Взаимосвязь структуры и свойств рекомбинантных формиатдегидрогеназ из пекарских дрожжей и метилотрофных бактерий

Взаимосвязь структуры и свойств рекомбинантных формиатдегидрогеназ из пекарских дрожжей и метилотрофных бактерий

Автор: Серов, Александр Евгеньевич

Шифр специальности: 02.00.15

Научная степень: Кандидатская

Год защиты: 2002

Место защиты: Москва

Количество страниц: 153 с.

Артикул: 2318723

Автор: Серов, Александр Евгеньевич

Стоимость: 250 руб.

Взаимосвязь структуры и свойств рекомбинантных формиатдегидрогеназ из пекарских дрожжей и метилотрофных бактерий  Взаимосвязь структуры и свойств рекомбинантных формиатдегидрогеназ из пекарских дрожжей и метилотрофных бактерий 



За исключением специфичных дегидрогеназ 2гидроксикнслот, с другими белками ФДГ показывает низкий уровень гомологии ниже 2. Бактериальные ферменты отличаются от других ФДГ строением концсвой части, что, повидимому, обуславливает разниц в кинетических механизмах действия ФДГ. Дтя ФДГ из бактерий характерна более длинная концевая часть. ФДГ из высших растений имеют перед основной аминокислотной последовательностью несколько дополнительных аминокислот, представляющих собой сигнальный пептид. Было показано , что в клубнях картофеля с помощью этого пептида осуществляется транспорт синтезировавшейся ФДГ в митохондрии. Представляет интерес сравнение разрывов в выравнивании первичных структур ФДГ. За исключением бактериальных ферментов, у всех ФДГ наблюдаются два существенных разрыва в концсвой области в районе и аминокислот и один в Сконцсвой области спираль а9. Следует отметить небольшой разрыв за 4 аминокислотным остатком в ФДГ из бактерии, высших растений и дрожжей vii. Всгавки дополнительных и аминокислот после 4 и 4 остатков присутствуют в ферментах из дрожжей . В районе остатка 6 вновь следует разрыву растительных и бактериальных ФДГ. Исходя из первичной структуры кофсрмснтсвязывающсш домена, вес ФДГ можно разделить на две группы. В первую группу входят ферменты из бактерий и высших растений, вторая группа включает в себя ФДГ из дрожжей и грибов. XXX. У ФДГ из второй группы это расстояние равно рис. Кроме того, в растительных и бактериальных ферментах, за исключением ФДГ из i ЛР и некультивируемого термофильного штамма , за консервативным аспартатом следует аргинин. В ФДГ из дрожжей и рибов в этом положении расположен тирозин. Помимо дополнительной петли в районе 4 аминокислотного остатка, существует ряд других особенностей первичной структуры ФДГ из пекарских дрожжей, привлекающих к этому ферменту особое внимание. Анализ аминокислотной последовательности ФДГ из vii позволяет сделать вывод, что фермент пекарских дрожжей характеризуется повышенной но сравнению с остальными ФДГ гибкостью полипептцдной цепи, в том числе и в районе активного центра. Так, консервативные остатки Рго2 и Рто1 заменены в этой ФДГ на остатки и V, соответственно рис. Пролины в 2 и 1 положениях расположены рядом с каталитически важными остатками ЗЗ и i2 и, возможно, играют существенную роль в их правильной фиксации в активном центре . В связи с повышенной гибкостью также необходимо упомянуть замены и Рго2А1а. Среди прочих особенностей фермента из 5. О. Не содержащий нитронов ген, который кодирует белковый продукт из 5 аминокислот не считая стартового метионина с высокой степенью гомологии к завнсимым формиатдегидрогеназам, обнаружен хромосоме XV генома . Вопервых, щггозин в положении заменен па тимип. В результате вместо кодона ТАС появляется кодон ТАТ. Поскольку обоим кодонам соответствует тирозин, к существенным изменениям эта мутация не приводит. Вовторых, щгтозин в 6 положении также заменен на тимин. Данная мутация приводит к образованию стопкодона ТАЛ из нуклеотидной тройки САА, кодирующей глутамин. Втретьих, после аденнна 9 в XVI хромосоме происходит вставка еще одного аденнна. В 2 положении гена расположен кодон, который открывает новую рамку считывания. В XV хромосоме эта рамка заканчивается стопкодоном ТАА через аминокислот. За счет появления дополнительного нуклеотида в XVI хромосоме стопкодон исчезает. Болес того, в новой рамке считывания восстанавливается исходная аминокислотная последовательность, кодируемая геном 8. Таким образом, в XVI хромосоме пекарских дрожжей ген ФДГ распадается на два квазигена 6 и I. XV хромосомы рис. Маловероятно, что продукты этих генов экспрессируются в . Тем не менее, остается непонятным, какова причина восстановления исходной рамки считывания 8 в гене 5. Вчствсртых, вместо кодона в положениях гена 5 но нумерации 8 расположен кодон . Помимо замены аспарагиновой кислоты на гистидин, эта мутация приводит к появлению в XVI хромосоме дополнительного сайта узнавания эндонуклеазы рестрикции . Также следует отметить, что области, примыкающие к концевым частям генов 8 и 6 и Сконцевым частям генов 8 и 5, практически полностью идентичны.

Рекомендуемые диссертации данного раздела

28.06.2016

+ 100 бесплатных диссертаций

Дорогие друзья, в раздел "Бесплатные диссертации" добавлено 100 новых диссертаций. Желаем новых научных ...

15.02.2015

Добавлено 41611 диссертаций РГБ

В каталог сайта http://new-disser.ru добавлено новые диссертации РГБ 2013-2014 года. Желаем новых научных ...


Все новости

Время генерации: 0.182, запросов: 121