Канонические и неканонические последовательности эндогенного ретровируса МДГ4 (gypsy) в геноме дрозофилы

Канонические и неканонические последовательности эндогенного ретровируса МДГ4 (gypsy) в геноме дрозофилы

Автор: Котнова, Алина Петровна

Шифр специальности: 03.00.03

Научная степень: Кандидатская

Год защиты: 2005

Место защиты: Москва

Количество страниц: 112 с. ил.

Артикул: 2771239

Автор: Котнова, Алина Петровна

Стоимость: 250 руб.



Подобно ретровирусам, он содержит три открытые рамки считывания ОРС, а цикл его транспозиции проходит через стадию обратной транскрипции iv . Несмотря на то, что эндогенные ретровирусы являются предметом пристального внимания исследователей, в настоящий момент очень мало известно об их генетическом взаимодействии с организмомхозяином. Это обусловлено тем, что обычно в роли хозяина выступают позвоночные трудные объекты для генетического анализа. Присутствие рстротранспозона МДГ4 в геноме классического модельного объекта . Спонтанные транспозиции мобильных элементов происходят чрезвычайно редко с частотой примерно 6, но в некоторых системах перемещения наблюдаются с повышенной частотой. Эти линии служат удобной моделью для изучения регуляции транспозиций МГЭ. Одной из таких линий является линия . ЮМО4 частотой спонтанного мутирования, нестабильным характером мутаций и активными, независимыми друг от друга транспозициями двух МГЭ МДГ4 и i , i, v, . Мутаторная линия i ведт сво происхождение от стабильной лабораторной линии i. Молекулярный анализ структурной организации МДГ4, клонированных из геномов мух линий и , выявил существование двух подсемейств этого ретротраиспозона, имеющих чткие структурные различия и отличающихся друг от друга способностью к перемещениям i , . Эти подсемейства получили названия активное и неактивное. Названия носят условный характер, так как сравнение ретротранспозиционной активности подсемейств в культуре клеток . Смирнова и др. Однако МДГ4, обозначенный как активный, способен к транспозиции в определенных линиях . Активный и неактивный варианты МДГ4 различаются на уровне рсстриктных карт. В частности, наличие сайтов i , и является характерной особенностью активного подсемейства i , . По всей видимости, активный вариант МДГ4 является эволюционно более молодым и образовался в результате постепенного накопления точечных мутаций, затрагивающих неактивный вариант Разоренова и др. Предполагается, что первым появился рестрикционный сайт Ми1, затем и, наконец, i. Такая последовательность событий подтверждается результатами рестрикционного анализа геномной ДНК исследованных линий мух. Исключением является линия Г. В этой линии присутствуют варианты МДГ4, которые содержат сайт i, но не содержат сайтов иили Разоренова и др. Известно, что все копии МДГ4, клонированные из систем инсерционного мутагенеза, содержали в кодирующей части сайт рестрикции i , что позволило рассматривать его как маркер на принадлежность к активному подсемейству. В то же время, было показано, что участок, влияющий на ретротранспозиционную активность, расположен между сайтами рестрикции v и . Замещения этого участка в неактивном варианте соответствующим участком из активного достаточно для повышения ретротранспозиционной активности такого варианта МДГ4 в культуре клеток, несмотря на отсутствие у такой копии сайта рестрикции i Любомирская и др. Таким образом, присутствие необычных копий в линии Г вызывает особый интерес. Можно предположить, что они образовались в результате рекомбинационных процессов, затрагивающих активный и неактивный варианты, однако нельзя исключать вероятность того, что они относятся к новому, ранее неизвестному подсемейству МДГ4 . Целью данной работы явилось изучение струюурных особенностей различных вариантов ретротранспозона . МДГ4 в геноме линии Г. Данное исследование было предпринято в рамках изучения возможных механизмов эволюции ретротранспозона МДГ4. Клонировать ДНК из линии Г . Провести скрининг геномной библиотеки линии Г и отобрать клоны, имеющие гомологию с последовательностью МДГ4 . Используя метод Саузернблот гибридизации, провести предварительный анализ выявленных клонов на предмет их соответствия различным областям МДГ4 . Провести детальный структурный анализ клонов, содержащих полноразмерный МДГ4 , включая ссквенированис функционально значимых участков. Провести рестрикционный анализ клонов, содержащих последовательности, существенно отличающиеся от канонических. Исследовать представленность в геноме дрозофилы неканонических полноразмерных ретротранспозонов, имеющих существенную гомологию с последовательностью МДГ4 .

Рекомендуемые диссертации данного раздела

28.06.2016

+ 100 бесплатных диссертаций

Дорогие друзья, в раздел "Бесплатные диссертации" добавлено 100 новых диссертаций. Желаем новых научных ...

15.02.2015

Добавлено 41611 диссертаций РГБ

В каталог сайта http://new-disser.ru добавлено новые диссертации РГБ 2013-2014 года. Желаем новых научных ...


Все новости

Время генерации: 0.199, запросов: 145