Анализ геномных последовательностей: автоматическая классификация белков и определение функциональной роли альтернативного сплайсинга

Анализ геномных последовательностей: автоматическая классификация белков и определение функциональной роли альтернативного сплайсинга

Автор: Кривенцева, Евгения Викторовна

Шифр специальности: 03.00.02

Научная степень: Кандидатская

Год защиты: 2002

Место защиты: Москва

Количество страниц: 134 с. ил

Артикул: 2320501

Автор: Кривенцева, Евгения Викторовна

Стоимость: 250 руб.

Анализ геномных последовательностей: автоматическая классификация белков и определение функциональной роли альтернативного сплайсинга  Анализ геномных последовательностей: автоматическая классификация белков и определение функциональной роли альтернативного сплайсинга 



Постоянно спласнруемые экзоны оранжевые, в то время как альтернативно спласнруемые экзоны показаны в красном, а последовательность может быть вырезана как нитрон или оставаться в . Индивидуальные экзоны могут иметь альтернативу 5 Ь или 3 с сайты сплайсинга. В 5 иЗ концах генов, альтернативное сращивание может произойти в сотрудничестве с выбором альтернативных протомеров, показанных как стрелки, или с нолиаделма гнои сайта. Табл. Число белков с соответствующим количеством изоформ для II. Табл. Рис. Для каждой области АС в данном белке, окно, соответсвуюшее длине АС, последовательно просмотривалось со сдвигом на одну аминокислоту по последовательности белка. Табл. Расположение областей АС в белках. Общее количество АС может быть выше чем число выписанных изоформ, так как изоформы могут содержать более одного события
Табл. Распределение длил белковых доменов представленных в различных базах данных. Рис. Табл. Число функциональных и структурных модулей белков домены определнные в I профилях, и базах данных, сигнальные пептиды, трамемембраниые и колдкоил области, которые были удалены полностью, частично или разрушены внутренне альтернативным сплайсингом, а также события АС, которые не затрагивали ни одного из проаннотированных функциональных или структурных модулей. Статистически существенные отклонения от случайного ожидаемог о отмечены. Последний столбец представляет значения теста х Данные показаны отдельно для С. И. i и М. Рис. АС вставляютудаляют домены частично 5 АС вставляютудаляют части нсдоменнмх участков. Рисунок показывает, что АС избегает нарушения функциональных участков. АС влияет на часть короче а. В анализ были включены белки с описанными в базах данных 1 илии I функциональными амнно кислотами. Мы исследовали короткие учаежи АС, поскольку длинные АС события, вероягно, разрушают доменную структуру. Анализ показывает, что АС предпочитает влиять на функциональные остатки . Ожидаемые и наблюдаемые частоты событий АС, которые либо 1 вставляютудаляют полные функциональные элементы, либо 2 не влияют на них. Рис. На рисунке показано отношение наблюдаемых появлений к ожидаемым, при условии равномерного расплелеления АС вдоль белковой последовательности. Табл. Число наблюдений экзонов и границ АС внутри и снаружи белковых доменов. Представлены данные для доменов , и профилей Просайта, чтобы проверить независимость эффекта от точного определения границ доменов. АС рассматривались отдельно. Рисунок . Примеры структурного местоположения областей альтернативно сплайсинга, проаннотнруемых в 1. Область, удаляемая АС в короткой изоформе, является относительно большой и расположена в ядре белка близко к лиганду. Короткая изоформа, как известно, является неактивной. Ь i x идентификатор 4, 1 идентификатор X преобразует серии к глицину и является ключевым ферментом в биосинтезе пуринов, лннилов. Рис. Рис. Случаи АС короче а. Табл. Полученные данные для случаев, где АС удаляет часть доменов. АС вдоль белковой последовательности. Данные представленим параллельно для белковых доменов описанных п базах данных профайлов . I, и , для выборок i и Ошибка Закладка не определена. Табл. Число наблюдений экзонов н границ АС внутри и снаружи белковых доменов. Представлены данные для доменов , и профилей Просайта, чтобы проверить независимость эффекта от точного определения границ доменов. Закладка не определена. Рисунок . Примеры структурного местоположения областей альтернативно сплайсинга, лроаннотируемых в I. Показаны наиболее длинные изоформы, а части, отсутствующие в коротких изоформах окрашены темносиним, xi идентификатор , I идентификатор . Область, удаляемая в короткой изоформе, является относительно большой и расположена в ядре белка близко к лиганду. Короткая изоформа, как известно, является неактивной. Ь i x идентификатор I4, I идентификатор преобразует серии к глишшу и является ключевым ферментом в биосинтезе пуринов, липидов, гормонов, и других компонентов. Закладка не определена. Рис. Ошибка Закладка не определена. Рис. Случаи АС короче а. I.Ошибка Закладка не определена. Табл. Полученные данные для случаев, где АС удаляет часть доменов. Ошибка Закладка не определена.

Рекомендуемые диссертации данного раздела

28.06.2016

+ 100 бесплатных диссертаций

Дорогие друзья, в раздел "Бесплатные диссертации" добавлено 100 новых диссертаций. Желаем новых научных ...

15.02.2015

Добавлено 41611 диссертаций РГБ

В каталог сайта http://new-disser.ru добавлено новые диссертации РГБ 2013-2014 года. Желаем новых научных ...


Все новости

Время генерации: 0.199, запросов: 145