Новый TRITHORAX-ассоциированный регуляторный элемент в промоторной области гена fork head в Drosophila melanogaster

Новый TRITHORAX-ассоциированный регуляторный элемент в промоторной области гена fork head в Drosophila melanogaster

Автор: Ряховский, Алексей Алексеевич

Автор: Ряховский, Алексей Алексеевич

Шифр специальности: 03.00.03

Научная степень: Кандидатская

Год защиты: 2007

Место защиты: Москва

Количество страниц: 126 с. ил.

Артикул: 3404691

Стоимость: 250 руб.

1. Обзор литературы
1.1. Гипотеза гистонового кода
1.1.1. Ацетил ирование
1.1.2. Фосфорилирование
1.1.3. Метилирование аргинина
1.1.4. Метилирование лизина
1.1.5. Убиквитинилирование
1.2. Поддержание тканеспецифической экспрессии генов белками групп триторакса и поликомба
1.2.1. Функции и энзиматические активности белков групп поликомба и триторакса
1.2.1.1. Белки группы поликомба и их биохимические активности
1.2.1.2. Белки группы триторакса и их биохимические активности
1.2.2. Регуляторные хромосомные элементы, посредством которых осуществляют свою функцию белки групп поликомба и триторакса
1.2.2.1. Особенности строения РРЕТЯЕ
1.2.2.2. Установление транскрипционной памяти
1.2.2.3. Сохранение информации о транскрипционном статусе. Роль гистонового
кода в этом процессе
1.2.2.4. Переключение транскрипционного статуса гомеотических генов
1.2.3. Механизмы действия системы поддержания транскрипционной памяти
1.2.3.1. Распространение сигнала вдоль хроматина или выпетливание
1.2.3.2. Роль некодирующей РНК в функционировании РсОТгхСзависимой системы регуляции активности генов
1.2.4. МЬЬассоциированная система поддержания тканеспецифической транскрипции генов млекопитающих
1.2.4.1. Функции М1Х гомолога 1гх млекопитающих
1.2.4.2. МИЛ и его связь с канцерогенезом
Постановка задачи
2. Материалы и методы
2.1. Материалы
2.1.1. Используемое оборудование
2.1.2. Реактивы
2.1.3. Стоковые растворы.
2.1.4. Антитела.
2.1.5. Используемые ферменты
2.1.6. Фирменные наборы реактивов
2.1.7. Используемые в работе праймеры
. Методы
2.2.1. Энзиматические реакции
2.2.2. Стандартные методы
2.2.3. Выделение ДНК плазмид методом щелочного лизиса.
2.2.4. Выделение геномной ДНК из мух П.
2.2.5. Выделение слюнных желез из личинок Я
2.2.6. Формальдегидная сшивка
2.2.7. Иммунопреципитация хроматина
2.2.8. Лигирование ДНК с адаптерами
2.2.9. Амплификация с праймерами к адаптерам
2.2 Перекрстная и гибридизация
2.2 Саузерн блотгибридизация
2.2 ПЦР с радиоактивной меткой
2.2 Молекулярное клонирование.
2.2 Генетические методы
2.2 Получение конструкции ii
2.2 Определение положения конструкции в геноме методом инвертированного ПЦР
2.2 Иммунное окрашивание политенных хромосом
2.2 ПЦР в реальном времени
2.2 Выделение из слюнных желез личинок .
3. Результаты исследований.
3.1. Иммунопреципитационное картирование Xассоциированных элементов хроматина в промоторной области гена в клетках слюнных желз .
3.1.1. Выявление участков хроматина, непосредственно взаимодействующих с X
3.1.2. Иммуннопреципитания с антителами к 1 и X выявляет схожие районы обогащения
3.2. Исследование функциональной значимости гипотетических i viv при помощи трансгенных конструкций
3.2.1. Траисгенной конструкции ii, включающей энхансер слюнных желз, гипотетические и район промотора, достаточно для связывания X i viv
3.2.2. Фрагмент принципиально важен для связывания X i viv
3.2.3. Фрагмент принципиально важен для поддержания высокого уровня транскрипции трансгенной РНК ii
3.3. Анализ распределения модифицированных гистонов в промоторной области гена
3.4. Демонстрация колокализации с элементами хроматина, ассоциированными со структурами ядерного скелета.
3.4.1. Положение локального пика фракции обогащения в расширенной промоторной области нега совпадает с положением выявленного гена
3.4.2. Положение локального пика обогащения в фракции совпадает с положением гена x
4. Обсуждение результатов.
5. Выводы
6. Список литературы
СПИСОК СОКРАЩЕНИЙ
i i, острая лимфобластная лейкемия
i, острая миеломная лейкемия
i x комплекс гомеотических генов у i
ген i
X ix x комплекс гомеотических генов у i
1 i 1, фактор сборки хроматина 1 i А, центромерный белок
I1 ii ii x i, хроматинассоциированный комплекс умолкания гомеотических генов СММ , клеточный модуль памяти I 4,6диамидино2фенилиндол
цитозинДНКметилтрансфераза
ген
i , рецептор эпидермального фактора роста продукт гена x x i, подобный белок
I флуоресцентная гибридизация i i i i iii
, белок фактор связывает мотив
ii , основные транскрипционные факторы
3 остаток лизина в гистоне НЗ
НЗКтеЗ триметилированный остаток лизина в гистоне НЗ
НЗК4 остаток лизина 4 в гистоне НЗ
НЗК4теЗ триметилированный остаток лизина 4 в гистоне НЗ
i , гистон ацетилтрансфераза
i , гистон деацетилтрансфераза
НМТ i , Гистон метилтрансфераза
1 i i 1, гетерохроматиновый белок
X, X 1, 1 ix, белок человека, гомолог дрозофилиного белка триторакс
сайт i iiv i, высокочувствительный сайт к действию ДНКазы
i ii, подбрюшной название сегментов эмбриона .
АТ Фаденозинтрнфосфат i , регуляторные элементы, необходимые для поддержания
правильного уровня экспрессии гена в данном типе клеток.
i , фактор ремоделирования и деацетилирования пуклеосом.
i , ядерный фактор рсмоделирования
продукта гена
, группа Поликомба
i, поликомбподобный белок
V ii vii, эффект варьирования активности трансгена в
зависимости от места его встраивания в геном, эффект положения продукт гена i
i, название консервативного в эволюции белкового домена
О продукт гена ii
x, репрессорный комплекс
1 x 1, репрессирующий комплекс поликомба 1 комплекс 1, содержащий белки группы поликомба 2 x 2, репрессирующий комплекс поликомба 2 комплекс 2, содержащий белки группы поликомба , регуляторный элемент, необходимый для функционирования продуктов генов группы поликомба i , аргининметилтрасфераза
продукт гена i x
белок i
i i, белок ретинобластомы
участок прикрепления к ядерному скаффолдуматриксу ix
i
5 x, комплекс, обладающий адетилирующей активностью и содержащий белки , и 5 i ii, аденозин метионин v vii , Супрессор эффекта вариегации 2 2, супрессор белка
1 ix x 1, триторакссодержащий комплекс, способный
ацетилировать гистоны i , ТВРассоциированный фактор
ТВР ТАТА ii i, ТАТАсвязывающий белок
ii , транскрипционный фактор
ix i , регуляторный элемент, необходимый для функционирования продуктов генов группы триторакса i продукт гена ixi, триторакс подобный белок
X Триторакс, продукт гена ix
x ix , группа триторакса
x ix, название гена
X i iiii, метод иммуннопреципитации хроматина
Да дальтон
п.н. пары нуклеотидов
ПЦР полимеразная цепная реакция
т.п.н. тысяч пар нуклеотидов
ВВЕДЕНИЕ


