряды. Электростатическое взаимодействие сила, участвующая в белокбелковом взаимодействии. Первоначально считалось, что заряды на взаимодействующих поверхностях расположены комплиментарно друг другу однако современная точка зрения предполагает электростатическое соответствие межбелковых поверхностей . Сильное электростатическое взаимодействие может ускорять формирование сложного белкового контакта. Так как электростатические силы являются дальнодействующими, они могут определять правильное пространственное расположение контактирующих белков это увеличивает эффективность формирования сложного комплекса. Электростатическое взаимодействие также может определять продолжительность жизни комплексов v . I., Ivv , . Водородные связи. Исследования трехмерных структур белковых комплексов показали, что число водородных связей не является постоянным. Среднее число водородных связей пропорционально площади поверхности контакта, приблизительно связей на контакт X . Водородные связи образуются преимущественно между азотом и кислородом. Однако водородные связи в области белкового контакта обычно ориентированы не оптимально, поэтому они вносят небольшой вклад в общую энергию взаимодействия. Некоторые водородные связи образованы между поверхностью белка, участвующей в контакте, и молекулами воды, расположенными около нее. Так как молекулы воды образуют более одной водородной связи, они могут взаимодействовать с группировкой белка и с другими молекулами воды, формируя водную сеть в области белокбелкового контакта X . Вода в области контакта. Молекулы воды часто присутствуют в белковых комплексах, окружая контактирующие поверхности или погружаясь в них. Молекулы воды в белковых комплексах стабилизируют их, образуя дополнительные связи, взаимодействуя с заряженными группами и увеличивая их комплиментарность , . X . Конформация. В большинстве работ отмечаются различные структурные изменения при формировании белковых комплексов, называемые эффектом индуцированного соответствия i I. В процессе формирования комплекса, белки взаимно стимулируют изменения в своих пространственных структурах, которые необходимы для оптимального взаимодействия.

Рекомендуемые диссертации данного раздела

28.06.2016

+ 100 бесплатных диссертаций

Дорогие друзья, в раздел "Бесплатные диссертации" добавлено 100 новых диссертаций. Желаем новых научных ...

15.02.2015

Добавлено 41611 диссертаций РГБ

В каталог сайта http://new-disser.ru добавлено новые диссертации РГБ 2013-2014 года. Желаем новых научных ...


Все новости

Время генерации: 0.435, запросов: 145