Сохранение информации о транскрипционном статусе. Стоковые растворы. Антитела. Выделение ДНК плазмид методом щелочного лизиса. Выделение геномной ДНК из мух П. Молекулярное клонирование. Выделение из слюнных желез личинок . Результаты исследований. Иммунопреципитационное картирование Xассоциированных элементов хроматина в промоторной области гена в клетках слюнных желз . Анализ распределения модифицированных гистонов в промоторной области гена
3. Демонстрация колокализации с элементами хроматина, ассоциированными со структурами ядерного скелета. Обсуждение результатов. Недавние исследования на дрозофиле и млекопитающих убедительно продемонстрировали, что продукты двух групп генов, позитивные регуляторы группы триторакса x и негативные регуляторы группы поликомба , являются ключевыми компонентами запрограммированного в геноме механизма поддержания дифференцированного состояния клеток i . Эти белки предотвращают изменения транскрипционной программы, характерной для данного типа клеток, через взаимодействие со специфическими регуляторными цисэлементами, называемыми ix . Предполагается, что наличие характерно для очень многих, если не всех, регуляторных генов, связанных с процессом дифференцировки. Эти элементы отвечают за поддержание экспрессионного статуса конкретного генамишени, хотя иногда они могут находиться достаточно далеко от его промоторной области. Изучение принципиальных особенностей самих , деталей механизма их узнавания белковыми комплексами и последующего распространения специфического воздействия на экспрессию гена является крайне актуальной задачей для ученых, работающих в самых различных областях биологии и медицины от изучения структуры и функционирования генома, исследования механизмов поддержания плюрипотентности стволовых клеток и клеточной дифференцировки до выявления причин различных нарушений, ведущих к серьезным заболеваниям, таким как, например, раковые заболевания. Об актуальности данной тематики говорит также заметное увеличение в последние годы количества публикаций, посвящнных этой проблеме. Практически для всех генов и x дрозофилы существуют гомологичные гены у млекопитающих, мутации в которых либо критичны для развития организма, либо напрямую ассоциированы с возникновением рака. Предполагается, что и в данном гене в значительной степени колокализуются и функционируют взаимоисключающе, в зависимости от типа клетки. Однако, при более тонком картировании было показано, что эти элементы не идентичны. Так, в дистальной промоторной области гена x дрозофилы удалось разделить последовательности субэлементов, необходимых для формирования , от расположенных пососедству субэлементов ii . Подобные работы с акцентом на исследование именно довольно редки, несмотря на их актуальность. Таким образом, ввиду недостатка информации, трудно выявить общие черты и, соответсвенно, лучше понять принципы их функционирования, которые до сих пор остаются невыясненными. С целью более точно локализовать и охарактеризовать ещ один новый и была предпринята данная работа.

Рекомендуемые диссертации данного раздела

28.06.2016

+ 100 бесплатных диссертаций

Дорогие друзья, в раздел "Бесплатные диссертации" добавлено 100 новых диссертаций. Желаем новых научных ...

15.02.2015

Добавлено 41611 диссертаций РГБ

В каталог сайта http://new-disser.ru добавлено новые диссертации РГБ 2013-2014 года. Желаем новых научных ...


Все новости

Время генерации: 0.198, запросов: 145